More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1487 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1487  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
421 aa  825    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121973  normal  0.308123 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1263  CBS  71.09 
 
 
425 aa  579  1e-164  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0262  protein of unknown function DUF21  70.24 
 
 
421 aa  508  9.999999999999999e-143  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0026  protein of unknown function DUF21  61.14 
 
 
438 aa  474  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5899  hypothetical protein  58.75 
 
 
430 aa  461  9.999999999999999e-129  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2633  protein of unknown function DUF21  57.66 
 
 
425 aa  443  1e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1127  hypothetical protein  52.96 
 
 
425 aa  419  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1099  hypothetical protein  52.96 
 
 
425 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1116  hypothetical protein  52.96 
 
 
425 aa  418  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4979  protein of unknown function DUF21  57.11 
 
 
440 aa  413  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1422  hypothetical protein  53.13 
 
 
423 aa  391  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4979  hypothetical protein  51.75 
 
 
423 aa  377  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581997  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  45.07 
 
 
444 aa  325  6e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  44.99 
 
 
438 aa  302  6.000000000000001e-81  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0148  protein of unknown function DUF21  40.9 
 
 
421 aa  288  1e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2040  hypothetical protein  41.81 
 
 
418 aa  287  2e-76  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  41.97 
 
 
448 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02510  CBS domain-containing protein  41.2 
 
 
470 aa  281  2e-74  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  44.84 
 
 
555 aa  279  8e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1858  protein of unknown function DUF21  41.53 
 
 
434 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0915  protein of unknown function DUF21  39.82 
 
 
460 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280711  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  41.31 
 
 
533 aa  270  2.9999999999999997e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  42.12 
 
 
439 aa  262  8e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0947  hypothetical protein  42.36 
 
 
432 aa  260  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  37.97 
 
 
431 aa  246  4.9999999999999997e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1409  hemolysin-like protein  37.16 
 
 
447 aa  246  6e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  34.43 
 
 
434 aa  242  7.999999999999999e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0014  CBS domain protein  36 
 
 
431 aa  238  2e-61  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000513416 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  35.58 
 
 
431 aa  237  3e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  35.46 
 
 
445 aa  233  5e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  36.6 
 
 
441 aa  230  3e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
446 aa  227  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  33.87 
 
 
447 aa  220  3.9999999999999997e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  35.73 
 
 
441 aa  215  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  35.51 
 
 
443 aa  215  9.999999999999999e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  31.81 
 
 
440 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1399  CBS domain-containing protein  33.25 
 
 
444 aa  213  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  32.93 
 
 
447 aa  212  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  32.71 
 
 
432 aa  212  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  34.58 
 
 
436 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  34.91 
 
 
443 aa  210  3e-53  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  36.17 
 
 
438 aa  209  5e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  33.1 
 
 
465 aa  209  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  33.8 
 
 
439 aa  210  5e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  34.87 
 
 
456 aa  207  2e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  30.9 
 
 
447 aa  208  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  34.54 
 
 
442 aa  207  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  33.16 
 
 
445 aa  207  2e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  32.89 
 
 
445 aa  205  1e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  32.51 
 
 
443 aa  205  1e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  34.77 
 
 
443 aa  204  2e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  34.95 
 
 
441 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  35.53 
 
 
444 aa  203  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  33.89 
 
 
430 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0234  protein of unknown function DUF21  36.5 
 
 
425 aa  200  5e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 
439 aa  199  6e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  30.88 
 
 
436 aa  199  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  32.95 
 
 
433 aa  199  7e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  32.79 
 
 
440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0798  protein of unknown function DUF21  30.92 
 
 
429 aa  198  1.0000000000000001e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  32.79 
 
 
440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  34.62 
 
 
460 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  31.22 
 
 
433 aa  197  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0830  protein of unknown function DUF21  36.86 
 
 
436 aa  196  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0185208  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0826  protein of unknown function DUF21  36.86 
 
 
436 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  34.98 
 
 
446 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  34.45 
 
 
430 aa  195  1e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  32.37 
 
 
437 aa  195  1e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  33.41 
 
 
439 aa  195  1e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  30.41 
 
 
432 aa  194  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  33.41 
 
 
458 aa  194  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 
432 aa  193  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  31.74 
 
 
436 aa  194  4e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0710  protein of unknown function DUF21  31.54 
 
 
432 aa  192  9e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.149607  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  30.96 
 
 
443 aa  192  1e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  35.13 
 
 
466 aa  192  1e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  34.47 
 
 
456 aa  192  1e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  34.11 
 
 
431 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  32.86 
 
 
479 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  33.42 
 
 
442 aa  191  2.9999999999999997e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  32.94 
 
 
436 aa  189  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  32.71 
 
 
434 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  32.94 
 
 
464 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  34.04 
 
 
444 aa  189  7e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  37.14 
 
 
437 aa  189  7e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  31.6 
 
 
443 aa  188  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  31.98 
 
 
446 aa  188  2e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  27.56 
 
 
449 aa  187  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  31.03 
 
 
453 aa  187  4e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  33 
 
 
440 aa  187  4e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  31.03 
 
 
436 aa  186  8e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  31.87 
 
 
443 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  31.87 
 
 
443 aa  186  9e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  30.5 
 
 
437 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  32.48 
 
 
435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  33.26 
 
 
445 aa  184  3e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  33.02 
 
 
425 aa  184  3e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  30.95 
 
 
442 aa  184  3e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  33.94 
 
 
448 aa  184  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  29.77 
 
 
439 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>