More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2633 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2633  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
425 aa  823    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4979  protein of unknown function DUF21  75.36 
 
 
440 aa  579  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0026  protein of unknown function DUF21  68.65 
 
 
438 aa  531  1e-150  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1127  hypothetical protein  58.23 
 
 
425 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1099  hypothetical protein  58.47 
 
 
425 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1116  hypothetical protein  58.47 
 
 
425 aa  465  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1422  hypothetical protein  59.81 
 
 
423 aa  449  1e-125  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5899  hypothetical protein  57.28 
 
 
430 aa  447  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1263  CBS  58 
 
 
425 aa  432  1e-120  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4979  hypothetical protein  60.29 
 
 
423 aa  431  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581997  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1487  protein of unknown function DUF21  57.66 
 
 
421 aa  427  1e-118  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121973  normal  0.308123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0262  protein of unknown function DUF21  56.46 
 
 
421 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  43.62 
 
 
444 aa  310  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02510  CBS domain-containing protein  43.2 
 
 
470 aa  294  2e-78  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  43.57 
 
 
438 aa  286  5e-76  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  42.11 
 
 
448 aa  280  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0148  protein of unknown function DUF21  42.28 
 
 
421 aa  279  8e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2040  hypothetical protein  42.24 
 
 
418 aa  278  2e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0947  hypothetical protein  41.4 
 
 
432 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  43.98 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1858  protein of unknown function DUF21  41.44 
 
 
434 aa  269  7e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  40.05 
 
 
533 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  42.46 
 
 
555 aa  263  4e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  37.02 
 
 
431 aa  260  4e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0915  protein of unknown function DUF21  40.53 
 
 
460 aa  258  2e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280711  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0014  CBS domain protein  35.03 
 
 
431 aa  256  7e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000513416 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  34.74 
 
 
446 aa  253  4.0000000000000004e-66  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  33.96 
 
 
439 aa  246  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1409  hemolysin-like protein  33.95 
 
 
447 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  37.96 
 
 
466 aa  244  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  34.44 
 
 
434 aa  238  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  35.27 
 
 
447 aa  234  3e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  34.49 
 
 
439 aa  230  4e-59  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  38.94 
 
 
441 aa  229  6e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  33.42 
 
 
447 aa  224  2e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  36.28 
 
 
431 aa  224  3e-57  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  32.22 
 
 
447 aa  223  4e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  34.55 
 
 
433 aa  222  9.999999999999999e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  34.82 
 
 
441 aa  222  9.999999999999999e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  34.19 
 
 
441 aa  221  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  33.56 
 
 
443 aa  221  1.9999999999999999e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  33.33 
 
 
442 aa  221  3e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  35.49 
 
 
448 aa  220  3.9999999999999997e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  35.19 
 
 
443 aa  220  3.9999999999999997e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  34.68 
 
 
446 aa  219  5e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  36.17 
 
 
436 aa  219  7.999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  32.31 
 
 
440 aa  218  1e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  34.8 
 
 
458 aa  218  2e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  34.62 
 
 
445 aa  217  2.9999999999999998e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  32.1 
 
 
436 aa  215  9.999999999999999e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  32.61 
 
 
430 aa  215  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  35.73 
 
 
436 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  34.03 
 
 
432 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  34.95 
 
 
443 aa  214  2.9999999999999995e-54  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  35.01 
 
 
442 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  34.38 
 
 
438 aa  211  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  33.73 
 
 
437 aa  211  2e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  33.88 
 
 
456 aa  210  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  34.43 
 
 
431 aa  210  5e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1399  CBS domain-containing protein  34.35 
 
 
444 aa  208  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  31.09 
 
 
426 aa  209  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  33.18 
 
 
439 aa  207  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  33.49 
 
 
432 aa  207  3e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  31.74 
 
 
439 aa  207  3e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0830  protein of unknown function DUF21  37.16 
 
 
436 aa  206  4e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0185208  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  37.53 
 
 
437 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  31.71 
 
 
440 aa  206  5e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  34.69 
 
 
460 aa  206  5e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  31.74 
 
 
439 aa  206  7e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0826  protein of unknown function DUF21  37.16 
 
 
436 aa  206  7e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  31.71 
 
 
440 aa  206  7e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  36.3 
 
 
434 aa  206  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  34.5 
 
 
436 aa  205  1e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  35.13 
 
 
439 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  34.98 
 
 
431 aa  204  2e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  31.13 
 
 
432 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  32.69 
 
 
430 aa  205  2e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  31.46 
 
 
453 aa  204  3e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  33.09 
 
 
442 aa  203  4e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  34.82 
 
 
431 aa  204  4e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  28.85 
 
 
440 aa  203  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  37.03 
 
 
444 aa  202  9e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  31.84 
 
 
487 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  36.21 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  32.91 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  32.69 
 
 
465 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  34.39 
 
 
443 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  34.39 
 
 
443 aa  200  5e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  34.34 
 
 
445 aa  199  6e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  35.1 
 
 
441 aa  199  7e-50  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  34.58 
 
 
428 aa  199  9e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  31.53 
 
 
424 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0234  protein of unknown function DUF21  38.85 
 
 
425 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  32.47 
 
 
444 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  30.94 
 
 
443 aa  197  4.0000000000000005e-49  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  34.92 
 
 
430 aa  197  4.0000000000000005e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  32.3 
 
 
429 aa  196  6e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  32.24 
 
 
424 aa  196  7e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  37.38 
 
 
434 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  33.02 
 
 
429 aa  195  1e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>