More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_2111 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  100 
 
 		 421 aa  825    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  34.14 
 
 		 431 aa  268  1e-70  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  34.36 
 
 		 418 aa  265  2e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  35.66 
 
 		 420 aa  261  2e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  35.89 
 
 		 431 aa  258  1e-67  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5985  gliding motility-associated protein GldE  37.62 
 
 		 453 aa  249  7e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  35.96 
 
 		 430 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  35.47 
 
 		 417 aa  230  4e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  38.6 
 
 		 434 aa  229  7e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4440  CBS domain containing protein  36.32 
 
 		 438 aa  228  1e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0935  CBS domain containing protein  32.45 
 
 		 464 aa  228  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  44.19 
 
 		 447 aa  221  1.9999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  34.96 
 
 		 425 aa  218  1e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_002950  PG0272  CBS domain-containing protein  33.97 
 
 		 419 aa  217  4e-55  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  32.52 
 
 		 443 aa  217  4e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  37.15 
 
 		 439 aa  216  5e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  31.4 
 
 		 424 aa  214  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  33.5 
 
 		 424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  37.5 
 
 		 421 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  35.45 
 
 		 429 aa  213  7e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  31.57 
 
 		 424 aa  212  7.999999999999999e-54  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  37.41 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  30.97 
 
 		 424 aa  210  4e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  48 
 
 		 284 aa  209  9e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  38.61 
 
 		 427 aa  208  2e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  34.13 
 
 		 434 aa  207  3e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  31.18 
 
 		 422 aa  206  8e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  38.58 
 
 		 439 aa  206  9e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  34.02 
 
 		 423 aa  206  9e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  42.46 
 
 		 434 aa  206  9e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  29.98 
 
 		 429 aa  205  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  33.81 
 
 		 448 aa  204  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  33.49 
 
 		 467 aa  204  2e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  31.58 
 
 		 455 aa  204  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  40.65 
 
 		 296 aa  203  4e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  37.5 
 
 		 461 aa  202  9.999999999999999e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  32.37 
 
 		 468 aa  201  1.9999999999999998e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  41.56 
 
 		 420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  31.41 
 
 		 455 aa  201  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  33.81 
 
 		 433 aa  201  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  32.37 
 
 		 464 aa  200  5e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  38.72 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  33.41 
 
 		 477 aa  198  1.0000000000000001e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  34.49 
 
 		 446 aa  198  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  37.95 
 
 		 432 aa  198  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  32.43 
 
 		 417 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0703  protein of unknown function DUF21  33.18 
 
 		 477 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401824 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  46.81 
 
 		 284 aa  197  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  36.92 
 
 		 435 aa  197  3e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  35.14 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  38.83 
 
 		 435 aa  196  6e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  35.14 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  35.14 
 
 		 436 aa  196  6e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  31.86 
 
 		 421 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  36.3 
 
 		 465 aa  196  7e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  34 
 
 		 425 aa  196  9e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  31.86 
 
 		 421 aa  196  9e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  43.27 
 
 		 287 aa  195  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  43.27 
 
 		 287 aa  195  1e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  34.75 
 
 		 426 aa  194  2e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  34.99 
 
 		 435 aa  195  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  36.79 
 
 		 442 aa  194  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  34.79 
 
 		 432 aa  193  4e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  41.35 
 
 		 464 aa  193  5e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 		 443 aa  193  6e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  32.59 
 
 		 464 aa  192  8e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  41.35 
 
 		 464 aa  192  1e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  35.45 
 
 		 447 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  39.94 
 
 		 483 aa  192  1e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4107  protein of unknown function DUF21  33.03 
 
 		 463 aa  191  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  41.03 
 
 		 537 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  45.92 
 
 		 285 aa  191  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  38.34 
 
 		 443 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  33.86 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4147  protein of unknown function DUF21  33.03 
 
 		 463 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.263369 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  30.82 
 
 		 432 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  31.09 
 
 		 447 aa  189  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0911  hypothetical protein  33.01 
 
 		 523 aa  189  9e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  44.96 
 
 		 484 aa  188  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  32.86 
 
 		 465 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  36.59 
 
 		 430 aa  188  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  41.11 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  31.7 
 
 		 464 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  31.28 
 
 		 439 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2361  hypothetical protein  31.41 
 
 		 432 aa  186  7e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00115702  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  41.27 
 
 		 438 aa  186  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  36.6 
 
 		 490 aa  186  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  32.14 
 
 		 456 aa  185  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  45.37 
 
 		 250 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  32.33 
 
 		 446 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  33.66 
 
 		 456 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  40.6 
 
 		 285 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  43.16 
 
 		 293 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3684  hemolysin-like protein  39.04 
 
 		 293 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  34.97 
 
 		 425 aa  182  7e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  31.87 
 
 		 445 aa  182  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  31.37 
 
 		 433 aa  182  8.000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.06 
 
 		 292 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  31.87 
 
 		 445 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  39.43 
 
 		 276 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>