More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_4763 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_4763  CBS domain containing protein  100 
 
 		 292 aa  578  1e-164  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101008  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4209  CBS domain-containing protein  83.45 
 
 		 284 aa  477  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0439  CBS domain-containing protein  78.5 
 
 		 289 aa  457  9.999999999999999e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.478543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3698  CBS  78.52 
 
 		 288 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1271  CBS domain-containing protein  79.79 
 
 		 307 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4185  CBS domain-containing protein  77.19 
 
 		 294 aa  442  1e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.718893 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2157  CBS domain-containing protein  75.34 
 
 		 291 aa  430  1e-119  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0539  CBS domain containing protein  71.88 
 
 		 292 aa  427  1e-118  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0523  CBS domain-containing protein  71.18 
 
 		 306 aa  423  1e-117  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0257168 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3385  transport protein  64.83 
 
 		 306 aa  363  2e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.428811 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3833  CBS domain-containing protein  63.09 
 
 		 306 aa  353  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  51.4 
 
 		 295 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  49.83 
 
 		 309 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0511  CBS:transporter-associated region  50.7 
 
 		 293 aa  264  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  50.88 
 
 		 298 aa  261  6.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  49.49 
 
 		 309 aa  261  1e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  51.67 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  51.3 
 
 		 295 aa  258  9e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  51.67 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  50.93 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  50.93 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  50.93 
 
 		 295 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  49.08 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  47.54 
 
 		 298 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  50.56 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  50.56 
 
 		 295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  49.08 
 
 		 311 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  50.93 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  50.93 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  50.93 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  50.93 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  50.93 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  50.93 
 
 		 295 aa  252  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  50.55 
 
 		 403 aa  251  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  46.01 
 
 		 285 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3530  CBS:transporter-associated region  42.55 
 
 		 282 aa  231  1e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0231073 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  45.14 
 
 		 293 aa  225  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  47.58 
 
 		 279 aa  224  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  48.26 
 
 		 291 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  44.75 
 
 		 284 aa  222  7e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1565  transporter-associated region  45.35 
 
 		 284 aa  222  7e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1861  CBS domain-containing protein  46.9 
 
 		 279 aa  221  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  43.01 
 
 		 281 aa  220  1.9999999999999999e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2698  transporter-associated region  45.42 
 
 		 278 aa  219  3e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0648  CBS  47.12 
 
 		 286 aa  218  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  43.07 
 
 		 291 aa  218  6e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  44.49 
 
 		 279 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  44.49 
 
 		 279 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  44.49 
 
 		 279 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  44.73 
 
 		 279 aa  218  8.999999999999998e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  45.26 
 
 		 279 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  44.53 
 
 		 279 aa  217  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  45.93 
 
 		 311 aa  217  2e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  43.27 
 
 		 291 aa  217  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  42.7 
 
 		 291 aa  216  4e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  43.12 
 
 		 286 aa  216  5e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  46.18 
 
 		 280 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  42.09 
 
 		 292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1498  magnesium and cobalt efflux protein  41.55 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  45.09 
 
 		 280 aa  211  7.999999999999999e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  44.16 
 
 		 279 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0679  putative magnesium and cobalt efflux protein corC  41.55 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  43.8 
 
 		 279 aa  210  2e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  41.85 
 
 		 299 aa  209  4e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  40.73 
 
 		 293 aa  209  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  38.77 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00451  polar amino acid transporter  46.35 
 
 		 292 aa  206  4e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0391689  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 		 292 aa  205  9e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  41.48 
 
 		 285 aa  204  2e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  38.41 
 
 		 292 aa  203  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1886  CBS domain-containing protein  41.24 
 
 		 323 aa  202  4e-51  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.112037  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1951  magnesium and cobalt efflux protein  41.61 
 
 		 323 aa  202  5e-51  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2289  Mg2+/Co2+ transporter  42.75 
 
 		 289 aa  202  6e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 291 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  40 
 
 		 291 aa  200  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09040  CBS domain-containing transporter  45.09 
 
 		 280 aa  199  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157725  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.64 
 
 		 291 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  38.38 
 
 		 291 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  38.38 
 
 		 291 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  38.38 
 
 		 291 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  38.38 
 
 		 291 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  38.91 
 
 		 292 aa  198  9e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0481  putative hemolysin  41.54 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00948682  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  43.58 
 
 		 291 aa  196  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  41.01 
 
 		 291 aa  195  9e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  41.01 
 
 		 291 aa  194  1e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0237  magnesium and cobalt efflux protein  39.86 
 
 		 297 aa  190  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.911698  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  40.96 
 
 		 291 aa  188  7e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0821  magnesium and cobalt efflux protein CorC  43.97 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1184  CBS domain-containing protein  43.97 
 
 		 292 aa  186  3e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0632091 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0993  hemolysin  40.43 
 
 		 291 aa  186  4e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0803506  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2968  transporter-associated region  43.8 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.386789  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0589  magnesium and cobalt efflux protein CorC  43.8 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.315177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2337  putative metal ion transporter  40.23 
 
 		 296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2987  transporter-associated region  43.8 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0751  magnesium and cobalt efflux protein CorC  43.8 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.062635  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0705  magnesium and cobalt efflux protein CorC  43.8 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.505842  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0680  magnesium and cobalt efflux protein CorC  43.8 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.262474  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>