More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0036 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  100 
 
 		 421 aa  825    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  99.29 
 
 		 421 aa  820    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  47.33 
 
 		 429 aa  395  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  43.67 
 
 		 420 aa  334  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  37.41 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  36.67 
 
 		 424 aa  300  3e-80  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  36.71 
 
 		 424 aa  300  4e-80  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  40.55 
 
 		 414 aa  297  3e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  34.34 
 
 		 417 aa  289  6e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  39.17 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  37.62 
 
 		 429 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  39.95 
 
 		 430 aa  276  4e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  40.96 
 
 		 426 aa  274  2.0000000000000002e-72  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  41.16 
 
 		 424 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  36.27 
 
 		 417 aa  271  1e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  39.8 
 
 		 425 aa  270  5e-71  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  37.08 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  36.6 
 
 		 421 aa  265  1e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  33.65 
 
 		 422 aa  265  1e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  35.83 
 
 		 439 aa  263  4e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  34.66 
 
 		 422 aa  263  4e-69  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  39 
 
 		 443 aa  258  1e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  34.2 
 
 		 440 aa  258  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  36.84 
 
 		 420 aa  257  2e-67  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  38.94 
 
 		 433 aa  256  4e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  34.4 
 
 		 424 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  31.9 
 
 		 464 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  33.65 
 
 		 434 aa  253  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  37.06 
 
 		 434 aa  252  7e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  34.88 
 
 		 433 aa  252  8.000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  39.15 
 
 		 420 aa  251  1e-65  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  34.54 
 
 		 437 aa  251  1e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  31.28 
 
 		 427 aa  251  1e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  32.78 
 
 		 436 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  32.13 
 
 		 426 aa  250  4e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  33.73 
 
 		 447 aa  249  6e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  33.41 
 
 		 434 aa  248  1e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  36.66 
 
 		 443 aa  248  2e-64  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  34.01 
 
 		 454 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  32.61 
 
 		 422 aa  247  3e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  32.78 
 
 		 434 aa  246  6.999999999999999e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  33.09 
 
 		 468 aa  246  6.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  31.92 
 
 		 464 aa  245  9e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  32.37 
 
 		 428 aa  245  9e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  36.75 
 
 		 447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  32.37 
 
 		 464 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  36.27 
 
 		 456 aa  243  3e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  32.87 
 
 		 432 aa  243  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  33.17 
 
 		 435 aa  243  3.9999999999999997e-63  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0092  hypothetical protein  32.04 
 
 		 426 aa  243  5e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0306325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  34.47 
 
 		 445 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  31.37 
 
 		 428 aa  242  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  37.06 
 
 		 439 aa  241  1e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3370  hemolysin  31.77 
 
 		 423 aa  242  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  32.92 
 
 		 429 aa  241  2e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  35.49 
 
 		 467 aa  240  2.9999999999999997e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  31.91 
 
 		 447 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  37.47 
 
 		 422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  34.13 
 
 		 429 aa  240  4e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2923  hypothetical protein  32.91 
 
 		 426 aa  240  4e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 		 436 aa  240  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  33.09 
 
 		 426 aa  239  5e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  34.36 
 
 		 439 aa  239  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  32.62 
 
 		 442 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  33.17 
 
 		 436 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0419  protein of unknown function DUF21  34.45 
 
 		 429 aa  239  8e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1165  hypothetical protein  33.58 
 
 		 423 aa  239  8e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.132593  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  32.36 
 
 		 429 aa  239  1e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  35.08 
 
 		 477 aa  238  1e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  36.23 
 
 		 435 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  32.6 
 
 		 465 aa  238  2e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  38.05 
 
 		 455 aa  237  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  33.42 
 
 		 427 aa  237  3e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  33.02 
 
 		 444 aa  236  4e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  37.08 
 
 		 455 aa  237  4e-61  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  32.47 
 
 		 442 aa  237  4e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0385  protein of unknown function DUF21  32.35 
 
 		 434 aa  236  4e-61  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237967  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  32.93 
 
 		 438 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0469  hypothetical protein  30.6 
 
 		 426 aa  236  6e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272499  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  33.73 
 
 		 470 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  35.04 
 
 		 429 aa  234  3e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  31.91 
 
 		 424 aa  233  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  34.43 
 
 		 447 aa  232  1e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  32.03 
 
 		 431 aa  231  1e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2923  hypothetical protein  33.09 
 
 		 423 aa  231  1e-59  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.801289  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1046  hypothetical protein  32.27 
 
 		 427 aa  231  1e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0461701  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3020  hypothetical protein  33.58 
 
 		 423 aa  231  1e-59  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000521324  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  34.47 
 
 		 452 aa  231  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  31.94 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2757  hypothetical protein  32.42 
 
 		 428 aa  231  2e-59  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000928443  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  31.95 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0849  hypothetical protein  31.02 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000648521  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2841  hypothetical protein  33.33 
 
 		 423 aa  231  2e-59  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.063755  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  30.86 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0886  hypothetical protein  32.58 
 
 		 429 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0842  protein of unknown function DUF21  31.55 
 
 		 430 aa  230  3e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2811  hypothetical protein  30.79 
 
 		 421 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1354  hemolysin protein, putative  33.42 
 
 		 423 aa  230  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  32.24 
 
 		 533 aa  229  5e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  32.93 
 
 		 479 aa  229  6e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>