More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0148 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_0148  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
421 aa  825    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.518809 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2040  hypothetical protein  63.74 
 
 
418 aa  511  1e-144  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.923068  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3237  protein of unknown function DUF21  62.82 
 
 
448 aa  502  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.422703  normal  0.0333054 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1858  protein of unknown function DUF21  60.71 
 
 
434 aa  486  1e-136  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0915  protein of unknown function DUF21  59.06 
 
 
460 aa  478  1e-133  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0280711  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1409  hemolysin-like protein  51.17 
 
 
447 aa  425  1e-118  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0014  CBS domain protein  51.64 
 
 
431 aa  426  1e-118  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000513416 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  52.82 
 
 
444 aa  400  9.999999999999999e-111  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0947  hypothetical protein  51.87 
 
 
432 aa  396  1e-109  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  49.42 
 
 
533 aa  376  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02510  CBS domain-containing protein  50.72 
 
 
470 aa  377  1e-103  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  49.75 
 
 
439 aa  348  1e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  47.45 
 
 
438 aa  347  2e-94  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  47 
 
 
555 aa  335  9e-91  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0234  protein of unknown function DUF21  44.03 
 
 
425 aa  282  1e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1263  CBS  41.78 
 
 
425 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2633  protein of unknown function DUF21  42.04 
 
 
425 aa  266  2.9999999999999995e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5899  hypothetical protein  40.78 
 
 
430 aa  266  4e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.476132 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  39.71 
 
 
431 aa  262  8.999999999999999e-69  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1487  protein of unknown function DUF21  40.53 
 
 
421 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.121973  normal  0.308123 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1099  hypothetical protein  39.58 
 
 
425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1116  hypothetical protein  39.58 
 
 
425 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1127  hypothetical protein  39.35 
 
 
425 aa  258  2e-67  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.531176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4979  protein of unknown function DUF21  44.56 
 
 
440 aa  254  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0026  protein of unknown function DUF21  39.95 
 
 
438 aa  253  6e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 
434 aa  233  4.0000000000000004e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  36.74 
 
 
447 aa  232  1e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  33.8 
 
 
446 aa  228  1e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  34.56 
 
 
432 aa  228  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1422  hypothetical protein  38.2 
 
 
423 aa  223  3e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
447 aa  222  9.999999999999999e-57  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4979  hypothetical protein  38.39 
 
 
423 aa  220  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.581997  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0262  protein of unknown function DUF21  41.98 
 
 
421 aa  219  7.999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.558818 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0361  CBS domain-containing protein  29.87 
 
 
449 aa  216  4e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  32.85 
 
 
447 aa  213  3.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  34.05 
 
 
442 aa  212  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0742  hypothetical protein  30.59 
 
 
449 aa  212  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0726  hypothetical protein  30.59 
 
 
449 aa  212  7.999999999999999e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  29.85 
 
 
440 aa  212  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  36 
 
 
441 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  31.82 
 
 
433 aa  211  2e-53  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  32.56 
 
 
431 aa  210  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  38.26 
 
 
446 aa  210  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  31.22 
 
 
446 aa  207  2e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3259  CBS domain protein  29.84 
 
 
435 aa  206  4e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.698294 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 
437 aa  205  1e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2050  CBS domain protein  29.6 
 
 
435 aa  205  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4282  hypothetical protein  36.54 
 
 
434 aa  204  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.789831  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0819  protein of unknown function DUF21  29.11 
 
 
441 aa  203  4e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4622  protein of unknown function DUF21  33.33 
 
 
430 aa  203  4e-51  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  36.06 
 
 
445 aa  203  4e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  30.29 
 
 
445 aa  202  9e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1875  hemolysin-like protein  28.84 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0753435  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1866  hemolysin-like protein  28.84 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.621127  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  32.5 
 
 
443 aa  202  9.999999999999999e-51  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2092  CBS domain protein  28.84 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  33.01 
 
 
437 aa  202  9.999999999999999e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  34.24 
 
 
442 aa  202  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2160  CBS domain protein  28.84 
 
 
435 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00238227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  32.9 
 
 
432 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1913  CBS domain-containing protein  28.6 
 
 
435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.378516  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2059  CBS domain-containing protein  28.6 
 
 
435 aa  200  3.9999999999999996e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2296  protein of unknown function DUF21  35.17 
 
 
433 aa  199  6e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.23749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  32.65 
 
 
432 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  32.49 
 
 
439 aa  199  6e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  32.82 
 
 
432 aa  199  7e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  32.82 
 
 
432 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  33.87 
 
 
432 aa  199  7.999999999999999e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  32.64 
 
 
432 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0521  protein of unknown function DUF21  28.94 
 
 
448 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  34.53 
 
 
465 aa  199  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1126  protein of unknown function DUF21  31.18 
 
 
428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.93664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  35.49 
 
 
433 aa  197  3e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  31.06 
 
 
439 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  32.64 
 
 
432 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  30.59 
 
 
440 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  31.11 
 
 
442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  30.85 
 
 
442 aa  197  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  30.59 
 
 
440 aa  196  6e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2102  hypothetical protein  31.32 
 
 
486 aa  196  6e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0719505  normal  0.288843 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  30.85 
 
 
442 aa  196  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  30.85 
 
 
442 aa  196  7e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  30.85 
 
 
442 aa  196  7e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  35.71 
 
 
439 aa  196  9e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  31.11 
 
 
442 aa  195  1e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  30.3 
 
 
426 aa  195  1e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  33.96 
 
 
443 aa  195  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0646  magnesium and cobalt efflux protein CorC  32.14 
 
 
432 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0238417  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  30.59 
 
 
442 aa  194  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  30.59 
 
 
442 aa  194  2e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5344  protein of unknown function DUF21  33.8 
 
 
444 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.308769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2128  CBS domain-containing protein  29.09 
 
 
435 aa  194  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.695041  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  34.98 
 
 
432 aa  193  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0760  protein of unknown function DUF21  33.02 
 
 
437 aa  193  5e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.332278 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4692  magnesium and cobalt efflux protein CorC  31.87 
 
 
425 aa  193  5e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.200662  hitchhiker  0.0000000000000291685 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  30.85 
 
 
437 aa  193  5e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  30.57 
 
 
435 aa  192  9e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  32.61 
 
 
443 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  32.61 
 
 
443 aa  192  9e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0796  CBS domain-containing protein  42.49 
 
 
340 aa  191  1e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>