More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_2082 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2277  hypothetical protein  85.61 
 
 		 441 aa  754    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2082  protein of unknown function DUF21  100 
 
 		 438 aa  880    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.690525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2476  protein of unknown function DUF21  98.86 
 
 		 438 aa  868    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  63.44 
 
 		 443 aa  551  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  63.44 
 
 		 438 aa  551  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  49.06 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0396  hypothetical protein  48.61 
 
 		 445 aa  432  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0782784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  49.06 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  49.06 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  49.06 
 
 		 447 aa  432  1e-120  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  48.62 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  48.62 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  48.62 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  48.85 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  48.62 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  48.62 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  49.06 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  48.62 
 
 		 447 aa  429  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  48.85 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  48.85 
 
 		 447 aa  431  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  48.62 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  48.62 
 
 		 443 aa  427  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  48.62 
 
 		 443 aa  426  1e-118  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  49.76 
 
 		 482 aa  421  1e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  48.58 
 
 		 452 aa  418  1e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4210  protein of unknown function DUF21  46.93 
 
 		 427 aa  413  1e-114  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  47.7 
 
 		 441 aa  415  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  47.02 
 
 		 447 aa  414  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  48.35 
 
 		 444 aa  410  1e-113  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0777  protein of unknown function DUF21  46.53 
 
 		 438 aa  409  1e-113  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.825818  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3418  hypothetical protein  47.52 
 
 		 442 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0848  hypothetical protein  46.7 
 
 		 438 aa  406  1.0000000000000001e-112  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  48.43 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4351  CBS domain-containing protein  45.75 
 
 		 438 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0284  hypothetical protein  45.97 
 
 		 441 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0334132 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0359  hypothetical protein  45.52 
 
 		 438 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3667  hypothetical protein  45.52 
 
 		 438 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  46.93 
 
 		 439 aa  400  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3417  hypothetical protein  45.2 
 
 		 435 aa  398  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0353  hypothetical protein  46.23 
 
 		 438 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0907  hypothetical protein  45.52 
 
 		 440 aa  397  1e-109  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3488  protein of unknown function DUF21  46.89 
 
 		 432 aa  394  1e-108  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3617  hypothetical protein  45.28 
 
 		 438 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.960503  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3284  hemolysin, putative  45.48 
 
 		 436 aa  388  1e-107  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0398  hypothetical protein  45.2 
 
 		 437 aa  387  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.596861  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4012  hypothetical protein  45.56 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0419  hypothetical protein  45.76 
 
 		 435 aa  387  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.794488  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3937  protein of unknown function DUF21  44.86 
 
 		 438 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4131  hypothetical protein  44.86 
 
 		 438 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4034  hypothetical protein  44.86 
 
 		 438 aa  385  1e-105  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1075  hypothetical protein  43.63 
 
 		 443 aa  380  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.179676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1483  hypothetical protein  42.79 
 
 		 429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.234798  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1848  hypothetical protein  42.96 
 
 		 424 aa  354  2e-96  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000139773 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3315  hypothetical protein  43.1 
 
 		 427 aa  352  7e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.284865  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0295  hypothetical protein  41.18 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.731774 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0269  hypothetical protein  40.94 
 
 		 424 aa  346  5e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2968  CorC/HlyC family transporters  40.95 
 
 		 427 aa  319  7e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307812  normal  0.518349 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3159  protein of unknown function DUF21  41.69 
 
 		 445 aa  317  3e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.248716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  37.21 
 
 		 439 aa  270  4e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  36.05 
 
 		 433 aa  260  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  35.1 
 
 		 442 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  31.87 
 
 		 439 aa  253  3e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 		 436 aa  250  3e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  34.11 
 
 		 437 aa  249  5e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  33.79 
 
 		 432 aa  248  1e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 		 447 aa  243  7e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  33.41 
 
 		 460 aa  239  5e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  32.39 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  33.86 
 
 		 444 aa  236  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  34.72 
 
 		 442 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  31.98 
 
 		 440 aa  236  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  33.49 
 
 		 436 aa  236  6e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  31.96 
 
 		 440 aa  235  1.0000000000000001e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  31.93 
 
 		 443 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  34.17 
 
 		 432 aa  234  3e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  32.33 
 
 		 441 aa  233  4.0000000000000004e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  33.73 
 
 		 433 aa  233  5e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  31.14 
 
 		 456 aa  231  1e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  33.01 
 
 		 417 aa  232  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  32.79 
 
 		 438 aa  230  4e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  32.78 
 
 		 443 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  34.04 
 
 		 436 aa  229  9e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  32.78 
 
 		 443 aa  229  9e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  33.25 
 
 		 442 aa  229  1e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  31.9 
 
 		 441 aa  227  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  35.81 
 
 		 464 aa  227  4e-58  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  32.45 
 
 		 443 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  33.26 
 
 		 441 aa  226  9e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  31.58 
 
 		 430 aa  224  3e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  32.09 
 
 		 426 aa  221  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  31.02 
 
 		 443 aa  220  3e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  32.14 
 
 		 437 aa  219  7e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  28.11 
 
 		 441 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  31.16 
 
 		 436 aa  216  5e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  32.35 
 
 		 447 aa  216  5e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  31.59 
 
 		 428 aa  216  5.9999999999999996e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  32.57 
 
 		 448 aa  216  8e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  32.24 
 
 		 429 aa  214  1.9999999999999998e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  33.25 
 
 		 437 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  30.49 
 
 		 407 aa  211  2e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>