More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1784 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  100 
 
 
284 aa  566  1e-160  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  75 
 
 
284 aa  435  1e-121  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  65.14 
 
 
287 aa  391  1e-108  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  65.37 
 
 
287 aa  390  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  62.27 
 
 
296 aa  359  3e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  80.99 
 
 
250 aa  358  5e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2733  CBS domain containing protein  61.79 
 
 
284 aa  338  7e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.377385  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  57.4 
 
 
285 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  47.43 
 
 
276 aa  253  2.0000000000000002e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  47.31 
 
 
420 aa  237  1e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  43.59 
 
 
447 aa  233  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  45.61 
 
 
439 aa  220  1.9999999999999999e-56  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  43.61 
 
 
421 aa  206  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1867  CBS domain containing protein  41.03 
 
 
285 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00545793 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  43.08 
 
 
435 aa  205  8e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0553  CBS domain containing protein  41.97 
 
 
273 aa  204  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000116003 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  41.5 
 
 
434 aa  204  2e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  41.29 
 
 
439 aa  202  5e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  45.21 
 
 
434 aa  201  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  42.41 
 
 
442 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  37.5 
 
 
417 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  43.21 
 
 
464 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  44.58 
 
 
537 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  44.53 
 
 
483 aa  199  3.9999999999999996e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  44.55 
 
 
425 aa  199  6e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  41.8 
 
 
490 aa  198  9e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0408  CBS domain-containing protein  40.98 
 
 
298 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.658484  normal  0.141642 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  42.39 
 
 
464 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2703  hypothetical protein  41.05 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.313937  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  42.51 
 
 
452 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1807  CBS  39.64 
 
 
298 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.223069  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0060  CBS domain pair protein  43.67 
 
 
259 aa  196  5.000000000000001e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0240  Mg2+/Co2+ transporter  42.52 
 
 
291 aa  195  7e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  41.13 
 
 
461 aa  195  9e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  43.37 
 
 
434 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.86 
 
 
295 aa  194  2e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  39.07 
 
 
281 aa  194  2e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1394  hypothetical protein  38.06 
 
 
292 aa  193  3e-48  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1125  hypothetical protein  40.81 
 
 
279 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  37.41 
 
 
465 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  39.07 
 
 
279 aa  192  4e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12300  hypothetical protein  40.44 
 
 
279 aa  192  4e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  39.92 
 
 
291 aa  192  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  41.39 
 
 
273 aa  192  5e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  39.92 
 
 
291 aa  192  5e-48  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3333  transporter-associated region  39.85 
 
 
311 aa  192  5e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.240989 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0450  CBS transporter-associated protein  41.91 
 
 
295 aa  192  5e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00559232  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0626  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  39.85 
 
 
311 aa  192  6e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.479043  normal  0.338207 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  40.15 
 
 
295 aa  191  9e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1886  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 
323 aa  191  9e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.112037  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1602  hypothetical protein  37.69 
 
 
292 aa  191  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0419  CBS domain containing protein  40.22 
 
 
309 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.622 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3699  CBS domain-containing protein  37.01 
 
 
291 aa  191  1e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.246978  hitchhiker  0.00355907 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  40.62 
 
 
432 aa  191  1e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1243  hemolysin C  42.45 
 
 
258 aa  190  2e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.419025  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0528  hypothetical protein  40.51 
 
 
298 aa  190  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0687971  normal  0.0248188 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.24 
 
 
291 aa  190  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  39.39 
 
 
435 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  39.41 
 
 
295 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  39.03 
 
 
295 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  39.03 
 
 
295 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1951  magnesium and cobalt efflux protein  38.46 
 
 
323 aa  191  2e-47  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  41.83 
 
 
436 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.27 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.27 
 
 
403 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.27 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  41.83 
 
 
436 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.27 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02233  Mg/Co transporter  38.38 
 
 
285 aa  189  2.9999999999999997e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17166  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.27 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  41.83 
 
 
436 aa  190  2.9999999999999997e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.27 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.27 
 
 
295 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  39.6 
 
 
443 aa  189  4e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4789  CBS domain containing protein  40.49 
 
 
279 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0871051 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  38.43 
 
 
437 aa  189  5e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  40.47 
 
 
424 aa  189  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4665  CBS domain-containing protein  40.49 
 
 
279 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.389317  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  37.64 
 
 
291 aa  189  5e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4843  CBS domain-containing protein  40.49 
 
 
279 aa  189  5e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.71601  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09040  CBS domain-containing transporter  41.3 
 
 
280 aa  189  5.999999999999999e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.157725  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  40 
 
 
447 aa  188  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0404  CBS domain containing protein  39.27 
 
 
309 aa  188  8e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.275188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.5 
 
 
292 aa  188  8e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  39.03 
 
 
295 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  37.88 
 
 
291 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  38.11 
 
 
291 aa  188  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  39.03 
 
 
295 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  37.88 
 
 
291 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 
291 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 
291 aa  187  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  37.88 
 
 
291 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  39.03 
 
 
295 aa  188  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  38.26 
 
 
291 aa  188  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0631  CBS domain-containing protein  38.1 
 
 
279 aa  188  1e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00687954  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  37.88 
 
 
291 aa  187  1e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  39.34 
 
 
280 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  38.83 
 
 
280 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2698  transporter-associated region  38.55 
 
 
278 aa  187  2e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  40.32 
 
 
433 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>