More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1936 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  100 
 
 		 371 aa  739    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  64.58 
 
 		 275 aa  348  1e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  61.82 
 
 		 273 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  55.47 
 
 		 298 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  50.19 
 
 		 273 aa  265  7e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  48.72 
 
 		 285 aa  259  6e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  40.36 
 
 		 291 aa  195  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  40.22 
 
 		 291 aa  194  2e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  40.82 
 
 		 291 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  40.82 
 
 		 291 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  40.82 
 
 		 291 aa  192  6e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  39.08 
 
 		 291 aa  192  9e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  40.36 
 
 		 291 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  40.36 
 
 		 291 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  40.36 
 
 		 291 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  40.36 
 
 		 291 aa  192  1e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.81 
 
 		 292 aa  191  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  40.67 
 
 		 291 aa  191  2e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.07 
 
 		 291 aa  190  4e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  38.81 
 
 		 287 aa  189  8e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  40.61 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  36.88 
 
 		 292 aa  187  2e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  39.11 
 
 		 287 aa  185  8e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  46.46 
 
 		 439 aa  185  9e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  37.73 
 
 		 281 aa  185  1.0000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.68 
 
 		 284 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  39.61 
 
 		 420 aa  182  7e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  39.05 
 
 		 291 aa  182  9.000000000000001e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  42.75 
 
 		 285 aa  181  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  37.41 
 
 		 293 aa  181  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  39.93 
 
 		 291 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  39.3 
 
 		 309 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  35.9 
 
 		 279 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 		 279 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 		 279 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  40.98 
 
 		 309 aa  179  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.74 
 
 		 299 aa  179  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1498  magnesium and cobalt efflux protein  38.32 
 
 		 283 aa  178  1e-43  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  35.9 
 
 		 279 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  37.45 
 
 		 279 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  43.37 
 
 		 435 aa  176  4e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  36.13 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  37.09 
 
 		 279 aa  176  4e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  42.86 
 
 		 298 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  36.7 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0679  putative magnesium and cobalt efflux protein corC  37.96 
 
 		 279 aa  176  7e-43  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  35.9 
 
 		 279 aa  176  8e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  38.67 
 
 		 434 aa  176  9e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  40.29 
 
 		 291 aa  176  9e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  40.29 
 
 		 291 aa  175  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  37 
 
 		 291 aa  175  9.999999999999999e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4209  CBS domain-containing protein  38.22 
 
 		 284 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  41.54 
 
 		 295 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  39.03 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  35.53 
 
 		 280 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  39.77 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  35.53 
 
 		 280 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  38.01 
 
 		 279 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  37.23 
 
 		 322 aa  172  7.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  42.22 
 
 		 250 aa  172  1e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  38.75 
 
 		 421 aa  171  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  36.79 
 
 		 428 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  42.98 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.35 
 
 		 403 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  38.75 
 
 		 421 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  39.53 
 
 		 299 aa  171  2e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  36.89 
 
 		 311 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2317  protein of unknown function DUF21  40.77 
 
 		 438 aa  171  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00842677 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.35 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.35 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.35 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.35 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  37.36 
 
 		 424 aa  170  5e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.35 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.35 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  36.86 
 
 		 285 aa  169  6e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1271  CBS domain-containing protein  40.74 
 
 		 307 aa  168  1e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.97 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0492  hypothetical protein  38.15 
 
 		 450 aa  168  1e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  35.79 
 
 		 285 aa  168  2e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3530  CBS:transporter-associated region  37.22 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0231073 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  37.69 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 		 298 aa  167  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0376  CBS domain containing protein  38.37 
 
 		 404 aa  166  4e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  37.5 
 
 		 311 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  38.65 
 
 		 436 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  37.41 
 
 		 440 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0439  CBS domain-containing protein  37.65 
 
 		 289 aa  167  4e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.478543  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  34.96 
 
 		 292 aa  166  5e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  37.55 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  36.9 
 
 		 284 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  37.55 
 
 		 295 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  34.59 
 
 		 292 aa  166  5.9999999999999996e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2235  CBS domain containing protein  39.09 
 
 		 439 aa  166  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  40.55 
 
 		 434 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  38.89 
 
 		 295 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2289  Mg2+/Co2+ transporter  39.24 
 
 		 289 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  36.67 
 
 		 276 aa  166  5.9999999999999996e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3698  CBS  39.25 
 
 		 288 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  37.5 
 
 		 311 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>