More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0320 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0320  CBS domain-containing protein  100 
 
 
432 aa  867    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00497415  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  33.09 
 
 
420 aa  202  8e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  29.76 
 
 
434 aa  193  4e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  29.16 
 
 
439 aa  193  6e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  27.81 
 
 
429 aa  192  7e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  27.99 
 
 
426 aa  191  2e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  28.74 
 
 
436 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  28.95 
 
 
436 aa  187  4e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  28.22 
 
 
447 aa  186  5e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  26.65 
 
 
421 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  29.44 
 
 
427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  27.49 
 
 
440 aa  184  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  26.65 
 
 
421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  27.61 
 
 
428 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  28 
 
 
414 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  28.26 
 
 
429 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  27.64 
 
 
429 aa  179  1e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  25.98 
 
 
424 aa  178  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  24.94 
 
 
417 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  28.61 
 
 
433 aa  178  2e-43  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  28.72 
 
 
426 aa  178  2e-43  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  27.49 
 
 
429 aa  178  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  26.2 
 
 
435 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  30.63 
 
 
430 aa  177  4e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  27.63 
 
 
428 aa  176  9e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  26.63 
 
 
422 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  26.95 
 
 
438 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  25.78 
 
 
424 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0210  hypothetical protein  29.03 
 
 
428 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  27.87 
 
 
455 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  24.57 
 
 
434 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  28.82 
 
 
425 aa  173  5e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  28.12 
 
 
455 aa  173  5e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  28.12 
 
 
434 aa  173  5.999999999999999e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  26.34 
 
 
424 aa  173  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  29.14 
 
 
448 aa  172  6.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  26.73 
 
 
442 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0911  hypothetical protein  24.94 
 
 
523 aa  172  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  26.75 
 
 
442 aa  171  2e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  29.14 
 
 
435 aa  171  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  25.55 
 
 
436 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  27.45 
 
 
424 aa  171  3e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  26.91 
 
 
442 aa  171  3e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  29.9 
 
 
439 aa  169  8e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  26.09 
 
 
427 aa  169  8e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3019  hypothetical protein  28.75 
 
 
427 aa  169  1e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00496912  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  27.83 
 
 
418 aa  169  1e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  26.67 
 
 
442 aa  168  2e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  25.96 
 
 
433 aa  168  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  27 
 
 
426 aa  166  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0204  putative hemolysin  28.03 
 
 
412 aa  166  5.9999999999999996e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  29.82 
 
 
429 aa  166  1.0000000000000001e-39  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2811  hypothetical protein  28.33 
 
 
421 aa  165  2.0000000000000002e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  27.18 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  25.86 
 
 
422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  27.48 
 
 
443 aa  165  2.0000000000000002e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0469  hypothetical protein  26.67 
 
 
426 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272499  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  27.18 
 
 
427 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  28.47 
 
 
426 aa  163  7e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  25.42 
 
 
423 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2263  hypothetical protein  25.74 
 
 
440 aa  162  1e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.830702  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2680  hypothetical protein  27.65 
 
 
421 aa  161  2e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  25.67 
 
 
428 aa  161  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  25.96 
 
 
437 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0385  protein of unknown function DUF21  25.88 
 
 
434 aa  161  2e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237967  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0419  protein of unknown function DUF21  28.1 
 
 
429 aa  160  4e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  26.25 
 
 
424 aa  160  5e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  24.57 
 
 
413 aa  159  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  24.57 
 
 
413 aa  159  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2896  hypothetical protein  24.94 
 
 
420 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147354  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2027  CBS domain-containing protein  26.47 
 
 
435 aa  158  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.765021  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2771  hypothetical protein  24.94 
 
 
420 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000124547  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2764  hypothetical protein  24.94 
 
 
420 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294524  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0092  hypothetical protein  25.62 
 
 
426 aa  159  1e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0306325  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1949  CBS domain-containing protein  26.47 
 
 
435 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  24.94 
 
 
420 aa  158  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  26.44 
 
 
420 aa  159  1e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0842  protein of unknown function DUF21  24.32 
 
 
430 aa  158  2e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  26.05 
 
 
413 aa  158  2e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  27.79 
 
 
429 aa  158  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  27.21 
 
 
440 aa  158  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1165  hypothetical protein  27.13 
 
 
423 aa  157  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.132593  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0033  protein of unknown function DUF21  29.2 
 
 
467 aa  156  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  30.15 
 
 
422 aa  156  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  24.65 
 
 
454 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  26.42 
 
 
417 aa  156  6e-37  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0849  hypothetical protein  26.68 
 
 
429 aa  155  9e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000648521  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0996  hypothetical protein  28.1 
 
 
428 aa  155  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3020  hypothetical protein  26.46 
 
 
423 aa  155  1e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000521324  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  27.41 
 
 
434 aa  155  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  28.84 
 
 
424 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  28.09 
 
 
447 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2841  hypothetical protein  27.37 
 
 
423 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.063755  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2923  hypothetical protein  27.37 
 
 
423 aa  154  4e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.801289  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1207  hypothetical protein  26.76 
 
 
424 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000421474  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1284  hypothetical protein  26.76 
 
 
424 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121999  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1251  hypothetical protein  26.76 
 
 
424 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000842338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3106  protein of unknown function DUF21  26.76 
 
 
424 aa  153  5e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000105483  normal  0.0439763 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  25.44 
 
 
423 aa  153  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  23.45 
 
 
464 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>