More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0907 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3617  hypothetical protein  76.39 
 
 		 438 aa  683    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.960503  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4012  hypothetical protein  75.52 
 
 		 438 aa  674    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4351  CBS domain-containing protein  75.29 
 
 		 438 aa  680    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1075  hypothetical protein  80.82 
 
 		 443 aa  744    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4131  hypothetical protein  75.75 
 
 		 438 aa  677    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0907  hypothetical protein  100 
 
 		 440 aa  900    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3417  hypothetical protein  72.41 
 
 		 435 aa  655    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0284  hypothetical protein  76.35 
 
 		 441 aa  673    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3937  protein of unknown function DUF21  75.75 
 
 		 438 aa  677    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4034  hypothetical protein  75.75 
 
 		 438 aa  677    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0359  hypothetical protein  74.6 
 
 		 438 aa  676    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3667  hypothetical protein  74.6 
 
 		 438 aa  676    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0353  hypothetical protein  75.29 
 
 		 438 aa  680    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0398  hypothetical protein  70.33 
 
 		 437 aa  632  1e-180  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.596861  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3284  hemolysin, putative  69.2 
 
 		 436 aa  633  1e-180  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0419  hypothetical protein  71.5 
 
 		 435 aa  620  1e-176  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.794488  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  54.23 
 
 		 447 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  54.23 
 
 		 447 aa  498  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  54.23 
 
 		 447 aa  498  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  54.23 
 
 		 447 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  54.23 
 
 		 447 aa  498  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  54.23 
 
 		 447 aa  498  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  54.23 
 
 		 447 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  54.23 
 
 		 447 aa  498  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  54.23 
 
 		 447 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  56.1 
 
 		 443 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  54.59 
 
 		 447 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  54.59 
 
 		 447 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  56.1 
 
 		 443 aa  494  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  54.59 
 
 		 447 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  54.59 
 
 		 447 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  54.59 
 
 		 447 aa  490  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  55.63 
 
 		 447 aa  490  1e-137  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  55.87 
 
 		 443 aa  491  1e-137  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0396  hypothetical protein  53.38 
 
 		 445 aa  488  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0782784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  52.66 
 
 		 441 aa  482  1e-135  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  53.05 
 
 		 444 aa  475  1e-133  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3418  hypothetical protein  54.24 
 
 		 442 aa  475  1e-133  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  53.48 
 
 		 438 aa  471  1.0000000000000001e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0848  hypothetical protein  50.93 
 
 		 438 aa  467  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0777  protein of unknown function DUF21  50.46 
 
 		 438 aa  464  1e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.825818  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3488  protein of unknown function DUF21  51.95 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  50.93 
 
 		 452 aa  458  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  50.59 
 
 		 439 aa  453  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  49.65 
 
 		 482 aa  446  1.0000000000000001e-124  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4210  protein of unknown function DUF21  48.24 
 
 		 427 aa  434  1e-120  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1848  hypothetical protein  46.42 
 
 		 424 aa  419  1e-116  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000139773 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1483  hypothetical protein  50.12 
 
 		 429 aa  420  1e-116  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.234798  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0295  hypothetical protein  48.03 
 
 		 424 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3315  hypothetical protein  48.93 
 
 		 427 aa  418  9.999999999999999e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.284865  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0269  hypothetical protein  47.56 
 
 		 424 aa  412  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  46.41 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2082  protein of unknown function DUF21  45.74 
 
 		 438 aa  388  1e-107  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.690525  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2277  hypothetical protein  45.8 
 
 		 441 aa  387  1e-106  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2476  protein of unknown function DUF21  45.74 
 
 		 438 aa  388  1e-106  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2968  CorC/HlyC family transporters  46.3 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307812  normal  0.518349 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  44.69 
 
 		 443 aa  374  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3159  protein of unknown function DUF21  37.33 
 
 		 445 aa  297  2e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248716  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  33.64 
 
 		 439 aa  263  4e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  32.57 
 
 		 440 aa  259  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  33.49 
 
 		 430 aa  249  5e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  32.24 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  32.08 
 
 		 442 aa  243  5e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  32.22 
 
 		 437 aa  242  9e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  31.06 
 
 		 433 aa  241  1e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  31.6 
 
 		 439 aa  238  2e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  30.9 
 
 		 443 aa  235  1.0000000000000001e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  29.98 
 
 		 456 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  31.55 
 
 		 436 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  29.69 
 
 		 441 aa  233  7.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  31.26 
 
 		 432 aa  232  1e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  29.58 
 
 		 441 aa  231  2e-59  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  29.95 
 
 		 436 aa  231  2e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  30.39 
 
 		 440 aa  229  5e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  30.77 
 
 		 440 aa  229  9e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  29.93 
 
 		 443 aa  228  2e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  31.68 
 
 		 436 aa  227  4e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  29.74 
 
 		 447 aa  226  4e-58  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  30.95 
 
 		 437 aa  226  7e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  30.84 
 
 		 437 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  29.89 
 
 		 441 aa  223  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  29.19 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  29.88 
 
 		 428 aa  221  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  30.3 
 
 		 442 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  30.82 
 
 		 441 aa  221  3e-56  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  30.14 
 
 		 460 aa  219  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  29.59 
 
 		 436 aa  219  1e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  29.31 
 
 		 426 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  29.45 
 
 		 435 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  31.18 
 
 		 447 aa  216  7e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  29.16 
 
 		 438 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  29.41 
 
 		 442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  29.2 
 
 		 430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  29.27 
 
 		 448 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  30.72 
 
 		 445 aa  213  7e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  29.9 
 
 		 433 aa  213  7.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  30.34 
 
 		 452 aa  212  9e-54  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  28.81 
 
 		 458 aa  212  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  29.3 
 
 		 432 aa  209  6e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2388  protein of unknown function DUF21  30.68 
 
 		 442 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.945135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>