More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_1000 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  100 
 
 		 287 aa  573  1.0000000000000001e-163  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  98.95 
 
 		 287 aa  568  1e-161  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  65.37 
 
 		 284 aa  365  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  61.27 
 
 		 284 aa  364  1e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  53.74 
 
 		 296 aa  336  2.9999999999999997e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  55.84 
 
 		 284 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  68.05 
 
 		 250 aa  309  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  53.79 
 
 		 285 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  43.24 
 
 		 276 aa  237  2e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  44.15 
 
 		 420 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  44.18 
 
 		 447 aa  219  3.9999999999999997e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  40.14 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  40.14 
 
 		 311 aa  211  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  41.09 
 
 		 273 aa  208  8e-53  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  40.48 
 
 		 298 aa  207  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  40.16 
 
 		 434 aa  203  3e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  41.37 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  41 
 
 		 439 aa  201  9e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  39.86 
 
 		 309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  40.58 
 
 		 437 aa  200  3e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  39.58 
 
 		 309 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  40.07 
 
 		 295 aa  198  7e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  38.21 
 
 		 465 aa  198  7.999999999999999e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  40.53 
 
 		 298 aa  198  9e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  42.25 
 
 		 425 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.5 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  40.08 
 
 		 464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.59 
 
 		 403 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.5 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.5 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.5 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.5 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.5 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.5 
 
 		 295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  42.08 
 
 		 434 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  39.34 
 
 		 285 aa  195  6e-49  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  43.27 
 
 		 421 aa  195  6e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  39.78 
 
 		 295 aa  195  7e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  40.94 
 
 		 311 aa  195  7e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  38.85 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  38.85 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  39.83 
 
 		 259 aa  194  2e-48  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  37.72 
 
 		 281 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  39.71 
 
 		 275 aa  193  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  38.85 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  38.85 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  39.21 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  38.85 
 
 		 295 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  39.62 
 
 		 464 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  40.25 
 
 		 258 aa  192  6e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  38.55 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  39.39 
 
 		 435 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  37.28 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  40.8 
 
 		 424 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  41.83 
 
 		 452 aa  189  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  36.36 
 
 		 442 aa  188  9e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3530  CBS:transporter-associated region  38.81 
 
 		 282 aa  188  1e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0231073 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  38.18 
 
 		 293 aa  187  1e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1861  CBS domain-containing protein  38.87 
 
 		 279 aa  187  1e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  37.59 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  35 
 
 		 464 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  36.03 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  37.59 
 
 		 291 aa  187  2e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  35 
 
 		 464 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  37.64 
 
 		 443 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  35 
 
 		 464 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  39.53 
 
 		 468 aa  186  3e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  37 
 
 		 430 aa  186  3e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  37.5 
 
 		 279 aa  186  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  36.61 
 
 		 291 aa  186  3e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  37.98 
 
 		 285 aa  186  4e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  35.35 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 		 291 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 		 291 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 		 291 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  36.26 
 
 		 291 aa  186  6e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  35.66 
 
 		 291 aa  186  6e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  39.11 
 
 		 371 aa  185  7e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  37.74 
 
 		 432 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  34.51 
 
 		 454 aa  184  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  36.54 
 
 		 292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  40.15 
 
 		 439 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  34.93 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  34.93 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  40.38 
 
 		 434 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  34.74 
 
 		 291 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  39.62 
 
 		 470 aa  183  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  34.52 
 
 		 286 aa  183  3e-45  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0511  CBS:transporter-associated region  37.5 
 
 		 293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  36.44 
 
 		 417 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  39.52 
 
 		 423 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  34.56 
 
 		 291 aa  182  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  36.15 
 
 		 292 aa  181  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.93 
 
 		 284 aa  181  1e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  40.47 
 
 		 490 aa  181  1e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.19 
 
 		 291 aa  180  2e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09040  CBS domain-containing transporter  39.11 
 
 		 280 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157725  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  38.67 
 
 		 421 aa  180  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  33.46 
 
 		 285 aa  180  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  40.15 
 
 		 430 aa  180  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>