More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1867 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  100 
 
 		 285 aa  582  1.0000000000000001e-165  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  55.76 
 
 		 273 aa  308  8e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  52.03 
 
 		 298 aa  298  7e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1330  CBS domain-containing protein  49.82 
 
 		 275 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.964649  normal  0.0685098 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  52.01 
 
 		 273 aa  285  4e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1936  CBS domain containing protein  48.72 
 
 		 371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  41.03 
 
 		 284 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  39.43 
 
 		 285 aa  200  3e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  41.22 
 
 		 284 aa  199  3.9999999999999996e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  39.34 
 
 		 287 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  39.34 
 
 		 287 aa  195  6e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  44.1 
 
 		 250 aa  190  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  40.98 
 
 		 430 aa  187  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  39.68 
 
 		 420 aa  186  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  39.48 
 
 		 483 aa  184  2.0000000000000003e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  40.98 
 
 		 421 aa  183  3e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  45.77 
 
 		 435 aa  182  7e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  45.5 
 
 		 439 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.9 
 
 		 291 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  38.68 
 
 		 434 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  37.27 
 
 		 291 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  36.9 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  36.9 
 
 		 291 aa  177  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  42.48 
 
 		 447 aa  178  1e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  34.78 
 
 		 296 aa  177  2e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  37.02 
 
 		 443 aa  174  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004214  magnesium and cobalt efflux protein CorC  35.61 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.990364  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  36.78 
 
 		 291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  37.04 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  37.04 
 
 		 291 aa  172  5e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  37.55 
 
 		 276 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  34.8 
 
 		 432 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  38.37 
 
 		 446 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  36.03 
 
 		 279 aa  170  2e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  36.65 
 
 		 443 aa  169  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  39.74 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  34.52 
 
 		 291 aa  170  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0481  putative hemolysin  35.25 
 
 		 291 aa  169  3e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00948682  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0821  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.55 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  34.88 
 
 		 292 aa  170  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  42.72 
 
 		 447 aa  169  4e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  35.85 
 
 		 447 aa  169  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0812  CBS:transporter associated  35.98 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1194  transporter-associated region  37.17 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3952  CBS domain-containing protein  38.79 
 
 		 423 aa  169  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173559 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0710  CBS domain-containing protein  35.56 
 
 		 292 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.592544  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2918  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.43 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0300566  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1833  magnesium and cobalt efflux protein CorC  36.43 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3008  transporter-associated region  36.43 
 
 		 292 aa  169  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.983177  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3137  transporter-associated region  36.8 
 
 		 292 aa  168  7e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1216  transporter-associated region  36.8 
 
 		 292 aa  169  7e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.14368  normal  0.614507 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  35.16 
 
 		 291 aa  168  9e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  35.98 
 
 		 293 aa  167  2e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0726  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.17 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.93581 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  38.3 
 
 		 439 aa  167  2e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0785  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.17 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.971791  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0711  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.17 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.037434  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  39.26 
 
 		 435 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0237  magnesium and cobalt efflux protein  34.44 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.911698  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  42.93 
 
 		 427 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2951  CBS domain containing protein  36.7 
 
 		 289 aa  167  2e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.652307  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0772  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.17 
 
 		 292 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  40.7 
 
 		 284 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  35.34 
 
 		 428 aa  166  2.9999999999999998e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00626  predicted ion transport  37.17 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2968  transporter-associated region  37.17 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.386789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0705  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.17 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.505842  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0687  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.17 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00083151  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0751  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.17 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.062635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0680  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.17 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.262474  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00617  hypothetical protein  37.17 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2987  transporter-associated region  37.17 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.184587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0589  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.17 
 
 		 292 aa  166  4e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.315177  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3620  CBS domain-containing protein  38.59 
 
 		 319 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  36.76 
 
 		 442 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  40.32 
 
 		 537 aa  165  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2926  CBS domain-containing protein  37.71 
 
 		 291 aa  165  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00659921 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  35.16 
 
 		 465 aa  165  9e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  37.28 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1349  CBS domain containing protein  36.5 
 
 		 293 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.038929  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0272  CBS domain-containing protein  35.94 
 
 		 419 aa  164  1.0000000000000001e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  41.62 
 
 		 455 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3474  CBS domain-containing protein  35.06 
 
 		 291 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.42  hitchhiker  0.00607831 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  36.16 
 
 		 464 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  41.62 
 
 		 455 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  36.89 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  35.4 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  37.6 
 
 		 445 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  36.86 
 
 		 433 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  35.4 
 
 		 295 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1105  transporter-associated region  40.89 
 
 		 289 aa  164  2.0000000000000002e-39  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  37.31 
 
 		 490 aa  163  3e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3839  hypothetical protein  38.86 
 
 		 425 aa  163  3e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  34.67 
 
 		 279 aa  163  3e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00451  polar amino acid transporter  37.91 
 
 		 292 aa  163  3e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0391689  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  38.63 
 
 		 285 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  37.96 
 
 		 421 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  35.93 
 
 		 281 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>