More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0528 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  100 
 
 		 298 aa  597  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  94.3 
 
 		 309 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  93.62 
 
 		 309 aa  560  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  77.63 
 
 		 295 aa  463  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0511  CBS:transporter-associated region  81.14 
 
 		 293 aa  456  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  79.64 
 
 		 295 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  76.45 
 
 		 295 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  76.45 
 
 		 295 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  76.45 
 
 		 295 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  79.29 
 
 		 295 aa  448  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  76.79 
 
 		 295 aa  450  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  76.45 
 
 		 295 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  78.57 
 
 		 311 aa  447  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  78.93 
 
 		 311 aa  450  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  76.45 
 
 		 295 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  76.45 
 
 		 295 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  76.45 
 
 		 403 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  78.93 
 
 		 295 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  74.92 
 
 		 295 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  74.92 
 
 		 295 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  78.29 
 
 		 298 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  78.93 
 
 		 295 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  78.93 
 
 		 295 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1861  CBS domain-containing protein  62.68 
 
 		 279 aa  351  8.999999999999999e-96  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2698  transporter-associated region  62.09 
 
 		 278 aa  345  4e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1565  transporter-associated region  63.33 
 
 		 284 aa  345  4e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  61.17 
 
 		 285 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  61.96 
 
 		 279 aa  335  5.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3530  CBS:transporter-associated region  59.36 
 
 		 282 aa  334  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0231073 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0648  CBS  58.04 
 
 		 286 aa  307  1.0000000000000001e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2289  Mg2+/Co2+ transporter  53.21 
 
 		 289 aa  293  3e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  50.33 
 
 		 311 aa  288  7e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  53.9 
 
 		 279 aa  287  2e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  53.53 
 
 		 279 aa  286  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  52.04 
 
 		 279 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  52.04 
 
 		 279 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  52.04 
 
 		 279 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  52.42 
 
 		 279 aa  285  9e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  52.71 
 
 		 291 aa  280  2e-74  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  51.3 
 
 		 279 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  51.3 
 
 		 279 aa  280  2e-74  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  52.46 
 
 		 291 aa  276  2e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  50.9 
 
 		 280 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  50.54 
 
 		 280 aa  275  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  50.9 
 
 		 281 aa  271  8.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  49.49 
 
 		 292 aa  268  7e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  49.11 
 
 		 291 aa  268  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0679  putative magnesium and cobalt efflux protein corC  50.72 
 
 		 279 aa  268  1e-70  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1498  magnesium and cobalt efflux protein  50.72 
 
 		 283 aa  267  1e-70  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  49.47 
 
 		 293 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  50.18 
 
 		 291 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  51.46 
 
 		 291 aa  266  5e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4763  CBS domain containing protein  50.17 
 
 		 292 aa  263  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101008  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4209  CBS domain-containing protein  49.82 
 
 		 284 aa  261  6.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  46.78 
 
 		 292 aa  261  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  51.06 
 
 		 293 aa  259  3e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3833  CBS domain-containing protein  48.59 
 
 		 306 aa  258  6e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  53.73 
 
 		 284 aa  258  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3385  transport protein  47.69 
 
 		 306 aa  258  7e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.428811 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0539  CBS domain containing protein  46.96 
 
 		 292 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  48.04 
 
 		 291 aa  257  1e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  46.59 
 
 		 285 aa  256  2e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0523  CBS domain-containing protein  46.96 
 
 		 306 aa  257  2e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0257168 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3698  CBS  46.92 
 
 		 288 aa  256  5e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  47.69 
 
 		 291 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  47.69 
 
 		 291 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  47.33 
 
 		 291 aa  252  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  48.04 
 
 		 291 aa  252  6e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  47.69 
 
 		 291 aa  250  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  47.33 
 
 		 292 aa  249  3e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0439  CBS domain-containing protein  47.25 
 
 		 289 aa  249  4e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.478543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  47.06 
 
 		 291 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  47.06 
 
 		 291 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  47.06 
 
 		 291 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  47.06 
 
 		 291 aa  248  7e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  45.74 
 
 		 299 aa  247  1e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  46.95 
 
 		 292 aa  246  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2157  CBS domain-containing protein  47.24 
 
 		 291 aa  247  2e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  48.08 
 
 		 291 aa  246  4e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  48.08 
 
 		 291 aa  246  4.9999999999999997e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1271  CBS domain-containing protein  47.52 
 
 		 307 aa  246  4.9999999999999997e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  46.56 
 
 		 292 aa  244  9e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00451  polar amino acid transporter  50.53 
 
 		 292 aa  241  7e-63  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0391689  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  44.09 
 
 		 286 aa  241  1e-62  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4185  CBS domain-containing protein  45.97 
 
 		 294 aa  239  4e-62  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718893 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09040  CBS domain-containing transporter  49.81 
 
 		 280 aa  239  5.999999999999999e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157725  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1886  CBS domain-containing protein  45.15 
 
 		 323 aa  236  3e-61  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.112037  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1951  magnesium and cobalt efflux protein  45.52 
 
 		 323 aa  235  6e-61  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2337  putative metal ion transporter  48.23 
 
 		 296 aa  229  3e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3575  magnesium and cobalt efflux protein CorC  44.09 
 
 		 292 aa  229  6e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  42.35 
 
 		 299 aa  229  6e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01227  hypothetical protein  48.86 
 
 		 299 aa  227  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0481  putative hemolysin  44.96 
 
 		 291 aa  226  2e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00948682  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0993  hemolysin  46.04 
 
 		 291 aa  224  2e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0803506  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0532  Mg2+/Co2+ transporter  46.13 
 
 		 286 aa  220  1.9999999999999999e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.174444  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0476  transporter-associated region  47.37 
 
 		 320 aa  220  3e-56  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0237  magnesium and cobalt efflux protein  48.78 
 
 		 297 aa  215  5.9999999999999996e-55  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.911698  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3303  hypothetical protein  47.84 
 
 		 292 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1184  CBS domain-containing protein  46.72 
 
 		 292 aa  213  1.9999999999999998e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2912  CBS domain-containing protein  44.4 
 
 		 288 aa  213  3.9999999999999995e-54  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>