More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0523 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008782  Ajs_0523  CBS domain-containing protein  100 
 
 
306 aa  611  9.999999999999999e-175  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0257168 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0539  CBS domain containing protein  99.32 
 
 
292 aa  580  1.0000000000000001e-165  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4185  CBS domain-containing protein  79.58 
 
 
294 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.718893 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1271  CBS domain-containing protein  72.47 
 
 
307 aa  432  1e-120  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4763  CBS domain containing protein  71.18 
 
 
292 aa  423  1e-117  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.101008  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2157  CBS domain-containing protein  70.38 
 
 
291 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3698  CBS  71.02 
 
 
288 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4209  CBS domain-containing protein  68.18 
 
 
284 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0439  CBS domain-containing protein  64.95 
 
 
289 aa  391  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.478543  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3833  CBS domain-containing protein  58.33 
 
 
306 aa  348  6e-95  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.695981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3385  transport protein  58.31 
 
 
306 aa  343  2e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.965789  normal  0.428811 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  47.42 
 
 
295 aa  258  6e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  43.69 
 
 
311 aa  256  5e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  47.35 
 
 
298 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  43.37 
 
 
311 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  47 
 
 
309 aa  251  8.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0511  CBS:transporter-associated region  47.08 
 
 
293 aa  251  9.000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.893531  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  47 
 
 
309 aa  250  2e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  43.73 
 
 
298 aa  250  2e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  45.17 
 
 
295 aa  248  7e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  42.86 
 
 
295 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  42.86 
 
 
295 aa  244  9e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  44.48 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  44.48 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  44.48 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  43.2 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  44.48 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  44.48 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  44.48 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  46.3 
 
 
403 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  43.2 
 
 
295 aa  243  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  42.86 
 
 
295 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 
295 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  42.86 
 
 
295 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3530  CBS:transporter-associated region  42.86 
 
 
282 aa  226  3e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0231073 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  42.55 
 
 
285 aa  226  4e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1861  CBS domain-containing protein  43.8 
 
 
279 aa  217  2e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  43.17 
 
 
279 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1565  transporter-associated region  39.93 
 
 
284 aa  215  8e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2698  transporter-associated region  43.08 
 
 
278 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  38.75 
 
 
281 aa  209  7e-53  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0648  CBS  43.73 
 
 
286 aa  206  4e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  42.76 
 
 
293 aa  205  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1456  magnesium and cobalt efflux protein CorC  42.02 
 
 
284 aa  204  1e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00173357  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1498  magnesium and cobalt efflux protein  39.22 
 
 
283 aa  203  4e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  41.64 
 
 
291 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0679  putative magnesium and cobalt efflux protein corC  39.22 
 
 
279 aa  201  9.999999999999999e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2136  CBS domain containing protein  38.28 
 
 
311 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0496158  normal  0.0714936 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  38.87 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.02 
 
 
292 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  39 
 
 
291 aa  195  9e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1951  magnesium and cobalt efflux protein  36.9 
 
 
323 aa  193  3e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1886  CBS domain-containing protein  36.55 
 
 
323 aa  193  3e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.112037  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 
291 aa  193  3e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00451  polar amino acid transporter  43.8 
 
 
292 aa  193  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0391689  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.54 
 
 
299 aa  192  4e-48  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  41.7 
 
 
291 aa  192  5e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  39.78 
 
 
291 aa  192  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  38.08 
 
 
292 aa  192  6e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2289  Mg2+/Co2+ transporter  39.78 
 
 
289 aa  191  1e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.977509  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  39.05 
 
 
291 aa  191  1e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  38.85 
 
 
291 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  38.85 
 
 
291 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  38.85 
 
 
291 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  38.85 
 
 
291 aa  189  4e-47  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  39.86 
 
 
291 aa  189  5e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  37.69 
 
 
293 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.35 
 
 
291 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  37.59 
 
 
292 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  39.5 
 
 
291 aa  187  1e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  38.18 
 
 
291 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  38.18 
 
 
291 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  38.18 
 
 
291 aa  187  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  37.87 
 
 
279 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  37.87 
 
 
279 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  37.87 
 
 
279 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2209  CBS domain-containing protein  38.25 
 
 
286 aa  186  6e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  37.87 
 
 
279 aa  185  7e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  39.11 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3782  CBS domain-containing protein  36 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.964712  normal  0.253 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  35.06 
 
 
292 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  38.75 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  36.86 
 
 
279 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  37.96 
 
 
280 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  38.32 
 
 
280 aa  182  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  34.69 
 
 
292 aa  181  9.000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0481  putative hemolysin  39.77 
 
 
291 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00948682  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0237  magnesium and cobalt efflux protein  38.52 
 
 
297 aa  176  6e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.911698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  37.27 
 
 
284 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  37.9 
 
 
298 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09040  CBS domain-containing transporter  39.19 
 
 
280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157725  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  35 
 
 
287 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2337  putative metal ion transporter  36.49 
 
 
296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1181  CBS domain containing protein  38.78 
 
 
299 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  34.62 
 
 
287 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  36.46 
 
 
275 aa  170  3e-41  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0993  hemolysin  36.79 
 
 
291 aa  167  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0803506  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  38 
 
 
273 aa  166  4e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01227  hypothetical protein  36.49 
 
 
299 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>