More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2870 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  862    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  57.28 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0561  protein of unknown function DUF21  41.27 
 
 		 498 aa  331  2e-89  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453215  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  42.12 
 
 		 445 aa  306  6e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  42.12 
 
 		 445 aa  305  1.0000000000000001e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  39.86 
 
 		 440 aa  304  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  40.49 
 
 		 431 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  38.11 
 
 		 447 aa  297  3e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  40.91 
 
 		 429 aa  291  1e-77  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  34.22 
 
 		 431 aa  289  7e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  36.52 
 
 		 465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  33.64 
 
 		 444 aa  277  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  35.25 
 
 		 432 aa  272  8.000000000000001e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  37.22 
 
 		 487 aa  271  1e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  35.94 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  39.07 
 
 		 420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  40.14 
 
 		 421 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  39.9 
 
 		 421 aa  269  7e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  38.86 
 
 		 445 aa  269  7e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  37.41 
 
 		 479 aa  268  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  34.41 
 
 		 434 aa  265  1e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  36.24 
 
 		 446 aa  264  3e-69  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  34.87 
 
 		 533 aa  261  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  35.64 
 
 		 555 aa  257  2e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  35.46 
 
 		 429 aa  256  4e-67  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  34.75 
 
 		 417 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0947  hypothetical protein  33.87 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  34.3 
 
 		 447 aa  251  1e-65  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  35.31 
 
 		 456 aa  251  2e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0915  protein of unknown function DUF21  30.42 
 
 		 460 aa  250  4e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  34.75 
 
 		 442 aa  249  5e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  35.84 
 
 		 438 aa  249  8e-65  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  33.09 
 
 		 433 aa  248  1e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  34.92 
 
 		 446 aa  248  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  36.04 
 
 		 414 aa  247  2e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  35.57 
 
 		 444 aa  247  3e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2040  hypothetical protein  32.42 
 
 		 418 aa  247  3e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  36.57 
 
 		 434 aa  247  3e-64  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  32.46 
 
 		 442 aa  246  4e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1858  protein of unknown function DUF21  30.75 
 
 		 434 aa  246  6e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  33.64 
 
 		 432 aa  245  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  33.02 
 
 		 436 aa  244  1.9999999999999999e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  33.8 
 
 		 440 aa  243  3e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  35.98 
 
 		 477 aa  243  5e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  33.25 
 
 		 448 aa  243  5e-63  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02510  CBS domain-containing protein  31.75 
 
 		 470 aa  243  6e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  34.36 
 
 		 445 aa  243  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  34.86 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  31.54 
 
 		 437 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  34.32 
 
 		 433 aa  241  2e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1399  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 		 444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  32.88 
 
 		 438 aa  240  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0148  protein of unknown function DUF21  31.31 
 
 		 421 aa  240  4e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  35.61 
 
 		 443 aa  240  4e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  33.89 
 
 		 439 aa  239  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  32.42 
 
 		 430 aa  239  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  32.87 
 
 		 424 aa  239  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  36.43 
 
 		 425 aa  238  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5899  hypothetical protein  35.28 
 
 		 430 aa  238  2e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  34.32 
 
 		 439 aa  238  2e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0525  hypothetical protein  34.17 
 
 		 441 aa  237  3e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.806161  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  34.73 
 
 		 467 aa  236  4e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  32.87 
 
 		 424 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  32.04 
 
 		 441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  33.18 
 
 		 448 aa  236  6e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  37.02 
 
 		 430 aa  235  9e-61  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  34.02 
 
 		 432 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0503  protein of unknown function DUF21  30.61 
 
 		 453 aa  234  3e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  35.35 
 
 		 422 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  32.18 
 
 		 432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  34.02 
 
 		 432 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  34.68 
 
 		 429 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1409  hemolysin-like protein  31.51 
 
 		 447 aa  232  8.000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  32.07 
 
 		 443 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  32.07 
 
 		 443 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  33.73 
 
 		 447 aa  232  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  32.4 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  31.91 
 
 		 446 aa  231  2e-59  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  34.58 
 
 		 421 aa  231  2e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  32.84 
 
 		 424 aa  231  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  32.4 
 
 		 439 aa  230  4e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  31.88 
 
 		 434 aa  229  6e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  30.3 
 
 		 446 aa  229  6e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  39.55 
 
 		 447 aa  229  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  32.81 
 
 		 453 aa  228  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  33.79 
 
 		 432 aa  228  1e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1263  CBS  33.91 
 
 		 425 aa  229  1e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  32.79 
 
 		 440 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  33.87 
 
 		 432 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  32.79 
 
 		 442 aa  228  1e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  32.41 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  32.56 
 
 		 442 aa  227  2e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  32.56 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  32.11 
 
 		 436 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  33.75 
 
 		 430 aa  228  2e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  32.56 
 
 		 442 aa  227  2e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  29.72 
 
 		 431 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  33.79 
 
 		 432 aa  228  2e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  34.93 
 
 		 424 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  31.11 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>