More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1914 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  100 
 
 
430 aa  844    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  61.43 
 
 
425 aa  468  9.999999999999999e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  58.55 
 
 
442 aa  457  1e-127  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  59.42 
 
 
434 aa  448  1.0000000000000001e-124  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  55.32 
 
 
461 aa  442  1e-123  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  59.43 
 
 
464 aa  440  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  57.14 
 
 
452 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  58.17 
 
 
483 aa  436  1e-121  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  58.49 
 
 
464 aa  434  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  56.31 
 
 
426 aa  432  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  53.22 
 
 
490 aa  431  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  56.35 
 
 
435 aa  430  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  52.33 
 
 
435 aa  427  1e-118  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  55.01 
 
 
432 aa  412  1e-114  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  52.56 
 
 
436 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  52.56 
 
 
436 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  52.56 
 
 
436 aa  410  1e-113  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  54.91 
 
 
457 aa  406  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  54.12 
 
 
432 aa  401  1e-111  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  51.61 
 
 
437 aa  396  1e-109  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  55.22 
 
 
484 aa  393  1e-108  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  51.43 
 
 
495 aa  390  1e-107  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  53.9 
 
 
438 aa  384  1e-105  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1269  CBS  53.32 
 
 
454 aa  380  1e-104  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  53.35 
 
 
537 aa  364  2e-99  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  47.55 
 
 
439 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  48.63 
 
 
465 aa  336  5e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  47.88 
 
 
456 aa  322  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  44.71 
 
 
443 aa  316  6e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  42.45 
 
 
447 aa  301  2e-80  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  42.79 
 
 
448 aa  276  7e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  38.15 
 
 
444 aa  259  9e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0594  hemolysin-like protein  37.36 
 
 
477 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2186  CBS domain containing protein  45.73 
 
 
476 aa  239  9e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  37.16 
 
 
434 aa  238  1e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  33.5 
 
 
420 aa  228  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0862  CBS domain protein  45.9 
 
 
499 aa  218  2e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  34.21 
 
 
421 aa  215  9.999999999999999e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  34.45 
 
 
421 aa  214  1.9999999999999998e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  33.59 
 
 
421 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  37.83 
 
 
426 aa  209  1e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  36.46 
 
 
439 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  29.65 
 
 
422 aa  206  4e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1544  CBS domain containing protein  37.83 
 
 
441 aa  207  4e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  36.2 
 
 
447 aa  206  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  37.16 
 
 
420 aa  204  2e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12320  CBS domain-containing protein  39.23 
 
 
441 aa  203  6e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  31.34 
 
 
429 aa  199  7.999999999999999e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  30.64 
 
 
430 aa  197  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  31.21 
 
 
443 aa  197  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  35.93 
 
 
435 aa  197  3e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  30.22 
 
 
455 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  29.83 
 
 
424 aa  197  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  31.65 
 
 
442 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  33.18 
 
 
447 aa  196  6e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  30.79 
 
 
455 aa  196  7e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  31.65 
 
 
442 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  31.65 
 
 
442 aa  196  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 
442 aa  196  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  31.41 
 
 
442 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  31.41 
 
 
442 aa  195  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  29.12 
 
 
424 aa  195  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  31.41 
 
 
442 aa  195  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  28.85 
 
 
424 aa  195  2e-48  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  31.65 
 
 
442 aa  195  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  31.65 
 
 
440 aa  194  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  31.22 
 
 
429 aa  193  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  31.18 
 
 
440 aa  192  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  30.9 
 
 
434 aa  192  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  31.15 
 
 
446 aa  191  1e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  31.86 
 
 
425 aa  192  1e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  29.31 
 
 
414 aa  191  2e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  31.86 
 
 
435 aa  191  2e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  34.43 
 
 
443 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  28.84 
 
 
448 aa  187  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  31.73 
 
 
446 aa  187  3e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  39.79 
 
 
284 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  33.68 
 
 
427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  26.46 
 
 
429 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  32.95 
 
 
470 aa  184  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  37.79 
 
 
296 aa  184  3e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  29.57 
 
 
445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  30.51 
 
 
445 aa  184  4.0000000000000006e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  32.69 
 
 
442 aa  183  5.0000000000000004e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  29.57 
 
 
445 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  31.22 
 
 
417 aa  183  6e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  31.71 
 
 
477 aa  183  7e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  30.81 
 
 
437 aa  182  1e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  30.33 
 
 
437 aa  181  2e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  40.15 
 
 
287 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  40.15 
 
 
287 aa  180  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  30.22 
 
 
464 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 
443 aa  179  5.999999999999999e-44  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  38.68 
 
 
421 aa  179  7e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  31.46 
 
 
443 aa  179  8e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  31.2 
 
 
443 aa  178  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  31.76 
 
 
432 aa  178  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  33.95 
 
 
420 aa  177  2e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  30.67 
 
 
425 aa  177  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  40.08 
 
 
281 aa  177  3e-43  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>