More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3215 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_3215  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  100 
 
 
431 aa  857    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  37.32 
 
 
433 aa  302  7.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  39.95 
 
 
432 aa  299  6e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  39.66 
 
 
442 aa  298  1e-79  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  41.27 
 
 
436 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  39.19 
 
 
438 aa  295  9e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  38.9 
 
 
447 aa  293  3e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  36.3 
 
 
439 aa  292  1e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  39.86 
 
 
443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  39.86 
 
 
443 aa  284  2.0000000000000002e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  36.36 
 
 
443 aa  283  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  37.5 
 
 
441 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  37.21 
 
 
440 aa  282  8.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  37.21 
 
 
440 aa  281  1e-74  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  40.56 
 
 
437 aa  280  2e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  37.41 
 
 
443 aa  278  9e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  36.71 
 
 
460 aa  277  3e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  36.92 
 
 
441 aa  275  8e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  36.26 
 
 
456 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  35.35 
 
 
439 aa  272  7e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  36.65 
 
 
443 aa  272  1e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  37.98 
 
 
437 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  37 
 
 
447 aa  271  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  36.62 
 
 
444 aa  270  4e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  38.22 
 
 
437 aa  269  7e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  36.08 
 
 
440 aa  268  2e-70  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  36.54 
 
 
436 aa  266  7e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  36.47 
 
 
441 aa  264  2e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  35.8 
 
 
442 aa  264  2e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  36.3 
 
 
445 aa  262  8e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  36.94 
 
 
439 aa  260  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  37.05 
 
 
432 aa  257  2e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  35.58 
 
 
439 aa  256  6e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  35.58 
 
 
439 aa  256  6e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  37.47 
 
 
442 aa  256  8e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  33.8 
 
 
431 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  33.57 
 
 
464 aa  242  9e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  35.33 
 
 
436 aa  240  4e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  34.62 
 
 
435 aa  239  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  30.56 
 
 
436 aa  237  3e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  32.2 
 
 
417 aa  237  3e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  35.21 
 
 
435 aa  236  6e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  31.7 
 
 
447 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  34.65 
 
 
436 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  36.49 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  34.11 
 
 
441 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  35.9 
 
 
437 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  32.87 
 
 
431 aa  233  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4210  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 
427 aa  233  7.000000000000001e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  33.33 
 
 
428 aa  230  3e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  34.66 
 
 
439 aa  230  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  35.24 
 
 
430 aa  228  1e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  32 
 
 
448 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  33.33 
 
 
437 aa  226  6e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  34.57 
 
 
436 aa  225  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  31.32 
 
 
454 aa  224  2e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  31.7 
 
 
447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  31.54 
 
 
431 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  29.77 
 
 
441 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  29.95 
 
 
437 aa  219  6e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1483  hypothetical protein  30.55 
 
 
429 aa  219  7e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.234798  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  30.79 
 
 
447 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  30.79 
 
 
447 aa  219  8.999999999999998e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  30.79 
 
 
447 aa  219  8.999999999999998e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  31.02 
 
 
447 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  31.02 
 
 
447 aa  218  1e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  31.24 
 
 
447 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  31.24 
 
 
447 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  31.02 
 
 
447 aa  218  1e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  31.02 
 
 
447 aa  218  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  31.02 
 
 
447 aa  218  1e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  31.24 
 
 
447 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  31.24 
 
 
447 aa  219  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  31.02 
 
 
447 aa  218  1e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  31.78 
 
 
426 aa  218  1e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  31.23 
 
 
438 aa  218  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  32.63 
 
 
482 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  32.94 
 
 
443 aa  218  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  31.13 
 
 
444 aa  218  2e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0295  hypothetical protein  34.11 
 
 
443 aa  218  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.73268  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  33.25 
 
 
433 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  32.71 
 
 
439 aa  216  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2477  protein of unknown function DUF21  33.49 
 
 
439 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0798586 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  33.01 
 
 
465 aa  215  9.999999999999999e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  29.95 
 
 
447 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4351  CBS domain-containing protein  31.15 
 
 
438 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  29.23 
 
 
439 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0777  protein of unknown function DUF21  30.02 
 
 
438 aa  213  4.9999999999999996e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.825818  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0698  hypothetical protein  33.17 
 
 
438 aa  212  7.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.46014  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  30.48 
 
 
441 aa  212  9e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3488  protein of unknown function DUF21  32.78 
 
 
432 aa  212  1e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  31.52 
 
 
428 aa  212  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  30.52 
 
 
452 aa  212  1e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0848  hypothetical protein  30.37 
 
 
438 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  31.38 
 
 
447 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3418  hypothetical protein  30.14 
 
 
442 aa  211  2e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  31.06 
 
 
424 aa  211  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  31.31 
 
 
430 aa  209  6e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2277  hypothetical protein  32.86 
 
 
441 aa  209  7e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  29.47 
 
 
432 aa  209  7e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>