More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3199 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  82.23 
 
 		 428 aa  693    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  900    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  69.89 
 
 		 442 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  68.56 
 
 		 437 aa  581  1.0000000000000001e-165  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  66.04 
 
 		 437 aa  549  1e-155  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  57.81 
 
 		 439 aa  504  9.999999999999999e-143  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  57.63 
 
 		 433 aa  493  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  50.12 
 
 		 443 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  50.93 
 
 		 460 aa  427  1e-118  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  48.52 
 
 		 443 aa  422  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  48.97 
 
 		 442 aa  425  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  48.03 
 
 		 441 aa  421  1e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  49.3 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  48.52 
 
 		 441 aa  414  1e-114  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  49.18 
 
 		 437 aa  409  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  49.18 
 
 		 438 aa  410  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  50.11 
 
 		 445 aa  406  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  48.65 
 
 		 447 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  47.61 
 
 		 443 aa  407  1.0000000000000001e-112  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  46.99 
 
 		 456 aa  402  1e-111  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  47.97 
 
 		 444 aa  404  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  46.92 
 
 		 440 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  46.92 
 
 		 440 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  44.87 
 
 		 439 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  48.48 
 
 		 437 aa  401  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  45.67 
 
 		 436 aa  396  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  39.41 
 
 		 426 aa  326  4.0000000000000003e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  41.32 
 
 		 434 aa  324  2e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  38.18 
 
 		 440 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  42.18 
 
 		 437 aa  318  2e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  38.79 
 
 		 447 aa  312  7.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  39.18 
 
 		 441 aa  307  2.0000000000000002e-82  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  40.05 
 
 		 442 aa  301  2e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  38.86 
 
 		 436 aa  298  2e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  40.55 
 
 		 439 aa  296  6e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  40.27 
 
 		 436 aa  294  2e-78  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  39.64 
 
 		 439 aa  292  9e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  39.67 
 
 		 443 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  39.67 
 
 		 443 aa  292  1e-77  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  39.64 
 
 		 439 aa  292  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  39.64 
 
 		 432 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  40.14 
 
 		 435 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  40.27 
 
 		 439 aa  288  1e-76  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  38.86 
 
 		 436 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  40.63 
 
 		 435 aa  284  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  38.89 
 
 		 466 aa  281  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  39.24 
 
 		 452 aa  280  3e-74  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  37.12 
 
 		 417 aa  280  5e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  37.87 
 
 		 446 aa  278  1e-73  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  39.81 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  38.02 
 
 		 464 aa  276  4e-73  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  37.41 
 
 		 424 aa  276  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  37.88 
 
 		 424 aa  276  8e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  37.18 
 
 		 433 aa  276  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  39.13 
 
 		 429 aa  274  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  38.37 
 
 		 436 aa  271  1e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  36.52 
 
 		 407 aa  267  2e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  36.59 
 
 		 465 aa  266  5e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  36.72 
 
 		 432 aa  266  5.999999999999999e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  38.23 
 
 		 479 aa  266  8e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  36.18 
 
 		 437 aa  265  1e-69  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  33.41 
 
 		 441 aa  265  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  36.73 
 
 		 430 aa  263  4e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  41.4 
 
 		 434 aa  261  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  35.21 
 
 		 432 aa  259  8e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  38.72 
 
 		 434 aa  259  9e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  36.05 
 
 		 429 aa  256  4e-67  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  35.16 
 
 		 428 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  33.71 
 
 		 444 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  36.05 
 
 		 458 aa  253  6e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  37.3 
 
 		 452 aa  251  3e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  36.28 
 
 		 431 aa  249  8e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  34.38 
 
 		 425 aa  248  2e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  32.88 
 
 		 439 aa  247  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  31.65 
 
 		 441 aa  247  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  32.8 
 
 		 447 aa  246  6e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  31.46 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  31.46 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  31.46 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  31.46 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  31.46 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  31.46 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  31.46 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  31.46 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  31.46 
 
 		 447 aa  245  9.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  36.41 
 
 		 425 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  32.58 
 
 		 443 aa  243  6e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  32.27 
 
 		 438 aa  243  6e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  35.6 
 
 		 436 aa  243  6e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  35.19 
 
 		 447 aa  242  7.999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  32.58 
 
 		 443 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  33.86 
 
 		 443 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  32.58 
 
 		 443 aa  241  1e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  31.44 
 
 		 447 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  36.26 
 
 		 431 aa  241  2e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  36.36 
 
 		 433 aa  240  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  31.21 
 
 		 447 aa  238  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3418  hypothetical protein  31.38 
 
 		 442 aa  238  1e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  34.18 
 
 		 438 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  31.21 
 
 		 447 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>