More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02660 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  100 
 
 
418 aa  835    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  61.2 
 
 
431 aa  519  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  56.65 
 
 
431 aa  469  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0272  CBS domain-containing protein  41.16 
 
 
419 aa  309  6.999999999999999e-83  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5985  gliding motility-associated protein GldE  41.23 
 
 
453 aa  307  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0935  CBS domain containing protein  34.05 
 
 
464 aa  301  1e-80  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  35.07 
 
 
421 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4440  CBS domain containing protein  33.57 
 
 
438 aa  233  4.0000000000000004e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3684  hemolysin-like protein  44.49 
 
 
293 aa  231  2e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335201  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  31.65 
 
 
420 aa  216  5e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  31.63 
 
 
417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  36.17 
 
 
430 aa  213  5.999999999999999e-54  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  32.78 
 
 
429 aa  211  1e-53  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  33.57 
 
 
443 aa  211  2e-53  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  32.93 
 
 
425 aa  207  4e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  31.52 
 
 
477 aa  206  4e-52  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  33.72 
 
 
448 aa  205  2e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  29.89 
 
 
464 aa  202  8e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  33.17 
 
 
427 aa  202  9e-51  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  30.97 
 
 
467 aa  202  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  33.33 
 
 
421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0911  hypothetical protein  29.95 
 
 
523 aa  201  3e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  29.82 
 
 
454 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  33.09 
 
 
421 aa  200  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  32.91 
 
 
423 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  32.48 
 
 
470 aa  199  1.0000000000000001e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  31.43 
 
 
440 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  31.52 
 
 
422 aa  197  3e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  32.62 
 
 
424 aa  196  9e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  33.75 
 
 
422 aa  195  1e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  30.91 
 
 
434 aa  195  1e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  30.27 
 
 
464 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  29.93 
 
 
437 aa  194  3e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  29.98 
 
 
429 aa  194  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  30.04 
 
 
464 aa  193  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  32.4 
 
 
426 aa  192  7e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  29.76 
 
 
443 aa  192  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  31.59 
 
 
429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  33.88 
 
 
455 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  29.84 
 
 
446 aa  190  4e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  31.09 
 
 
445 aa  189  5.999999999999999e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  29.95 
 
 
436 aa  189  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  33.72 
 
 
455 aa  189  1e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  30.4 
 
 
447 aa  188  1e-46  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  29.21 
 
 
468 aa  187  2e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  29.74 
 
 
442 aa  187  2e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0419  protein of unknown function DUF21  29.43 
 
 
429 aa  187  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  29.48 
 
 
436 aa  187  3e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  27.96 
 
 
424 aa  186  5e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0033  protein of unknown function DUF21  30.47 
 
 
467 aa  186  5e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  29.16 
 
 
456 aa  186  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  29.43 
 
 
425 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  29.13 
 
 
465 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  29.27 
 
 
434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  29.4 
 
 
433 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  29.12 
 
 
442 aa  184  3e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  32 
 
 
427 aa  184  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  28.47 
 
 
424 aa  183  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  28.44 
 
 
424 aa  183  6e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  30.14 
 
 
447 aa  182  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  35.38 
 
 
433 aa  181  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  31.01 
 
 
447 aa  181  2e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  28.88 
 
 
442 aa  181  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  29.17 
 
 
442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  32.4 
 
 
434 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 
276 aa  180  4e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  28.44 
 
 
429 aa  180  4.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2559  protein of unknown function DUF21  34.29 
 
 
410 aa  179  5.999999999999999e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.764151  hitchhiker  0.000350536 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  30.99 
 
 
445 aa  179  7e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  30.99 
 
 
445 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  28.36 
 
 
426 aa  179  9e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  30.36 
 
 
437 aa  179  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  32.7 
 
 
421 aa  179  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  34.75 
 
 
439 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  33.85 
 
 
435 aa  178  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  28.4 
 
 
414 aa  178  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  27.74 
 
 
440 aa  177  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  29.34 
 
 
435 aa  177  3e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  30.68 
 
 
479 aa  177  4e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  27.74 
 
 
447 aa  176  8e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  27.53 
 
 
441 aa  176  8e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  27.7 
 
 
424 aa  176  9.999999999999999e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  36.5 
 
 
273 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  28.64 
 
 
429 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  28.04 
 
 
428 aa  174  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  29.08 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  31.74 
 
 
452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  29.52 
 
 
420 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  27.89 
 
 
487 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  32.23 
 
 
443 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  38.56 
 
 
258 aa  174  3.9999999999999995e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  28.08 
 
 
438 aa  173  5e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  31.07 
 
 
431 aa  172  6.999999999999999e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  37.07 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  26.34 
 
 
436 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  32.06 
 
 
287 aa  171  2e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  31.68 
 
 
287 aa  170  5e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  29.4 
 
 
442 aa  169  6e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  26.42 
 
 
434 aa  169  7e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  31.18 
 
 
434 aa  169  7e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>