More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2230 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  81.8 
 
 
443 aa  709    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  100 
 
 
447 aa  881    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  48.4 
 
 
452 aa  333  3e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  47 
 
 
434 aa  331  1e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  45.24 
 
 
495 aa  330  4e-89  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  46.02 
 
 
425 aa  328  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  45.18 
 
 
461 aa  327  3e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  47.92 
 
 
442 aa  324  2e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  48.48 
 
 
438 aa  320  1.9999999999999998e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12320  CBS domain-containing protein  47.83 
 
 
441 aa  313  2.9999999999999996e-84  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  44.36 
 
 
483 aa  306  3e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  42.45 
 
 
430 aa  304  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  44.39 
 
 
464 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  43.69 
 
 
464 aa  298  1e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  44.56 
 
 
435 aa  298  1e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  41.93 
 
 
426 aa  288  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  41.02 
 
 
456 aa  288  1e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  44.14 
 
 
448 aa  285  1.0000000000000001e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  43.27 
 
 
457 aa  282  8.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  40.96 
 
 
439 aa  281  1e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1269  CBS  45.93 
 
 
454 aa  281  1e-74  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  40.85 
 
 
436 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  40.85 
 
 
436 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  40.85 
 
 
436 aa  281  2e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  46.92 
 
 
484 aa  279  8e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  40.69 
 
 
435 aa  275  1.0000000000000001e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  42.04 
 
 
490 aa  275  2.0000000000000002e-72  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  49.28 
 
 
537 aa  272  9e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  40.92 
 
 
465 aa  265  2e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2186  CBS domain containing protein  48.21 
 
 
476 aa  263  4e-69  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  38.15 
 
 
444 aa  259  5.0000000000000005e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  38.77 
 
 
432 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  41.06 
 
 
432 aa  259  8e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  40.1 
 
 
437 aa  258  1e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  36.75 
 
 
420 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0594  hemolysin-like protein  35.01 
 
 
477 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  31.88 
 
 
420 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  43.27 
 
 
439 aa  211  2e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  36.34 
 
 
429 aa  208  2e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1544  CBS domain containing protein  46.43 
 
 
441 aa  207  3e-52  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0862  CBS domain protein  35.14 
 
 
499 aa  206  5e-52  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  44.03 
 
 
447 aa  204  3e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  39.56 
 
 
435 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  40.53 
 
 
421 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  36.39 
 
 
421 aa  197  3e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  33.53 
 
 
434 aa  195  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  34.75 
 
 
429 aa  193  5e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  36.71 
 
 
425 aa  193  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  32.89 
 
 
434 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  31.83 
 
 
430 aa  190  4e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  41.02 
 
 
284 aa  190  4e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  36.33 
 
 
427 aa  189  5.999999999999999e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2000  hemolysin-like protein  28.7 
 
 
445 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0678745  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  35.69 
 
 
433 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1066  protein of unknown function DUF21  33.85 
 
 
426 aa  184  3e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.905964  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  31.03 
 
 
422 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2235  CBS domain containing protein  38.24 
 
 
439 aa  183  5.0000000000000004e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  29.61 
 
 
424 aa  182  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  39.69 
 
 
285 aa  182  9.000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  35.41 
 
 
420 aa  182  1e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  41.77 
 
 
284 aa  181  2e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1419  protein of unknown function DUF21  33.03 
 
 
423 aa  180  4.999999999999999e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4066  protein of unknown function DUF21  34.74 
 
 
438 aa  180  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.659836  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  28.75 
 
 
424 aa  179  7e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  28.54 
 
 
424 aa  179  8e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1588  protein of unknown function DUF21  33.49 
 
 
443 aa  179  8e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2966  protein of unknown function DUF21  33.8 
 
 
439 aa  179  1e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4410  protein of unknown function DUF21  33.72 
 
 
444 aa  178  2e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.938013  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1606  hemolysin-like protein  29.58 
 
 
443 aa  178  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0714858  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  31.99 
 
 
437 aa  178  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3306  CBS domain-containing protein  39.02 
 
 
291 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1103  CBS domain containing protein  39.02 
 
 
291 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107663 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3442  CBS domain-containing protein  39.02 
 
 
291 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000638255 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  36.9 
 
 
426 aa  177  4e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3264  CBS domain-containing protein  39.02 
 
 
291 aa  177  4e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  29.7 
 
 
421 aa  176  5e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  35.43 
 
 
442 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2767  hypothetical protein  34.66 
 
 
434 aa  176  6e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  37.46 
 
 
447 aa  176  7e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  34.55 
 
 
446 aa  175  9.999999999999999e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  32.61 
 
 
421 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  35.58 
 
 
431 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  29.31 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  32.23 
 
 
417 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  38.21 
 
 
291 aa  174  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0669  hypothetical protein  32.86 
 
 
439 aa  173  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0810091 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  44.2 
 
 
250 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  36.36 
 
 
276 aa  173  5.999999999999999e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  37.8 
 
 
291 aa  172  6.999999999999999e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1383  transport protein  39 
 
 
434 aa  172  6.999999999999999e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.283032  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  39.56 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2318  protein of unknown function DUF21  29.21 
 
 
464 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.142674  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  30.95 
 
 
455 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  37.4 
 
 
291 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  34.02 
 
 
445 aa  171  3e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0389  hypothetical protein  33.85 
 
 
438 aa  171  3e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  31.23 
 
 
455 aa  171  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  36.99 
 
 
291 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  36.99 
 
 
291 aa  170  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3536  CBS domain-containing protein  35.73 
 
 
422 aa  169  7e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>