More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1507 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  100 
 
 
430 aa  845    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  60.7 
 
 
443 aa  522  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  54.15 
 
 
455 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  54.17 
 
 
455 aa  449  1e-125  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  49.08 
 
 
448 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  40.24 
 
 
420 aa  284  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  38.29 
 
 
429 aa  268  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  40.23 
 
 
421 aa  266  5e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  40.35 
 
 
425 aa  266  7e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  39.63 
 
 
421 aa  265  1e-69  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  34.28 
 
 
417 aa  263  4.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  38.37 
 
 
424 aa  263  4.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  35.87 
 
 
429 aa  256  7e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  35.25 
 
 
433 aa  255  1.0000000000000001e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  34.79 
 
 
437 aa  252  7e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  36.75 
 
 
434 aa  252  9.000000000000001e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  33.78 
 
 
464 aa  247  3e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  34.7 
 
 
442 aa  243  3.9999999999999997e-63  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
422 aa  242  7.999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  33.49 
 
 
424 aa  242  1e-62  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  33.73 
 
 
424 aa  242  1e-62  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  34.32 
 
 
442 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  33.25 
 
 
424 aa  241  2.9999999999999997e-62  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  32.72 
 
 
454 aa  239  8e-62  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  36.6 
 
 
425 aa  238  1e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  34.13 
 
 
442 aa  238  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  35 
 
 
434 aa  238  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  34.87 
 
 
427 aa  236  6e-61  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  33.74 
 
 
447 aa  236  7e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  33.89 
 
 
442 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  35.86 
 
 
423 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  37.34 
 
 
439 aa  234  3e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  32.32 
 
 
434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 
434 aa  233  7.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  32.74 
 
 
464 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  32.86 
 
 
436 aa  232  1e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  32.96 
 
 
464 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  32.86 
 
 
440 aa  230  3e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  37.28 
 
 
421 aa  230  4e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  30.38 
 
 
465 aa  229  6e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3887  protein of unknown function DUF21  33.56 
 
 
436 aa  229  8e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0724448  hitchhiker  0.00619914 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  33.57 
 
 
434 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  32.2 
 
 
429 aa  228  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  35.87 
 
 
424 aa  226  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 
439 aa  226  6e-58  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1539  hypothetical protein  33.33 
 
 
431 aa  225  9e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.463732  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  39.69 
 
 
426 aa  225  1e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  37.03 
 
 
426 aa  225  1e-57  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  35.58 
 
 
417 aa  225  1e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  38.67 
 
 
433 aa  225  1e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  32.24 
 
 
441 aa  224  2e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  32.27 
 
 
428 aa  224  2e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  32.35 
 
 
447 aa  224  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  32.52 
 
 
447 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0911  hypothetical protein  32.09 
 
 
435 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  31.65 
 
 
461 aa  224  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  31.19 
 
 
432 aa  224  3e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5985  gliding motility-associated protein GldE  35.51 
 
 
453 aa  224  3e-57  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.897613 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  30.86 
 
 
479 aa  224  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  35.66 
 
 
421 aa  223  4e-57  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02660  putative transmembrane CorC/HlyC family transporter associatedprotein  35.7 
 
 
418 aa  223  4.9999999999999996e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3594  protein of unknown function DUF21  32.87 
 
 
436 aa  223  6e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.798731 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  36.59 
 
 
420 aa  223  6e-57  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  32.39 
 
 
420 aa  223  7e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  34.61 
 
 
426 aa  223  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  32.21 
 
 
446 aa  222  8e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  32.55 
 
 
429 aa  223  8e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  33.42 
 
 
431 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3532  hypothetical protein  31.89 
 
 
455 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0033  protein of unknown function DUF21  34.27 
 
 
467 aa  221  3e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  40.19 
 
 
435 aa  219  5e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1354  hemolysin protein, putative  34.98 
 
 
423 aa  218  2e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
414 aa  218  2e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  32.61 
 
 
429 aa  218  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2841  hypothetical protein  34.98 
 
 
423 aa  217  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.063755  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2923  hypothetical protein  34.98 
 
 
423 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.801289  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  35.73 
 
 
429 aa  216  5e-55  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  34.82 
 
 
477 aa  216  5e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  32.16 
 
 
431 aa  216  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3020  hypothetical protein  34.73 
 
 
423 aa  216  5e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000521324  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  30.73 
 
 
442 aa  216  7e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  32.95 
 
 
432 aa  216  8e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  33.72 
 
 
446 aa  216  9e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  32.14 
 
 
468 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  34.96 
 
 
427 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1165  hypothetical protein  34.04 
 
 
423 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.132593  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2757  hypothetical protein  35.44 
 
 
428 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000928443  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  38.12 
 
 
422 aa  215  1.9999999999999998e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1812  hypothetical protein  39.7 
 
 
458 aa  213  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.850794  normal  0.489178 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1622  magnesium and cobalt efflux protein  33.49 
 
 
417 aa  213  4.9999999999999996e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0117884  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0561  HlyC/CorC (HCC) family protein  33.57 
 
 
417 aa  212  1e-53  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000191293  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1284  hypothetical protein  35.22 
 
 
424 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121999  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1207  hypothetical protein  35.22 
 
 
424 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000421474  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  30.44 
 
 
452 aa  212  1e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1251  hypothetical protein  35.29 
 
 
424 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000842338  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3106  protein of unknown function DUF21  35.22 
 
 
424 aa  212  1e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000105483  normal  0.0439763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  31.57 
 
 
452 aa  212  1e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  34.05 
 
 
421 aa  211  2e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  33.33 
 
 
424 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  32.86 
 
 
445 aa  211  2e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>