More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0553 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  100 
 
 		 273 aa  547  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  72.69 
 
 		 275 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  67.04 
 
 		 298 aa  365  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  61.82 
 
 		 371 aa  331  8e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  52.01 
 
 		 285 aa  285  4e-76  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  53.16 
 
 		 273 aa  277  1e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  47.95 
 
 		 284 aa  214  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  41.7 
 
 		 287 aa  210  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  41.09 
 
 		 287 aa  208  7e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  40.59 
 
 		 296 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  46.72 
 
 		 250 aa  199  5e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  45.8 
 
 		 420 aa  195  6e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  44 
 
 		 443 aa  193  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  41.97 
 
 		 284 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  42.96 
 
 		 311 aa  191  9e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  45.98 
 
 		 285 aa  189  4e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  37.04 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 		 279 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  41.84 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  38.15 
 
 		 280 aa  186  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 		 279 aa  186  5e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  37.41 
 
 		 279 aa  185  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  39.63 
 
 		 291 aa  185  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  39.63 
 
 		 291 aa  185  9e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  38.15 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  42.26 
 
 		 295 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  42.62 
 
 		 430 aa  182  7e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  37.73 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  38.65 
 
 		 291 aa  181  1e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  42.06 
 
 		 424 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  38.02 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  38.02 
 
 		 291 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.02 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  37.12 
 
 		 279 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  38.02 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3530  CBS:transporter-associated region  37 
 
 		 282 aa  178  8e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0231073 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  37.41 
 
 		 279 aa  178  8e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  37.69 
 
 		 281 aa  178  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  35.94 
 
 		 434 aa  178  1e-43  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  37.04 
 
 		 279 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  38.59 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  39.48 
 
 		 293 aa  176  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 		 291 aa  176  5e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.98 
 
 		 292 aa  176  5e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  36.5 
 
 		 418 aa  175  7e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  39.18 
 
 		 291 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4209  CBS domain-containing protein  37.01 
 
 		 284 aa  174  9.999999999999999e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  37.45 
 
 		 440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.57 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  39.66 
 
 		 298 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.57 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.57 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.57 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.57 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1565  transporter-associated region  38.49 
 
 		 284 aa  173  2.9999999999999996e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  39.66 
 
 		 309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.57 
 
 		 295 aa  173  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  38.38 
 
 		 279 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  36.5 
 
 		 291 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0511  CBS:transporter-associated region  41 
 
 		 293 aa  172  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.57 
 
 		 403 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3773  CBS domain-containing protein  41.79 
 
 		 318 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.163853  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1271  CBS domain-containing protein  37.94 
 
 		 307 aa  172  5e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  39.66 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  39.1 
 
 		 446 aa  172  5.999999999999999e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  40.81 
 
 		 447 aa  172  6.999999999999999e-42  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  40.82 
 
 		 295 aa  171  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  41.39 
 
 		 298 aa  171  9e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.16 
 
 		 295 aa  171  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  40.82 
 
 		 295 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1861  CBS domain-containing protein  38.4 
 
 		 279 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  37.97 
 
 		 292 aa  171  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  36.88 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  35.98 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  36.88 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09040  CBS domain-containing transporter  39.05 
 
 		 280 aa  170  2e-41  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157725  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  35.36 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  40.41 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  40.41 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  40.41 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  36.88 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  36.88 
 
 		 291 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2157  CBS domain-containing protein  38.62 
 
 		 291 aa  169  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  35.98 
 
 		 276 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.16 
 
 		 299 aa  169  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2391  CBS domain-containing protein  41.6 
 
 		 322 aa  169  4e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  37.31 
 
 		 293 aa  169  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0095  CBS domain containing protein  40.08 
 
 		 416 aa  169  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  40 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  40 
 
 		 295 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  39.75 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1278  hypothetical protein  36.58 
 
 		 450 aa  169  6e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00305135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  40.65 
 
 		 311 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1886  CBS domain-containing protein  38.49 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.112037  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1951  magnesium and cobalt efflux protein  39.33 
 
 		 323 aa  168  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  44.29 
 
 		 425 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  42.57 
 
 		 439 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4185  CBS domain-containing protein  37.11 
 
 		 294 aa  167  2e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718893 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.78 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>