More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0846 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  100 
 
 
439 aa  861    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  61.07 
 
 
465 aa  472  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  53.79 
 
 
442 aa  388  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  54.33 
 
 
452 aa  376  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  52.69 
 
 
434 aa  370  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  50 
 
 
461 aa  365  1e-99  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  52.18 
 
 
425 aa  364  2e-99  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  52.73 
 
 
483 aa  360  3e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1269  CBS  50.23 
 
 
454 aa  350  2e-95  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  54.45 
 
 
484 aa  348  9e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  50.54 
 
 
457 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  50.39 
 
 
435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  47.55 
 
 
430 aa  336  5e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  48.93 
 
 
490 aa  335  9e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  46.64 
 
 
436 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  46.64 
 
 
436 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  46.64 
 
 
436 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  52.58 
 
 
464 aa  327  2.0000000000000001e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  49.53 
 
 
464 aa  325  1e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  47.85 
 
 
432 aa  322  9.999999999999999e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  47.61 
 
 
432 aa  320  1.9999999999999998e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  47.29 
 
 
426 aa  318  1e-85  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  44.62 
 
 
435 aa  314  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  46.6 
 
 
437 aa  304  2.0000000000000002e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  49.07 
 
 
438 aa  304  2.0000000000000002e-81  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  43.03 
 
 
495 aa  300  5e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  47.09 
 
 
537 aa  295  2e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  42.44 
 
 
443 aa  277  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  40.96 
 
 
447 aa  268  1e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  42.82 
 
 
456 aa  265  8.999999999999999e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  43.9 
 
 
448 aa  263  6e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  42.52 
 
 
444 aa  240  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  39.77 
 
 
434 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  33.1 
 
 
420 aa  223  6e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2186  CBS domain containing protein  46.25 
 
 
476 aa  217  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0594  hemolysin-like protein  35.42 
 
 
477 aa  216  7e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0862  CBS domain protein  45.14 
 
 
499 aa  214  1.9999999999999998e-54  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  33.95 
 
 
422 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  42.76 
 
 
439 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  43.66 
 
 
284 aa  209  5e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  43.6 
 
 
435 aa  207  3e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  36.68 
 
 
421 aa  204  2e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  42.56 
 
 
447 aa  205  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  33.66 
 
 
421 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  33.42 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  37.47 
 
 
420 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  34.05 
 
 
437 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  32.41 
 
 
455 aa  197  3e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  32.59 
 
 
425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  30.62 
 
 
443 aa  196  9e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  39.09 
 
 
427 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  31.92 
 
 
434 aa  194  2e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  39.84 
 
 
296 aa  194  3e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  33.93 
 
 
446 aa  193  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  32.05 
 
 
455 aa  193  5e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  41.29 
 
 
284 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  31.84 
 
 
425 aa  189  5.999999999999999e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1544  CBS domain containing protein  42.98 
 
 
441 aa  189  7e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  30.69 
 
 
430 aa  187  4e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  29.48 
 
 
434 aa  186  6e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  31.04 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  33.1 
 
 
420 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  31.1 
 
 
423 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  30.26 
 
 
429 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  40.15 
 
 
287 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  40.43 
 
 
250 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  40.15 
 
 
287 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  41.42 
 
 
442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  33.04 
 
 
447 aa  182  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  28.11 
 
 
445 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  28.11 
 
 
445 aa  181  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  35.09 
 
 
433 aa  180  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  39.37 
 
 
285 aa  180  4.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  37.24 
 
 
284 aa  177  3e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  30.86 
 
 
429 aa  177  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  31.59 
 
 
438 aa  177  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2235  CBS domain containing protein  34.73 
 
 
439 aa  177  4e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  33.8 
 
 
444 aa  177  5e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  30.83 
 
 
424 aa  176  9e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  33.9 
 
 
447 aa  175  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  29.53 
 
 
448 aa  175  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12320  CBS domain-containing protein  35.85 
 
 
441 aa  175  1.9999999999999998e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  40.45 
 
 
443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  39.53 
 
 
281 aa  174  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 
417 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  30.85 
 
 
443 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  38.82 
 
 
426 aa  172  1e-41  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5985  gliding motility-associated protein GldE  30.3 
 
 
453 aa  172  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  38.6 
 
 
456 aa  171  2e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0272  CBS domain-containing protein  27.62 
 
 
419 aa  171  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  30.45 
 
 
443 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  29.4 
 
 
424 aa  170  4e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  34.82 
 
 
276 aa  170  4e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  29.75 
 
 
443 aa  170  6e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  32.37 
 
 
467 aa  169  7e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  31.1 
 
 
440 aa  169  9e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  30.37 
 
 
442 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1580  hypothetical protein  31.85 
 
 
445 aa  169  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0951178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  30.14 
 
 
442 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  39.69 
 
 
456 aa  167  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>