More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_13600 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  100 
 
 
457 aa  887    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  70.6 
 
 
435 aa  541  1e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  58.67 
 
 
437 aa  452  1.0000000000000001e-126  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  59.18 
 
 
461 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  56.52 
 
 
436 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  56.52 
 
 
436 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  56.52 
 
 
436 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  57.08 
 
 
435 aa  442  1e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  58.6 
 
 
432 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  57.61 
 
 
432 aa  433  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  59.14 
 
 
464 aa  424  1e-117  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  55.34 
 
 
490 aa  418  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  57.27 
 
 
464 aa  417  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  56.84 
 
 
426 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  54.39 
 
 
430 aa  412  1e-114  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  56.09 
 
 
442 aa  410  1e-113  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  58.7 
 
 
537 aa  406  1.0000000000000001e-112  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  52.94 
 
 
452 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  56.97 
 
 
425 aa  399  9.999999999999999e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  57.18 
 
 
483 aa  400  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  55.93 
 
 
434 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1269  CBS  51.3 
 
 
454 aa  374  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  55.05 
 
 
484 aa  366  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  47.99 
 
 
439 aa  347  3e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  48.68 
 
 
495 aa  343  4e-93  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  49.25 
 
 
438 aa  322  9.000000000000001e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  45.88 
 
 
465 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  42.03 
 
 
443 aa  290  3e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  41.83 
 
 
447 aa  275  1.0000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  40.62 
 
 
456 aa  259  8e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  44.32 
 
 
448 aa  238  2e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  32.05 
 
 
420 aa  222  9.999999999999999e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  34.39 
 
 
421 aa  218  1e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  34.69 
 
 
434 aa  219  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  40.23 
 
 
444 aa  219  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0594  hemolysin-like protein  35.98 
 
 
477 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2186  CBS domain containing protein  42.99 
 
 
476 aa  213  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12320  CBS domain-containing protein  39.18 
 
 
441 aa  213  7.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  34.3 
 
 
447 aa  200  3.9999999999999996e-50  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  39.79 
 
 
439 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1278  aminotransferase class-III  33.99 
 
 
420 aa  199  6e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.429678 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1548  protein of unknown function DUF21  29.98 
 
 
468 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  30.47 
 
 
429 aa  197  3e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  32.3 
 
 
442 aa  196  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  29.57 
 
 
455 aa  196  7e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  29.95 
 
 
455 aa  195  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 
442 aa  194  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  32.06 
 
 
442 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  31.82 
 
 
442 aa  194  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  31.82 
 
 
442 aa  194  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  31.82 
 
 
442 aa  192  7e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  31.82 
 
 
442 aa  193  7e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  31.82 
 
 
442 aa  193  7e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  34.93 
 
 
446 aa  191  2e-47  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0394  protein of unknown function DUF21  28.61 
 
 
414 aa  190  4e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0591737  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  39.15 
 
 
447 aa  190  4e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  29.21 
 
 
424 aa  190  4e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  32.11 
 
 
434 aa  190  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3422  CBS domain-containing protein  31.72 
 
 
435 aa  190  5e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0862  CBS domain protein  33 
 
 
499 aa  187  2e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  31.58 
 
 
440 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  32.65 
 
 
425 aa  188  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1207  hypothetical protein  29.21 
 
 
424 aa  187  3e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.213322  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  36.39 
 
 
420 aa  186  5e-46  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1425  hypothetical protein  28.64 
 
 
424 aa  186  9e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.196446  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  33.76 
 
 
426 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  31.7 
 
 
417 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  39.55 
 
 
421 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  31.1 
 
 
440 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  37.54 
 
 
435 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  31.68 
 
 
431 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  38.34 
 
 
281 aa  182  1e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  30.09 
 
 
447 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1544  CBS domain containing protein  33.33 
 
 
441 aa  181  2e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2870  hypothetical protein  32.61 
 
 
433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.221651  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  40.73 
 
 
284 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4780  protein of unknown function DUF21  32.51 
 
 
443 aa  179  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.000717269  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1285  hypothetical protein  30.81 
 
 
446 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0324547  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0439  CBS/transporter associated domain-containing protein  28.57 
 
 
445 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0433  transport protein ysiA  28.57 
 
 
445 aa  178  2e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  28.22 
 
 
430 aa  178  2e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  31.59 
 
 
421 aa  176  8e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01240  CBS domain-containing protein  32.45 
 
 
443 aa  175  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2206  hypothetical protein  30.81 
 
 
437 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.287876  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  31.34 
 
 
421 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0890  CBS domain-containing protein  40.59 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.192583  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  26 
 
 
422 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  26.72 
 
 
443 aa  174  2.9999999999999996e-42  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1410  protein of unknown function DUF21  30.9 
 
 
456 aa  173  5.999999999999999e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  29.53 
 
 
437 aa  172  7.999999999999999e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  36.93 
 
 
276 aa  172  9e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0676  CBS domain-containing protein  32.09 
 
 
432 aa  171  2e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  36.64 
 
 
445 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2270  CBS domain protein  29.77 
 
 
443 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  39.42 
 
 
292 aa  171  2e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1072  hypothetical protein  30.37 
 
 
442 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.638225  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3140  CBS domain-containing protein  39.6 
 
 
293 aa  171  3e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.328358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0735  CBS domain protein  32.09 
 
 
432 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2858  CBS domain-containing protein  38.96 
 
 
291 aa  170  4e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  30.66 
 
 
432 aa  170  4e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>