More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1251 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  100 
 
 
435 aa  845    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  70.32 
 
 
457 aa  548  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  61.59 
 
 
461 aa  497  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  58.66 
 
 
437 aa  466  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  56.94 
 
 
436 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  56.94 
 
 
436 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  56.94 
 
 
436 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  57.01 
 
 
435 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  57.34 
 
 
432 aa  457  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  60.14 
 
 
426 aa  449  1e-125  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  57.78 
 
 
432 aa  451  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  55.76 
 
 
430 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  60.63 
 
 
537 aa  436  1e-121  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  60.93 
 
 
464 aa  432  1e-120  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  55.93 
 
 
490 aa  433  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  61.68 
 
 
464 aa  432  1e-120  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  57.79 
 
 
442 aa  426  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  56.94 
 
 
483 aa  419  1e-116  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  56.31 
 
 
425 aa  412  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  53.92 
 
 
434 aa  399  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  52.82 
 
 
452 aa  394  1e-108  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1269  CBS  52.64 
 
 
454 aa  394  1e-108  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  54.5 
 
 
484 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  48.95 
 
 
439 aa  357  1.9999999999999998e-97  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  48.21 
 
 
495 aa  345  7e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  50.65 
 
 
465 aa  324  2e-87  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  47.09 
 
 
438 aa  323  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  45.6 
 
 
443 aa  313  4.999999999999999e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  41.88 
 
 
447 aa  289  6e-77  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  43.33 
 
 
456 aa  272  7e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2186  CBS domain containing protein  45.59 
 
 
476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  40.26 
 
 
448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  31.68 
 
 
420 aa  232  8.000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  34.66 
 
 
421 aa  228  2e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  40 
 
 
444 aa  223  4e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0594  hemolysin-like protein  34.15 
 
 
477 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  36.93 
 
 
439 aa  219  5e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12320  CBS domain-containing protein  38.12 
 
 
441 aa  219  6e-56  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  37.32 
 
 
435 aa  216  8e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  33.68 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  33.33 
 
 
429 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  33.09 
 
 
421 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  33.33 
 
 
421 aa  208  2e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  34.4 
 
 
434 aa  206  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  37.16 
 
 
420 aa  206  1e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  32.3 
 
 
442 aa  202  7e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  32.3 
 
 
442 aa  202  7e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  32.3 
 
 
442 aa  202  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  31.58 
 
 
442 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  33.78 
 
 
447 aa  202  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  32.06 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  33.84 
 
 
426 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 
442 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  32.06 
 
 
442 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  31.82 
 
 
442 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  31.97 
 
 
435 aa  199  6e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  31.94 
 
 
447 aa  199  1.0000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  29.6 
 
 
455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  31.82 
 
 
440 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  30.27 
 
 
430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  31.47 
 
 
437 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  31.65 
 
 
440 aa  196  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0862  CBS domain protein  33.5 
 
 
499 aa  195  1e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  29.14 
 
 
455 aa  194  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  33.66 
 
 
431 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  41.53 
 
 
284 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  32.91 
 
 
417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  29.27 
 
 
429 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  30.02 
 
 
468 aa  191  2.9999999999999997e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  30.91 
 
 
434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  37.45 
 
 
281 aa  189  5.999999999999999e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  30.23 
 
 
443 aa  189  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  30.63 
 
 
443 aa  188  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  26.57 
 
 
443 aa  187  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  33.17 
 
 
447 aa  188  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  28.34 
 
 
424 aa  187  3e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  31.48 
 
 
446 aa  187  3e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  28.21 
 
 
448 aa  187  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  32.69 
 
 
443 aa  187  3e-46  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  32.23 
 
 
437 aa  186  6e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  32.93 
 
 
456 aa  186  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  36.82 
 
 
421 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  37 
 
 
427 aa  185  2.0000000000000003e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  28.57 
 
 
424 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  31.48 
 
 
420 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  30.58 
 
 
446 aa  185  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  26.9 
 
 
422 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  27.7 
 
 
424 aa  183  6e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  29.21 
 
 
451 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  29.21 
 
 
451 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  29.21 
 
 
451 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  29.35 
 
 
443 aa  182  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  31.41 
 
 
432 aa  182  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  28.71 
 
 
443 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  37.54 
 
 
445 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  39.73 
 
 
276 aa  179  5.999999999999999e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  29.17 
 
 
445 aa  179  8e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  42.29 
 
 
296 aa  179  8e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  28.96 
 
 
451 aa  179  1e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  30.32 
 
 
433 aa  177  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>