More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2846 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
443 aa  899    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  80.93 
 
 
441 aa  701    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  80.63 
 
 
456 aa  711    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  81.54 
 
 
460 aa  709    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  80.29 
 
 
443 aa  698    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  68.75 
 
 
444 aa  588  1e-167  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  66.97 
 
 
447 aa  585  1e-166  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  64.77 
 
 
438 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  63.78 
 
 
442 aa  576  1.0000000000000001e-163  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  64.06 
 
 
441 aa  551  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  61.38 
 
 
440 aa  548  1e-155  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  61.45 
 
 
436 aa  544  1e-153  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  62.91 
 
 
441 aa  542  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  60.69 
 
 
440 aa  542  1e-153  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  60.92 
 
 
443 aa  534  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  60.89 
 
 
437 aa  525  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  61.05 
 
 
437 aa  522  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  57.24 
 
 
433 aa  508  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  61.74 
 
 
445 aa  499  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  54.04 
 
 
439 aa  496  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  56.21 
 
 
439 aa  486  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  50.23 
 
 
426 aa  429  1e-119  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  48.52 
 
 
448 aa  422  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  49.55 
 
 
442 aa  418  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  52.01 
 
 
437 aa  416  9.999999999999999e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  50 
 
 
428 aa  415  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  47.29 
 
 
437 aa  394  1e-108  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  43.66 
 
 
432 aa  363  2e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  44.37 
 
 
434 aa  364  2e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  45.22 
 
 
437 aa  361  1e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  44.66 
 
 
442 aa  358  9.999999999999999e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  43.3 
 
 
447 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  44.11 
 
 
440 aa  357  1.9999999999999998e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  42.39 
 
 
436 aa  355  1e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  44.81 
 
 
439 aa  350  2e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  44.21 
 
 
436 aa  350  4e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  43.5 
 
 
443 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  43.5 
 
 
443 aa  342  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  41.87 
 
 
432 aa  328  2.0000000000000001e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  42.31 
 
 
435 aa  325  8.000000000000001e-88  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  37.97 
 
 
437 aa  323  3e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  41.9 
 
 
439 aa  322  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  41.22 
 
 
441 aa  317  4e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  40.92 
 
 
439 aa  309  6.999999999999999e-83  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  40.92 
 
 
439 aa  308  1.0000000000000001e-82  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  38.85 
 
 
436 aa  307  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  42.23 
 
 
435 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  42.18 
 
 
452 aa  305  8.000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  36.43 
 
 
441 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  39.47 
 
 
429 aa  301  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  37.56 
 
 
417 aa  301  2e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  39.86 
 
 
464 aa  299  6e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  36.94 
 
 
446 aa  296  6e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  38.93 
 
 
432 aa  291  1e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  38.16 
 
 
465 aa  291  1e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  37.35 
 
 
431 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  39.23 
 
 
452 aa  289  7e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  37.8 
 
 
407 aa  288  2e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  36.89 
 
 
431 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  38.39 
 
 
425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  35.41 
 
 
430 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  36.69 
 
 
447 aa  283  4.0000000000000003e-75  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  37.91 
 
 
430 aa  283  5.000000000000001e-75  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  37.18 
 
 
431 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  35.94 
 
 
466 aa  282  9e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  37.39 
 
 
436 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  38.22 
 
 
479 aa  280  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3215  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  37.41 
 
 
431 aa  278  1e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  36.79 
 
 
424 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  36.17 
 
 
424 aa  278  2e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  37.03 
 
 
428 aa  277  3e-73  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  33.8 
 
 
447 aa  277  3e-73  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  33.88 
 
 
439 aa  276  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  36.77 
 
 
432 aa  276  5e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  38.13 
 
 
433 aa  271  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  34.43 
 
 
425 aa  270  2.9999999999999997e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  34.64 
 
 
453 aa  269  8e-71  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  33.88 
 
 
454 aa  268  1e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  35.36 
 
 
458 aa  268  1e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  36.85 
 
 
436 aa  268  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  36.67 
 
 
432 aa  268  2e-70  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  37.26 
 
 
434 aa  266  4e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  35.68 
 
 
430 aa  264  2e-69  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  32.01 
 
 
444 aa  263  6e-69  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  37.02 
 
 
433 aa  261  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  32.07 
 
 
447 aa  260  3e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  32.56 
 
 
438 aa  259  9e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  30.86 
 
 
443 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  30.86 
 
 
443 aa  258  1e-67  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  30.86 
 
 
443 aa  258  2e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  34.72 
 
 
429 aa  258  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  33.97 
 
 
452 aa  256  7e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  30.98 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  30.98 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  30.98 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  30.98 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  30.98 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  30.98 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  31.36 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  30.98 
 
 
447 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>