More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4395 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  82.26 
 
 
435 aa  652    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  100 
 
 
439 aa  865    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  54.41 
 
 
447 aa  393  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  48.96 
 
 
427 aa  359  6e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  38.39 
 
 
420 aa  290  4e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  40.96 
 
 
434 aa  286  5.999999999999999e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  37.14 
 
 
425 aa  256  5e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  35.55 
 
 
417 aa  255  9e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  33.89 
 
 
434 aa  250  4e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  38.14 
 
 
430 aa  249  6e-65  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  36.45 
 
 
429 aa  248  1e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  36.59 
 
 
421 aa  245  9.999999999999999e-64  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  36.34 
 
 
421 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  39.25 
 
 
421 aa  243  5e-63  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  36.52 
 
 
456 aa  241  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  38.5 
 
 
425 aa  241  2e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  37.86 
 
 
442 aa  239  6.999999999999999e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  35.22 
 
 
424 aa  238  1e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  38.27 
 
 
426 aa  237  3e-61  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  33.41 
 
 
443 aa  236  5.0000000000000005e-61  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  36.18 
 
 
443 aa  236  5.0000000000000005e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  33.82 
 
 
422 aa  236  8e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  36.79 
 
 
461 aa  232  8.000000000000001e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  32.86 
 
 
448 aa  232  1e-59  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  44.23 
 
 
284 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  36.05 
 
 
477 aa  232  1e-59  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  36.5 
 
 
420 aa  230  4e-59  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  35.61 
 
 
425 aa  228  1e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  37.96 
 
 
439 aa  228  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  32.09 
 
 
414 aa  228  2e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  35.11 
 
 
436 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  35.99 
 
 
435 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  35.11 
 
 
436 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  35.11 
 
 
436 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  35.2 
 
 
467 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  36.21 
 
 
434 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  37.11 
 
 
435 aa  225  1e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
470 aa  224  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  37.09 
 
 
426 aa  224  3e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  34.21 
 
 
455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  35.86 
 
 
464 aa  223  7e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  37.47 
 
 
420 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  35.25 
 
 
464 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  34.22 
 
 
455 aa  220  3e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  35.55 
 
 
464 aa  220  3e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  37.92 
 
 
442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  35.86 
 
 
432 aa  220  3.9999999999999997e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  34.77 
 
 
454 aa  219  5e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  36.46 
 
 
432 aa  219  7e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  34.16 
 
 
464 aa  219  7.999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  32 
 
 
429 aa  219  7.999999999999999e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  35.23 
 
 
431 aa  219  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  30.6 
 
 
429 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  35.47 
 
 
452 aa  217  4e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  36.2 
 
 
430 aa  216  5e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  35.98 
 
 
464 aa  216  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  36.86 
 
 
434 aa  215  9.999999999999999e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  35.56 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  37.53 
 
 
443 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  35.19 
 
 
437 aa  213  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  34.07 
 
 
447 aa  213  7.999999999999999e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  29.18 
 
 
424 aa  212  1e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  32.7 
 
 
437 aa  211  1e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  33.95 
 
 
444 aa  212  1e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  36.08 
 
 
447 aa  212  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  28.68 
 
 
424 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  37.61 
 
 
423 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  31.62 
 
 
431 aa  209  8e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  40.08 
 
 
287 aa  209  9e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  32.91 
 
 
445 aa  208  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  34.68 
 
 
490 aa  209  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  32.91 
 
 
445 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0376  CBS domain containing protein  31.31 
 
 
404 aa  208  2e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  37.96 
 
 
421 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  30.22 
 
 
468 aa  207  3e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  39.69 
 
 
287 aa  207  3e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  28.43 
 
 
424 aa  207  4e-52  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  36.63 
 
 
537 aa  207  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  32.41 
 
 
431 aa  206  5e-52  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  33.09 
 
 
431 aa  206  7e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  43.8 
 
 
284 aa  205  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  40.65 
 
 
296 aa  205  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  44.76 
 
 
284 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  30.02 
 
 
439 aa  203  6e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  31.91 
 
 
417 aa  202  7e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  33.51 
 
 
428 aa  202  9e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  31.83 
 
 
418 aa  202  9e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  36.52 
 
 
457 aa  202  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  34.9 
 
 
465 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  44.79 
 
 
483 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  33.65 
 
 
440 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  39.29 
 
 
276 aa  201  3e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 
444 aa  200  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  37.6 
 
 
484 aa  199  6e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  33.33 
 
 
447 aa  199  6e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 
434 aa  199  7.999999999999999e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  31.32 
 
 
440 aa  199  7.999999999999999e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  33.98 
 
 
435 aa  199  7.999999999999999e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0407  protein of unknown function DUF21  35.05 
 
 
464 aa  198  1.0000000000000001e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.426667  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  32.93 
 
 
443 aa  198  1.0000000000000001e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>