More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0978 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0978  protein involved in gliding motility GldE  100 
 
 		 431 aa  865    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  57 
 
 		 418 aa  482  1e-135  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  55.48 
 
 		 431 aa  477  1e-133  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0935  CBS domain containing protein  37.44 
 
 		 464 aa  315  9e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5985  gliding motility-associated protein GldE  42.64 
 
 		 453 aa  307  3e-82  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_002950  PG0272  CBS domain-containing protein  40.62 
 
 		 419 aa  306  5.0000000000000004e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  35.52 
 
 		 421 aa  245  9e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3684  hemolysin-like protein  41.94 
 
 		 293 aa  229  9e-59  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.335201  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4440  CBS domain containing protein  44.08 
 
 		 438 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  32.93 
 
 		 420 aa  223  4.9999999999999996e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  33.49 
 
 		 429 aa  222  9e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  32.69 
 
 		 425 aa  219  7e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  29.73 
 
 		 464 aa  218  2e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  30.11 
 
 		 464 aa  204  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  30.09 
 
 		 464 aa  202  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  32.85 
 
 		 421 aa  202  9e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  37 
 
 		 430 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  32.85 
 
 		 421 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  30.37 
 
 		 426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  30.32 
 
 		 467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  30.16 
 
 		 470 aa  197  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  30.94 
 
 		 417 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  32.26 
 
 		 425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  30.14 
 
 		 421 aa  195  1e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  32.52 
 
 		 443 aa  194  3e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  29.48 
 
 		 468 aa  194  3e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  31.12 
 
 		 435 aa  192  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  30.25 
 
 		 426 aa  192  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  30.09 
 
 		 454 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  32.04 
 
 		 420 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0911  hypothetical protein  32.11 
 
 		 523 aa  191  2e-47  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  29.37 
 
 		 429 aa  190  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  32.18 
 
 		 439 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  32.91 
 
 		 422 aa  188  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  31.31 
 
 		 427 aa  188  2e-46  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  33.02 
 
 		 448 aa  187  4e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  31.28 
 
 		 414 aa  186  5e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  28.57 
 
 		 447 aa  186  6e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  30.38 
 
 		 424 aa  186  6e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  30.31 
 
 		 424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  30.95 
 
 		 422 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  31.14 
 
 		 431 aa  184  2.0000000000000003e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  28.94 
 
 		 477 aa  184  4.0000000000000006e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  33.57 
 
 		 455 aa  183  5.0000000000000004e-45  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  30.58 
 
 		 443 aa  183  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  27.76 
 
 		 440 aa  183  6e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  33.33 
 
 		 455 aa  182  9.000000000000001e-45  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  30.2 
 
 		 427 aa  182  9.000000000000001e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  29.68 
 
 		 433 aa  182  1e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  32.24 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  29.29 
 
 		 424 aa  181  2.9999999999999997e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  27.76 
 
 		 447 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  30.65 
 
 		 442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  27.4 
 
 		 446 aa  179  9e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  28.8 
 
 		 429 aa  178  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  28.74 
 
 		 439 aa  178  2e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  28.71 
 
 		 422 aa  177  4e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  38.33 
 
 		 258 aa  175  9.999999999999999e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  29.47 
 
 		 417 aa  175  9.999999999999999e-43  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  30.34 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  29.49 
 
 		 447 aa  176  9.999999999999999e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  29.81 
 
 		 429 aa  175  9.999999999999999e-43  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2559  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 		 410 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.764151  hitchhiker  0.000350536 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  29.21 
 
 		 428 aa  175  1.9999999999999998e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  29.15 
 
 		 436 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  28.44 
 
 		 435 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  32.08 
 
 		 447 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  28.5 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  28.54 
 
 		 438 aa  173  3.9999999999999995e-42  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  28.01 
 
 		 443 aa  173  5e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  29.15 
 
 		 436 aa  173  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0385  protein of unknown function DUF21  30.52 
 
 		 434 aa  172  9e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000237967  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  29.71 
 
 		 437 aa  172  9e-42  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  28.61 
 
 		 456 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0407  protein of unknown function DUF21  30.48 
 
 		 464 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.426667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  26.35 
 
 		 436 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  30.64 
 
 		 423 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  33.03 
 
 		 433 aa  169  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  29.63 
 
 		 434 aa  169  8e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  29.53 
 
 		 434 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  29.69 
 
 		 434 aa  169  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  29.3 
 
 		 420 aa  169  1e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  28.64 
 
 		 429 aa  168  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  28.18 
 
 		 432 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  28.15 
 
 		 441 aa  168  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  29.47 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  37.08 
 
 		 259 aa  167  2.9999999999999998e-40  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  28.7 
 
 		 442 aa  167  4e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  36.4 
 
 		 285 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  27.23 
 
 		 444 aa  166  6.9999999999999995e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  28.21 
 
 		 434 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  30.14 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  30.23 
 
 		 445 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  30.23 
 
 		 445 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  28.41 
 
 		 440 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0033  protein of unknown function DUF21  29.29 
 
 		 467 aa  164  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  28.48 
 
 		 442 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1275  protein of unknown function DUF21  29.27 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  28.23 
 
 		 430 aa  164  3e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>