More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0252 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
434 aa  864    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  57.04 
 
 
433 aa  443  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  42.08 
 
 
440 aa  323  2e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0561  protein of unknown function DUF21  41.35 
 
 
498 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453215  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  46.4 
 
 
445 aa  319  7e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  45.91 
 
 
445 aa  315  9e-85  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  42.13 
 
 
429 aa  306  4.0000000000000004e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  38.42 
 
 
465 aa  301  2e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  38.07 
 
 
447 aa  290  3e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  40.3 
 
 
420 aa  288  9e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  37.8 
 
 
487 aa  287  2.9999999999999996e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  38.48 
 
 
445 aa  281  1e-74  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  39.1 
 
 
479 aa  281  2e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  37.31 
 
 
431 aa  280  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  34.29 
 
 
431 aa  278  2e-73  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  33.8 
 
 
441 aa  274  2.0000000000000002e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  36.11 
 
 
446 aa  269  5.9999999999999995e-71  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  31.85 
 
 
444 aa  268  1e-70  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  35.32 
 
 
447 aa  265  1e-69  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  34.98 
 
 
432 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  33.41 
 
 
437 aa  259  8e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  35.18 
 
 
446 aa  256  6e-67  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  35.31 
 
 
439 aa  256  8e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  34.25 
 
 
533 aa  255  1.0000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1399  CBS domain-containing protein  36.65 
 
 
444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  31.53 
 
 
453 aa  252  1e-65  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  34.68 
 
 
433 aa  252  1e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  34.62 
 
 
439 aa  251  2e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  34.96 
 
 
417 aa  251  2e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  32.55 
 
 
440 aa  251  2e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  34.23 
 
 
555 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  33.72 
 
 
434 aa  248  1e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  35.65 
 
 
444 aa  246  6e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  36.47 
 
 
434 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  34.31 
 
 
456 aa  244  3e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  36.95 
 
 
443 aa  243  6e-63  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  31.99 
 
 
454 aa  242  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  32.1 
 
 
436 aa  242  9e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1858  protein of unknown function DUF21  30.68 
 
 
434 aa  241  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  32.62 
 
 
442 aa  241  1e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  35.7 
 
 
421 aa  242  1e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  31.81 
 
 
437 aa  241  1e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  30.94 
 
 
443 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  30.94 
 
 
443 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0703  protein of unknown function DUF21  31.82 
 
 
477 aa  241  2e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.401824 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  36.71 
 
 
430 aa  241  2e-62  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0148  protein of unknown function DUF21  32.64 
 
 
421 aa  240  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  32.71 
 
 
443 aa  239  6.999999999999999e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  36.17 
 
 
414 aa  238  1e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0947  hypothetical protein  31.29 
 
 
432 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  33.1 
 
 
443 aa  238  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  34.54 
 
 
445 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  30.57 
 
 
447 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2633  protein of unknown function DUF21  34.57 
 
 
425 aa  236  4e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0915  protein of unknown function DUF21  29.8 
 
 
460 aa  236  4e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280711  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2040  hypothetical protein  31.25 
 
 
418 aa  237  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  31.35 
 
 
448 aa  236  5.0000000000000005e-61  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  31.16 
 
 
432 aa  236  5.0000000000000005e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  33.95 
 
 
422 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  32.2 
 
 
443 aa  236  7e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  36.18 
 
 
438 aa  236  8e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  34.76 
 
 
425 aa  236  8e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  35.68 
 
 
455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  34.19 
 
 
437 aa  235  1.0000000000000001e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  32.33 
 
 
468 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  34.54 
 
 
439 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  30.48 
 
 
464 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1099  hypothetical protein  33.08 
 
 
425 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1116  hypothetical protein  33.08 
 
 
425 aa  234  3e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  31.37 
 
 
430 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  34.73 
 
 
424 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  30.25 
 
 
432 aa  233  5e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  33.41 
 
 
441 aa  233  5e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  32.52 
 
 
456 aa  233  5e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  33.17 
 
 
429 aa  233  5e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  33.1 
 
 
424 aa  233  7.000000000000001e-60  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02510  CBS domain-containing protein  30.55 
 
 
470 aa  233  7.000000000000001e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  35.29 
 
 
455 aa  232  8.000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  32 
 
 
438 aa  232  8.000000000000001e-60  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  32.56 
 
 
440 aa  232  1e-59  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  30.8 
 
 
433 aa  232  1e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  32.23 
 
 
437 aa  232  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  33.09 
 
 
429 aa  232  1e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  30.9 
 
 
464 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  33.26 
 
 
441 aa  231  1e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  34.61 
 
 
443 aa  232  1e-59  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  32.1 
 
 
440 aa  232  1e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  32.87 
 
 
424 aa  232  1e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1127  hypothetical protein  32.83 
 
 
425 aa  231  1e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0419  hypothetical protein  32.84 
 
 
407 aa  231  2e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  31.93 
 
 
440 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  32.64 
 
 
441 aa  231  2e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  37.06 
 
 
421 aa  231  2e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  32.18 
 
 
424 aa  231  3e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  36.8 
 
 
421 aa  230  3e-59  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  33.18 
 
 
441 aa  230  3e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  31.25 
 
 
442 aa  230  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  31.12 
 
 
433 aa  227  3e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  32.39 
 
 
460 aa  227  3e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  31.7 
 
 
442 aa  226  5.0000000000000005e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>