More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0907 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  100 
 
 
487 aa  981    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  37.91 
 
 
434 aa  296  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  37.2 
 
 
433 aa  249  8e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0561  protein of unknown function DUF21  31.29 
 
 
498 aa  239  9e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000453215  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  30.31 
 
 
465 aa  237  3e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  30.93 
 
 
446 aa  234  3e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  31.87 
 
 
440 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  32.16 
 
 
479 aa  231  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  32.17 
 
 
444 aa  230  4e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  30.41 
 
 
447 aa  230  5e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  33.25 
 
 
429 aa  230  5e-59  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  31.49 
 
 
432 aa  229  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  30.94 
 
 
431 aa  228  2e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  32.12 
 
 
432 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  32.08 
 
 
441 aa  228  3e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  32.12 
 
 
429 aa  226  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  31.96 
 
 
436 aa  226  7e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  31.95 
 
 
434 aa  224  3e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  32.47 
 
 
439 aa  223  4.9999999999999996e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  32.33 
 
 
438 aa  218  2e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  31.06 
 
 
433 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  30.84 
 
 
447 aa  217  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  33.93 
 
 
445 aa  217  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  30.33 
 
 
437 aa  216  8e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  33.93 
 
 
445 aa  216  9e-55  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  30.63 
 
 
449 aa  215  1.9999999999999998e-54  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  31.91 
 
 
430 aa  211  2e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  30.57 
 
 
446 aa  210  4e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  28.9 
 
 
437 aa  209  9e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1399  CBS domain-containing protein  31.09 
 
 
444 aa  208  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  31.65 
 
 
434 aa  208  2e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  29.55 
 
 
445 aa  208  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  30.24 
 
 
445 aa  208  2e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  36.5 
 
 
426 aa  206  5e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  31.6 
 
 
428 aa  206  6e-52  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  32.15 
 
 
446 aa  206  7e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2633  protein of unknown function DUF21  31.38 
 
 
425 aa  206  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1682  protein of unknown function DUF21  31.5 
 
 
443 aa  205  1e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000471578  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  29.97 
 
 
447 aa  204  2e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1705  pyruvate-ferredoxin oxidoreductase  30.82 
 
 
446 aa  204  2e-51  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0033  protein of unknown function DUF21  33.53 
 
 
467 aa  204  4e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  31.25 
 
 
420 aa  203  6e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  30.49 
 
 
449 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  30.49 
 
 
449 aa  202  9.999999999999999e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  28.05 
 
 
444 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  28.38 
 
 
440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  27.39 
 
 
454 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  30.16 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  29.86 
 
 
429 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  30.61 
 
 
464 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  28.72 
 
 
442 aa  201  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0644  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.09 
 
 
442 aa  201  3e-50  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  30.16 
 
 
446 aa  200  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2068  magnesium and cobalt efflux protein  30.59 
 
 
451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  30.5 
 
 
443 aa  200  5e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3055  CBS domain protein  30.28 
 
 
443 aa  200  6e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  31.82 
 
 
425 aa  199  9e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2107  hypothetical protein  28.88 
 
 
451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2134  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 
451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2072  magnesium and cobalt efflux protein  30.37 
 
 
451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0473612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2288  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 
451 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.779019  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  33.23 
 
 
421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  31.67 
 
 
431 aa  199  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1678  hypothetical protein  30.09 
 
 
444 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.306047  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  34.22 
 
 
430 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2313  CBS domain protein  30.56 
 
 
443 aa  197  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  30.05 
 
 
432 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  28.9 
 
 
442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  29.08 
 
 
425 aa  197  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  29.72 
 
 
443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1770  protein of unknown function DUF21  29.59 
 
 
444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0022  magnesium and cobalt efflux protein CorC  30.11 
 
 
442 aa  197  5.000000000000001e-49  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  28.9 
 
 
442 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  28.67 
 
 
442 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  28.67 
 
 
442 aa  196  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  28.9 
 
 
442 aa  196  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  29.89 
 
 
443 aa  195  1e-48  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  28.9 
 
 
442 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  29.02 
 
 
440 aa  195  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  28.9 
 
 
442 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  29.82 
 
 
555 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  26.37 
 
 
417 aa  195  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4979  protein of unknown function DUF21  29.56 
 
 
440 aa  194  3e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6404  hypothetical protein  31.52 
 
 
452 aa  194  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2397  CBS domain protein  30.09 
 
 
443 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  28.9 
 
 
442 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  28.67 
 
 
533 aa  193  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  31.33 
 
 
439 aa  193  6e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  29.76 
 
 
442 aa  193  7e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  30.3 
 
 
436 aa  191  2e-47  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0778  hypothetical protein  28.65 
 
 
420 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0326881  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  29.08 
 
 
430 aa  191  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0826  protein of unknown function DUF21  27.46 
 
 
436 aa  191  2e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  28.54 
 
 
435 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  30.16 
 
 
433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  31.5 
 
 
421 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  29.52 
 
 
434 aa  191  4e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2595  hypothetical protein  30.31 
 
 
476 aa  190  4e-47  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1382  protein of unknown function DUF21  31.98 
 
 
446 aa  190  4e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  31.5 
 
 
421 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>