More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1207 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  96.7 
 
 		 424 aa  843    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  94.58 
 
 		 424 aa  832    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  100 
 
 		 424 aa  862    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  37.87 
 
 		 429 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  37.18 
 
 		 421 aa  277  2e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  36.71 
 
 		 421 aa  276  5e-73  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  36.75 
 
 		 429 aa  271  1e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  34.13 
 
 		 468 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  36.3 
 
 		 421 aa  268  2e-70  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  37.59 
 
 		 425 aa  259  8e-68  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  38.63 
 
 		 426 aa  258  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  33.74 
 
 		 420 aa  255  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  33.17 
 
 		 414 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  35.43 
 
 		 477 aa  252  1e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  34.57 
 
 		 467 aa  249  5e-65  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  34.08 
 
 		 443 aa  249  9e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1326  protein of unknown function DUF21  38.48 
 
 		 425 aa  248  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00045717  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  32.02 
 
 		 422 aa  248  2e-64  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0885  protein of unknown function DUF21  33.83 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.182877  normal  0.402091 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  36.67 
 
 		 420 aa  244  3e-63  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  33.74 
 
 		 443 aa  242  1e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  33.66 
 
 		 456 aa  241  2e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  33.75 
 
 		 417 aa  239  5e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  33.57 
 
 		 424 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  35.77 
 
 		 420 aa  237  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  33.66 
 
 		 455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  33.25 
 
 		 418 aa  234  2.0000000000000002e-60  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2181  hypothetical protein  31.97 
 
 		 454 aa  234  3e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  33.66 
 
 		 455 aa  233  4.0000000000000004e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  32.37 
 
 		 448 aa  233  4.0000000000000004e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  32.04 
 
 		 426 aa  232  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  33.58 
 
 		 430 aa  231  2e-59  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  31.96 
 
 		 428 aa  229  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  33.75 
 
 		 422 aa  227  3e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  31.62 
 
 		 465 aa  227  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  32.47 
 
 		 434 aa  226  4e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  33.17 
 
 		 417 aa  226  5.0000000000000005e-58  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0407  protein of unknown function DUF21  34.32 
 
 		 464 aa  225  9e-58  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.426667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2004  hypothetical protein  33.01 
 
 		 431 aa  224  3e-57  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2841  hypothetical protein  33.16 
 
 		 423 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.063755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2923  hypothetical protein  33.16 
 
 		 423 aa  223  4e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.801289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  28.98 
 
 		 434 aa  223  4.9999999999999996e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0033  protein of unknown function DUF21  32.7 
 
 		 467 aa  223  4.9999999999999996e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3020  hypothetical protein  32.89 
 
 		 423 aa  222  8e-57  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000521324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0321  CBS domain-containing protein  33.49 
 
 		 439 aa  222  9e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0241096  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  33.02 
 
 		 439 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  32.11 
 
 		 442 aa  220  3e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1165  hypothetical protein  32.31 
 
 		 423 aa  220  3.9999999999999997e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.132593  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  31.82 
 
 		 442 aa  219  6e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2560  protein of unknown function DUF21  32.93 
 
 		 420 aa  219  7e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000312392 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  30.51 
 
 		 437 aa  219  7.999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  31.78 
 
 		 441 aa  219  7.999999999999999e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  34.1 
 
 		 426 aa  219  1e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2263  hypothetical protein  31.57 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.830702  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  33.17 
 
 		 429 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  33.33 
 
 		 423 aa  216  4e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  29.05 
 
 		 464 aa  217  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  31.76 
 
 		 438 aa  217  4e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2230  protein of unknown function DUF21  31.31 
 
 		 464 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.214459  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1630  hypothetical protein  30.63 
 
 		 464 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0911  hypothetical protein  31.22 
 
 		 523 aa  216  9e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1354  hemolysin protein, putative  32.37 
 
 		 423 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  31.2 
 
 		 429 aa  215  9.999999999999999e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1622  magnesium and cobalt efflux protein  31.74 
 
 		 417 aa  214  1.9999999999999998e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0117884  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0561  HlyC/CorC (HCC) family protein  31.74 
 
 		 417 aa  214  2.9999999999999995e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000191293  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2159  protein of unknown function DUF21  33.25 
 
 		 440 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.182374  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  29.88 
 
 		 433 aa  213  4.9999999999999996e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  32.41 
 
 		 479 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1046  hypothetical protein  30.85 
 
 		 427 aa  213  7.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0461701  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  30.49 
 
 		 424 aa  212  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2054  hypothetical protein  32.09 
 
 		 422 aa  212  1e-53  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000265297  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1251  hypothetical protein  32.28 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000842338  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2811  hypothetical protein  29.27 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3106  protein of unknown function DUF21  32.28 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000105483  normal  0.0439763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1284  hypothetical protein  32.28 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1207  hypothetical protein  32.28 
 
 		 424 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000421474  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  31.32 
 
 		 431 aa  210  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  30.71 
 
 		 434 aa  209  5e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  30.15 
 
 		 428 aa  210  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  32.05 
 
 		 446 aa  210  5e-53  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  31.54 
 
 		 442 aa  209  6e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  34.14 
 
 		 445 aa  209  8e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2923  hypothetical protein  31.17 
 
 		 426 aa  209  8e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  29.34 
 
 		 427 aa  208  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  30.2 
 
 		 422 aa  208  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  31.19 
 
 		 434 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  30.14 
 
 		 428 aa  209  1e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  34.14 
 
 		 445 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0886  hypothetical protein  31.05 
 
 		 429 aa  208  1e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  31.28 
 
 		 442 aa  207  3e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3019  hypothetical protein  30.94 
 
 		 427 aa  207  3e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00496912  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7969  protein of unknown function DUF21  31.33 
 
 		 555 aa  206  5e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  29.93 
 
 		 421 aa  206  7e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  30.07 
 
 		 447 aa  206  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  29.59 
 
 		 424 aa  206  9e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1262  hypothetical protein  31.13 
 
 		 533 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  31.82 
 
 		 433 aa  205  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2680  hypothetical protein  28.54 
 
 		 421 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0470  hypothetical protein  31.22 
 
 		 432 aa  204  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000200568  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2757  hypothetical protein  30.56 
 
 		 428 aa  204  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000928443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>