More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2760 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
437 aa  860    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  65.06 
 
 
436 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  65.06 
 
 
436 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  65.06 
 
 
436 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  64.47 
 
 
435 aa  528  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  62.71 
 
 
490 aa  503  1e-141  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  64.51 
 
 
432 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  64.34 
 
 
432 aa  495  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  59.42 
 
 
435 aa  464  1e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  58.67 
 
 
457 aa  447  1.0000000000000001e-124  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  53.81 
 
 
461 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  56.67 
 
 
426 aa  413  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  51.61 
 
 
430 aa  404  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  56.59 
 
 
537 aa  398  9.999999999999999e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  55.63 
 
 
464 aa  394  1e-108  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  55.06 
 
 
464 aa  389  1e-107  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  54.99 
 
 
442 aa  384  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  53.27 
 
 
434 aa  379  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  51.71 
 
 
425 aa  375  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  50.81 
 
 
452 aa  372  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  51.29 
 
 
483 aa  354  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1269  CBS  47.02 
 
 
454 aa  340  2e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  51.25 
 
 
484 aa  338  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  47.33 
 
 
438 aa  333  3e-90  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  44.99 
 
 
495 aa  321  1.9999999999999998e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  46.6 
 
 
439 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  43.89 
 
 
465 aa  311  1e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  43.97 
 
 
443 aa  280  3e-74  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  41.76 
 
 
456 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  40.1 
 
 
447 aa  258  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  39.51 
 
 
448 aa  243  3.9999999999999997e-63  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  37.89 
 
 
444 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  35.2 
 
 
439 aa  213  5.999999999999999e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2186  CBS domain containing protein  43.75 
 
 
476 aa  213  7e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  30.02 
 
 
420 aa  212  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0594  hemolysin-like protein  33.85 
 
 
477 aa  206  8e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  34.16 
 
 
434 aa  205  1e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0862  CBS domain protein  43.41 
 
 
499 aa  202  9.999999999999999e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  33.16 
 
 
417 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  35.32 
 
 
420 aa  200  3.9999999999999996e-50  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  32.18 
 
 
421 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  34.96 
 
 
435 aa  195  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  33.79 
 
 
427 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  31.81 
 
 
437 aa  191  2e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  35.93 
 
 
442 aa  190  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  30.92 
 
 
446 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12320  CBS domain-containing protein  35.66 
 
 
441 aa  186  7e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  30.24 
 
 
429 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  33.69 
 
 
447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  30.89 
 
 
425 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  30.97 
 
 
420 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  30.08 
 
 
434 aa  183  5.0000000000000004e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1544  CBS domain containing protein  36.83 
 
 
441 aa  181  2.9999999999999997e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  27.49 
 
 
455 aa  180  4.999999999999999e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  28.15 
 
 
455 aa  179  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  29.81 
 
 
432 aa  179  1e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  39.09 
 
 
284 aa  179  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  29.66 
 
 
421 aa  179  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  29.66 
 
 
421 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  29.57 
 
 
432 aa  178  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  27.18 
 
 
424 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  39.19 
 
 
285 aa  177  5e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  26.98 
 
 
443 aa  176  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  30.17 
 
 
446 aa  176  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  27.18 
 
 
424 aa  176  8e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  27.64 
 
 
422 aa  175  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2725  CBS domain-containing protein  41.5 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.49452  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2086  transporter-associated region  41.5 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0362455  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2698  CBS domain-containing protein  41.5 
 
 
295 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0164111  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0885  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.86 
 
 
403 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.216918  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2750  transporter-associated region  41.02 
 
 
295 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.29691  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  35.8 
 
 
276 aa  175  1.9999999999999998e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2615  transporter-associated region  41.02 
 
 
295 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0650038  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1178  magnesium and cobalt efflux protein CorC  38.65 
 
 
291 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  27.85 
 
 
440 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  31.96 
 
 
426 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6025  putative Mg2+ and Co2+ transporter CorC  41.5 
 
 
295 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.097804  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0601  CBS domain-containing protein  41.5 
 
 
295 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  41.05 
 
 
291 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2725  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.86 
 
 
295 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0221  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.86 
 
 
295 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0704  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.86 
 
 
295 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459975  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0664  CBS domain protein  28.9 
 
 
432 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7650000000000002e-36 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  31.85 
 
 
445 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2433  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.86 
 
 
295 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0719  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.86 
 
 
295 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.742148  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2353  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.86 
 
 
295 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  28.9 
 
 
432 aa  173  5e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4348  CBS:transporter-associated region  41.47 
 
 
280 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4953  transporter-associated region  40.55 
 
 
279 aa  173  6.999999999999999e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.387365 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  37.35 
 
 
296 aa  172  6.999999999999999e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0519  hypothetical protein  28.9 
 
 
432 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0519  hypothetical protein  28.9 
 
 
432 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0587  magnesium and cobalt efflux protein CorC  40.47 
 
 
295 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4807  metal ion transporter, putative  41.47 
 
 
280 aa  172  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  27.18 
 
 
424 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0868  CBS domain containing protein  39.68 
 
 
279 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3536  CBS domain-containing protein  37.74 
 
 
422 aa  172  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  33.65 
 
 
421 aa  172  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  28.69 
 
 
429 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>