More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0321 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  100 
 
 
439 aa  875    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  36.07 
 
 
421 aa  249  6e-65  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  35.83 
 
 
421 aa  248  2e-64  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  35.76 
 
 
420 aa  247  3e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  34.78 
 
 
429 aa  246  6.999999999999999e-64  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  31.93 
 
 
417 aa  238  2e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  32.95 
 
 
424 aa  232  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  33.41 
 
 
424 aa  231  3e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  32.24 
 
 
424 aa  227  4e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  32.95 
 
 
426 aa  225  1e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  34.45 
 
 
414 aa  219  7.999999999999999e-56  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  34.37 
 
 
430 aa  218  1e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  31.64 
 
 
434 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  31.92 
 
 
429 aa  218  2e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  31.38 
 
 
421 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  32.48 
 
 
422 aa  215  9.999999999999999e-55  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  32.94 
 
 
426 aa  210  4e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0911  hypothetical protein  29.67 
 
 
523 aa  209  5e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  34.57 
 
 
455 aa  207  4e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  30.02 
 
 
436 aa  206  6e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  31.94 
 
 
425 aa  206  6e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  30.02 
 
 
436 aa  205  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  34.42 
 
 
455 aa  205  1e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  28.87 
 
 
438 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  33.17 
 
 
418 aa  203  4e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  30.82 
 
 
434 aa  202  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  29.07 
 
 
437 aa  203  6e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  28.1 
 
 
444 aa  202  7e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  31.23 
 
 
428 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0320  CBS domain-containing protein  29.65 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00497415  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  29.07 
 
 
433 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  32.94 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  31.91 
 
 
426 aa  200  3e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  28.74 
 
 
435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  30.16 
 
 
427 aa  200  5e-50  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  29.91 
 
 
442 aa  200  5e-50  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  29.07 
 
 
429 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  26.95 
 
 
428 aa  197  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  29.45 
 
 
452 aa  197  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  31.47 
 
 
434 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  27.25 
 
 
442 aa  196  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  32.06 
 
 
448 aa  196  7e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  28.98 
 
 
427 aa  195  1e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0419  protein of unknown function DUF21  28.81 
 
 
429 aa  193  4e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  27.4 
 
 
440 aa  193  4e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  29.5 
 
 
418 aa  192  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  29.5 
 
 
427 aa  192  8e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0849  hypothetical protein  29.5 
 
 
429 aa  192  8e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000648521  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  30.33 
 
 
424 aa  192  1e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  27.34 
 
 
447 aa  192  1e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  30.09 
 
 
429 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  28.26 
 
 
429 aa  192  1e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  29.95 
 
 
443 aa  191  2e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  27.94 
 
 
434 aa  189  7e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  29.55 
 
 
429 aa  189  8e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
425 aa  189  9e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  28.98 
 
 
413 aa  188  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  26.21 
 
 
464 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0842  protein of unknown function DUF21  29.15 
 
 
430 aa  188  2e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2680  hypothetical protein  31.25 
 
 
421 aa  187  3e-46  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  30.59 
 
 
422 aa  187  4e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0204  putative hemolysin  32.03 
 
 
412 aa  187  5e-46  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0469  hypothetical protein  29.29 
 
 
426 aa  186  5e-46  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272499  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  28.16 
 
 
413 aa  186  6e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  28.16 
 
 
413 aa  186  6e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  29.91 
 
 
442 aa  186  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0892  CBS domain-containing protein  29.86 
 
 
433 aa  186  8e-46  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0338077  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3370  hemolysin  31.33 
 
 
423 aa  186  9e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  33.02 
 
 
431 aa  185  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1429  transporter  31.81 
 
 
419 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.836538  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  29.49 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2896  hypothetical protein  28.43 
 
 
420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147354  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  30.07 
 
 
428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2764  hypothetical protein  28.43 
 
 
420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294524  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  28.43 
 
 
420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2811  hypothetical protein  30.94 
 
 
421 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0210  hypothetical protein  30.68 
 
 
428 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  29.16 
 
 
439 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2771  hypothetical protein  28.43 
 
 
420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000124547  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2893  hypothetical protein  28.16 
 
 
413 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2895  hypothetical protein  28.16 
 
 
413 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132173  normal  0.997899 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2825  hypothetical protein  28.16 
 
 
413 aa  184  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00280306  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  30.81 
 
 
423 aa  184  4.0000000000000006e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  26.17 
 
 
436 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0033  protein of unknown function DUF21  32 
 
 
467 aa  183  5.0000000000000004e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3007  hypothetical protein  28.16 
 
 
413 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  28.73 
 
 
451 aa  183  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2875  hypothetical protein  28.16 
 
 
413 aa  182  7e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156935  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  29.79 
 
 
423 aa  182  7e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  29.31 
 
 
431 aa  181  2e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0092  hypothetical protein  29.48 
 
 
426 aa  181  2e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0306325  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  30.05 
 
 
431 aa  181  2e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  25.93 
 
 
464 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  30.5 
 
 
420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  29.33 
 
 
442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  28.41 
 
 
439 aa  180  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0503  protein of unknown function DUF21  26.53 
 
 
453 aa  180  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  28.41 
 
 
439 aa  180  4.999999999999999e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  25.53 
 
 
434 aa  179  5.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  28.83 
 
 
443 aa  179  7e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>