More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_1660 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  100 
 
 
461 aa  896    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  66.13 
 
 
464 aa  501  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  64.1 
 
 
464 aa  499  1e-140  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  62.62 
 
 
426 aa  475  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  62.05 
 
 
435 aa  468  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  61.7 
 
 
442 aa  463  1e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  61.58 
 
 
425 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  60.46 
 
 
434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  54.88 
 
 
435 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  55.58 
 
 
436 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  55.58 
 
 
436 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  55.58 
 
 
436 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  58.96 
 
 
452 aa  440  9.999999999999999e-123  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  54.97 
 
 
483 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  56.43 
 
 
490 aa  437  1e-121  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1269  CBS  57.05 
 
 
454 aa  434  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  55.32 
 
 
430 aa  434  1e-120  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  59.45 
 
 
457 aa  429  1e-119  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  59.57 
 
 
484 aa  426  1e-118  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  55.27 
 
 
432 aa  421  1e-116  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  54.33 
 
 
432 aa  410  1e-113  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  53.81 
 
 
437 aa  404  1e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  58.99 
 
 
537 aa  398  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  50 
 
 
495 aa  372  1e-102  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  53.71 
 
 
438 aa  367  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  50 
 
 
439 aa  365  1e-99  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  47.33 
 
 
465 aa  344  2e-93  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  47.24 
 
 
443 aa  329  5.0000000000000004e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  45.18 
 
 
447 aa  308  1.0000000000000001e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  43.65 
 
 
456 aa  300  4e-80  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  44.15 
 
 
448 aa  275  1.0000000000000001e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  33.83 
 
 
420 aa  259  8e-68  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0594  hemolysin-like protein  36.19 
 
 
477 aa  253  4.0000000000000004e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  39.31 
 
 
444 aa  250  3e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2186  CBS domain containing protein  47.62 
 
 
476 aa  246  4e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  35.59 
 
 
425 aa  228  2e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  34.81 
 
 
421 aa  227  3e-58  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0862  CBS domain protein  51.08 
 
 
499 aa  227  4e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12320  CBS domain-containing protein  39.31 
 
 
441 aa  227  4e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  35.57 
 
 
434 aa  224  3e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  31.22 
 
 
443 aa  223  7e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  32.3 
 
 
429 aa  219  7.999999999999999e-56  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  37.44 
 
 
435 aa  218  1e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  36.96 
 
 
439 aa  217  4e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  31.93 
 
 
430 aa  211  3e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  36.41 
 
 
426 aa  205  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  29.11 
 
 
424 aa  204  2e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1544  CBS domain containing protein  43.31 
 
 
441 aa  205  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  29.11 
 
 
424 aa  204  4e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  44.72 
 
 
284 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  28.64 
 
 
424 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  36.65 
 
 
420 aa  200  5e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  34.17 
 
 
447 aa  200  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  29.14 
 
 
422 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  30.22 
 
 
455 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  29.91 
 
 
429 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  32.22 
 
 
421 aa  197  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  28.6 
 
 
455 aa  195  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  31.74 
 
 
421 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  29.95 
 
 
434 aa  194  3e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0832  hypothetical protein  30.63 
 
 
417 aa  194  4e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000822238 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  27.48 
 
 
434 aa  192  7e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0762  hypothetical protein  34.37 
 
 
456 aa  192  8e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0171545  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  32.37 
 
 
447 aa  192  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  29.63 
 
 
468 aa  191  2e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  34.67 
 
 
420 aa  191  2e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1713  protein of unknown function DUF21  29.75 
 
 
477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  32.46 
 
 
442 aa  190  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0534  hypothetical protein  33.64 
 
 
436 aa  190  5e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.616871 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  41.32 
 
 
296 aa  190  5e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  29.74 
 
 
437 aa  189  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3066  hypothetical protein  31.88 
 
 
429 aa  190  5.999999999999999e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.897226  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  38.21 
 
 
421 aa  188  1e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0967  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 
439 aa  188  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.854838 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3282  protein of unknown function DUF21  32.94 
 
 
433 aa  189  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  31.76 
 
 
445 aa  188  2e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  34.4 
 
 
444 aa  186  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0049  protein of unknown function DUF21  27.99 
 
 
467 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  31.4 
 
 
432 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0292  hypothetical protein  31.57 
 
 
440 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.682803 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  33.41 
 
 
443 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0558  CBS domain-containing protein  26.92 
 
 
427 aa  183  5.0000000000000004e-45  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1007  hypothetical protein  29.07 
 
 
422 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  27.62 
 
 
414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  36.78 
 
 
427 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0537  hypothetical protein  31.69 
 
 
447 aa  183  7e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.947499  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  41.13 
 
 
284 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  32.78 
 
 
431 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  33.8 
 
 
434 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  30.11 
 
 
443 aa  182  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  39.15 
 
 
276 aa  181  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1183  protein of unknown function DUF21  29.98 
 
 
424 aa  181  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000010351  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0397  CBS domain-containing protein  40.3 
 
 
291 aa  180  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.467149 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  39.92 
 
 
285 aa  179  5.999999999999999e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  31.51 
 
 
434 aa  180  5.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  40.82 
 
 
287 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  40.45 
 
 
287 aa  178  1e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  27.83 
 
 
442 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1827  hypothetical protein  27.29 
 
 
448 aa  178  2e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  32.83 
 
 
433 aa  178  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>