More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4979 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_4979  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
440 aa  853    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2633  protein of unknown function DUF21  75.36 
 
 
425 aa  602  1.0000000000000001e-171  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0026  protein of unknown function DUF21  67.28 
 
 
438 aa  536  1e-151  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5899  hypothetical protein  58.93 
 
 
430 aa  467  9.999999999999999e-131  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1099  hypothetical protein  57.28 
 
 
425 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1116  hypothetical protein  57.28 
 
 
425 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1422  hypothetical protein  59.81 
 
 
423 aa  461  9.999999999999999e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1127  hypothetical protein  57.04 
 
 
425 aa  459  9.999999999999999e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4979  hypothetical protein  59.57 
 
 
423 aa  435  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581997  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1263  CBS  57.76 
 
 
425 aa  428  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1487  protein of unknown function DUF21  57.01 
 
 
421 aa  419  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121973  normal  0.308123 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0262  protein of unknown function DUF21  56.94 
 
 
421 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  43.34 
 
 
444 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2040  hypothetical protein  46.17 
 
 
418 aa  307  3e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02510  CBS domain-containing protein  43.3 
 
 
470 aa  300  3e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  42.86 
 
 
448 aa  294  3e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  40.83 
 
 
533 aa  287  2.9999999999999996e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  43.63 
 
 
438 aa  284  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0947  hypothetical protein  44.44 
 
 
432 aa  280  4e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0148  protein of unknown function DUF21  44.5 
 
 
421 aa  278  1e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1858  protein of unknown function DUF21  42.56 
 
 
434 aa  276  7e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  43.67 
 
 
555 aa  272  8.000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0915  protein of unknown function DUF21  41.36 
 
 
460 aa  271  2e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280711  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  42.96 
 
 
439 aa  270  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0014  CBS domain protein  35.58 
 
 
431 aa  256  7e-67  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000513416 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1409  hemolysin-like protein  35.28 
 
 
447 aa  250  3e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  36.07 
 
 
446 aa  248  2e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  36.63 
 
 
431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  38.02 
 
 
431 aa  239  5.999999999999999e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  35.81 
 
 
434 aa  239  1e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  33.85 
 
 
447 aa  229  6e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  36.74 
 
 
441 aa  229  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  31.94 
 
 
439 aa  227  4e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  32.32 
 
 
447 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  33.99 
 
 
436 aa  222  9.999999999999999e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  35.39 
 
 
446 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  36.26 
 
 
466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  34.54 
 
 
442 aa  220  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  33.03 
 
 
447 aa  219  5e-56  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  36.41 
 
 
436 aa  218  2e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  34.11 
 
 
437 aa  218  2e-55  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  33.41 
 
 
436 aa  215  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  35.54 
 
 
433 aa  215  9.999999999999999e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  36.49 
 
 
431 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  32.86 
 
 
430 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0828  protein of unknown function DUF21  34.05 
 
 
424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  34.26 
 
 
441 aa  213  4.9999999999999996e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  33.79 
 
 
443 aa  213  5.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0830  protein of unknown function DUF21  39.23 
 
 
436 aa  212  1e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0185208  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  36.15 
 
 
428 aa  212  1e-53  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  30.75 
 
 
440 aa  211  2e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  33.33 
 
 
436 aa  210  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0826  protein of unknown function DUF21  39.23 
 
 
436 aa  211  3e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  34.83 
 
 
441 aa  210  4e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  34.86 
 
 
439 aa  210  4e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0942  protein of unknown function DUF21  32.63 
 
 
424 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.429612  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  32.96 
 
 
442 aa  209  1e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2753  hypothetical protein  35.12 
 
 
431 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.429535  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  34.21 
 
 
442 aa  208  2e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1919  hemolysin  33.33 
 
 
430 aa  208  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  34.74 
 
 
443 aa  207  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  35.84 
 
 
441 aa  207  3e-52  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  33.09 
 
 
445 aa  207  3e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  33.56 
 
 
439 aa  207  4e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  35.19 
 
 
434 aa  206  5e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  34.33 
 
 
444 aa  206  7e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  33.17 
 
 
465 aa  206  7e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3152  protein of unknown function DUF21  34.57 
 
 
431 aa  206  8e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  33.79 
 
 
432 aa  206  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  34.16 
 
 
456 aa  206  1e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7487  hypothetical protein  35.39 
 
 
436 aa  205  1e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.160114 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  34.2 
 
 
460 aa  205  1e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  36.28 
 
 
430 aa  204  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  28.95 
 
 
440 aa  204  2e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  33.76 
 
 
443 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  33.76 
 
 
443 aa  202  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4087  protein of unknown function DUF21  30.48 
 
 
453 aa  202  8e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  32.95 
 
 
432 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  33.18 
 
 
458 aa  202  9.999999999999999e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  29.26 
 
 
437 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  32.79 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  36.97 
 
 
437 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  33.18 
 
 
440 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  32.41 
 
 
426 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  30.98 
 
 
443 aa  200  5e-50  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  33.94 
 
 
447 aa  200  5e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  34.4 
 
 
439 aa  199  7e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  34.03 
 
 
456 aa  199  7e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  34.73 
 
 
479 aa  199  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  35.52 
 
 
444 aa  198  1.0000000000000001e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  33.72 
 
 
429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  33.03 
 
 
440 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  37.21 
 
 
437 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  31.57 
 
 
439 aa  197  3e-49  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  32.55 
 
 
433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  29.63 
 
 
417 aa  196  5.000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  28.67 
 
 
441 aa  196  5.000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  31.57 
 
 
439 aa  196  5.000000000000001e-49  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3672  hypothetical protein  32.24 
 
 
425 aa  196  6e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00780947 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0907  hypothetical protein  30.27 
 
 
487 aa  196  6e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00145155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>