More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0092 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0092  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  836    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  42.93 
 
 
465 aa  298  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  40.86 
 
 
430 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  39.08 
 
 
447 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  42.69 
 
 
436 aa  291  1e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  43.47 
 
 
479 aa  291  2e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  42.22 
 
 
446 aa  287  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  40.43 
 
 
431 aa  285  9e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  41.37 
 
 
424 aa  285  1.0000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  43.02 
 
 
441 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  39.35 
 
 
424 aa  280  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  38.06 
 
 
432 aa  279  8e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  37.97 
 
 
442 aa  278  1e-73  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  43.53 
 
 
436 aa  278  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  40.09 
 
 
437 aa  277  3e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  38.64 
 
 
431 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  42.72 
 
 
434 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  40.09 
 
 
458 aa  272  7e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  40.66 
 
 
429 aa  272  9e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  39.14 
 
 
431 aa  271  1e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  38.8 
 
 
466 aa  271  2e-71  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  35.7 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  38.63 
 
 
425 aa  268  1e-70  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  40.09 
 
 
425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4139  hypothetical protein  39.34 
 
 
452 aa  264  2e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0969684 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  38.08 
 
 
439 aa  264  2e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  38.08 
 
 
439 aa  264  3e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  36.34 
 
 
436 aa  262  8e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  39.76 
 
 
436 aa  261  1e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  39.01 
 
 
439 aa  261  2e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  38 
 
 
464 aa  261  2e-68  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  37.33 
 
 
447 aa  259  6e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  34.87 
 
 
437 aa  258  1e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  36.59 
 
 
430 aa  257  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  38.31 
 
 
443 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  38.31 
 
 
443 aa  257  3e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  36.79 
 
 
443 aa  256  4e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  36.88 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  37.14 
 
 
440 aa  254  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2753  hypothetical protein  39.71 
 
 
433 aa  253  3e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.151662  normal  0.98691 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  35.2 
 
 
456 aa  253  4.0000000000000004e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  37.53 
 
 
436 aa  250  3e-65  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  38.26 
 
 
438 aa  249  6e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  36.73 
 
 
460 aa  249  7e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1013  hemolysin  42.19 
 
 
424 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.471918  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2673  hypothetical protein  42.42 
 
 
424 aa  248  1e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.460279  normal  0.557621 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  37.3 
 
 
442 aa  248  2e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  42.89 
 
 
434 aa  248  2e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  38.21 
 
 
435 aa  246  6.999999999999999e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  36.02 
 
 
439 aa  246  6.999999999999999e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  37.86 
 
 
432 aa  246  8e-64  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  36.64 
 
 
444 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  36.63 
 
 
441 aa  243  7e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  35.51 
 
 
443 aa  242  9e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  38 
 
 
439 aa  242  1e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 
432 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  35.87 
 
 
417 aa  238  1e-61  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  37.71 
 
 
428 aa  239  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  36.89 
 
 
452 aa  238  2e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  36.05 
 
 
447 aa  238  2e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  30.93 
 
 
441 aa  237  3e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  34.4 
 
 
407 aa  237  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  33.25 
 
 
436 aa  236  7e-61  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  37.25 
 
 
447 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  34.57 
 
 
440 aa  233  6e-60  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  35.03 
 
 
441 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  34.58 
 
 
440 aa  231  2e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  38.19 
 
 
429 aa  231  2e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  35.21 
 
 
443 aa  230  4e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  37.59 
 
 
435 aa  229  5e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  34.22 
 
 
453 aa  230  5e-59  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  36.78 
 
 
432 aa  228  1e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  35.06 
 
 
432 aa  227  3e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  36.83 
 
 
437 aa  224  2e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  36.5 
 
 
437 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  32.47 
 
 
426 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  30.71 
 
 
432 aa  224  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  33.41 
 
 
441 aa  222  9e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0231  CBS  33.02 
 
 
454 aa  222  9.999999999999999e-57  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0205285  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  35.02 
 
 
433 aa  221  3e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5623  protein of unknown function DUF21  42.86 
 
 
403 aa  220  3e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  36.32 
 
 
445 aa  219  7e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  36.47 
 
 
456 aa  216  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  32.88 
 
 
448 aa  215  9.999999999999999e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  36.28 
 
 
444 aa  213  5.999999999999999e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  33.79 
 
 
442 aa  211  2e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  30.09 
 
 
439 aa  211  2e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  34.18 
 
 
445 aa  209  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  35.31 
 
 
439 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  35.05 
 
 
433 aa  206  5e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  31.96 
 
 
434 aa  205  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  30.34 
 
 
447 aa  203  4e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  33.97 
 
 
443 aa  203  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  34.46 
 
 
437 aa  203  6e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  33.09 
 
 
434 aa  202  7e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  35.35 
 
 
430 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4426  hypothetical protein  35.22 
 
 
440 aa  201  3e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.598992 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  31.64 
 
 
446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2493  protein of unknown function DUF21  36.52 
 
 
404 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2591  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  31.67 
 
 
443 aa  198  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>