More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0842 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0842  protein of unknown function DUF21  100 
 
 
430 aa  865    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0424  protein of unknown function DUF21  65.22 
 
 
428 aa  567  1e-160  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0469  hypothetical protein  59.9 
 
 
426 aa  499  1e-140  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272499  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1166  hypothetical protein  58.21 
 
 
427 aa  498  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.215094 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2313  hypothetical protein  55.12 
 
 
426 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2263  hypothetical protein  58.74 
 
 
440 aa  473  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.830702  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002533  putative hemolysin  54.81 
 
 
422 aa  472  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0886  hypothetical protein  58.15 
 
 
429 aa  474  1e-132  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.37649 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1060  hypothetical protein  57.83 
 
 
427 aa  473  1e-132  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00777196  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1046  hypothetical protein  54.09 
 
 
427 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0461701  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1156  hypothetical protein  56.25 
 
 
431 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0523696  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2757  hypothetical protein  58 
 
 
428 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000928443  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1668  hypothetical protein  53.59 
 
 
429 aa  465  9.999999999999999e-131  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.905318  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1165  hypothetical protein  56.39 
 
 
423 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.132593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1251  hypothetical protein  56.39 
 
 
424 aa  458  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000842338  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1207  hypothetical protein  56.63 
 
 
424 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000421474  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3106  protein of unknown function DUF21  56.63 
 
 
424 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000105483  normal  0.0439763 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2841  hypothetical protein  56.39 
 
 
423 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.063755  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2923  hypothetical protein  56.39 
 
 
423 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.801289  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3020  hypothetical protein  56.39 
 
 
423 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000521324  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1284  hypothetical protein  56.63 
 
 
424 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00121999  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1354  hemolysin protein, putative  55.66 
 
 
423 aa  455  1e-127  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1251  hypothetical protein  54.91 
 
 
424 aa  455  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000334819  hitchhiker  0.00000258332 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2923  hypothetical protein  56.49 
 
 
426 aa  457  1e-127  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0646  putative transport protein  52.88 
 
 
423 aa  452  1.0000000000000001e-126  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.781134  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4076  putative magnesium and cobalt efflux protein CorB  54.05 
 
 
421 aa  450  1e-125  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0092  hypothetical protein  52.98 
 
 
426 aa  451  1e-125  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0306325  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3404  hypothetical protein  53.03 
 
 
428 aa  449  1e-125  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.978563  normal  0.632864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3370  hemolysin  53.85 
 
 
423 aa  451  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03483  hypothetical protein  54.48 
 
 
395 aa  444  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3019  hypothetical protein  52.54 
 
 
427 aa  438  9.999999999999999e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00496912  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2680  hypothetical protein  51.88 
 
 
421 aa  431  1e-119  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2811  hypothetical protein  51.63 
 
 
421 aa  427  1e-118  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1777  protein of unknown function DUF21  51.21 
 
 
424 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1429  transporter  50.6 
 
 
419 aa  424  1e-117  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.836538  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39600  Mg/Co transporter-like protein  50.25 
 
 
426 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.100251  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3773  hypothetical protein  50.24 
 
 
418 aa  421  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.163336  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3367  hypothetical protein  49.26 
 
 
427 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00577149  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3232  hypothetical protein  49.26 
 
 
418 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000119021  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1062  protein of unknown function DUF21  48.88 
 
 
413 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000790091  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2825  hypothetical protein  48.63 
 
 
413 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00280306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1071  hypothetical protein  48.88 
 
 
413 aa  413  1e-114  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0188831  normal  0.0406794 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0849  hypothetical protein  51.13 
 
 
429 aa  412  1e-114  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000648521  hitchhiker  0.0000222957 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2895  hypothetical protein  48.63 
 
 
413 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.132173  normal  0.997899 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3093  hypothetical protein  50.12 
 
 
413 aa  414  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000167222  normal  0.148775 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2893  hypothetical protein  48.63 
 
 
413 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0561  HlyC/CorC (HCC) family protein  48.89 
 
 
417 aa  411  1e-113  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000191293  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2771  hypothetical protein  49.37 
 
 
420 aa  411  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000124547  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3001  hypothetical protein  49.37 
 
 
420 aa  411  1e-113  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000119732  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2764  hypothetical protein  49.37 
 
 
420 aa  411  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000294524  normal  0.119885 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1622  magnesium and cobalt efflux protein  49.38 
 
 
417 aa  410  1e-113  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0117884  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2875  hypothetical protein  48.38 
 
 
413 aa  411  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.156935  normal  0.0970884 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3007  hypothetical protein  48.38 
 
 
413 aa  410  1e-113  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.103767  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2896  hypothetical protein  49.37 
 
 
420 aa  411  1e-113  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000147354  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2371  transmembrane protein  51.32 
 
 
432 aa  404  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.242025 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02501  predicted inner membrane protein  48.7 
 
 
398 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000917299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02465  hypothetical protein  48.7 
 
 
398 aa  393  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000805698  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0996  hypothetical protein  47.97 
 
 
428 aa  388  1e-107  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2132  hypothetical protein  50.37 
 
 
432 aa  391  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0846344  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02692  hypothetical protein  52.36 
 
 
394 aa  375  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000130738  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3069  protein of unknown function DUF21  43.46 
 
 
424 aa  369  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.319515  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2824  hypothetical protein  43.33 
 
 
425 aa  368  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000593821  normal  0.0984639 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0640  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  44.66 
 
 
423 aa  367  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1200  metal dependent phosphohydrolase  48.57 
 
 
426 aa  364  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2704  protein of unknown function DUF21  42.52 
 
 
424 aa  362  5.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1176  protein of unknown function DUF21  45.93 
 
 
426 aa  358  9.999999999999999e-98  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.50437  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2817  hypothetical protein  42.92 
 
 
497 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.292015  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3664  hypothetical protein  42.11 
 
 
430 aa  354  2e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000481216  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0097  hypothetical protein  42.49 
 
 
457 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000140223  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0579  hypothetical protein  42.49 
 
 
457 aa  354  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000000460959  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0482  hypothetical protein  41.55 
 
 
429 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000251302  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2654  hypothetical protein  44.1 
 
 
405 aa  344  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0452813  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1137  CBS domain-containing protein  42.82 
 
 
431 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3451  protein of unknown function DUF21  41.35 
 
 
403 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00533306  hitchhiker  0.000732193 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3252  putative transporter  42.59 
 
 
431 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2530  CBS domain-containing protein  42.59 
 
 
431 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0505  CorC family Mg2+ / Co2+ transporter  42.05 
 
 
403 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0175643  normal  0.331146 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1310  CBS domain-containing protein  42.59 
 
 
431 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3530  putative transporter  42.59 
 
 
431 aa  335  1e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0452  CBS domain-containing protein  42.59 
 
 
431 aa  335  1e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3505  putative transporter  42.76 
 
 
431 aa  333  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3526  CBS domain-containing protein  42.56 
 
 
467 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1370  hypothetical protein  46.85 
 
 
429 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0549  hypothetical protein  41.71 
 
 
401 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000304401  normal  0.0362947 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0507  hypothetical protein  41.27 
 
 
400 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00000590838  normal  0.67931 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0510  hypothetical protein  40.63 
 
 
420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.17258  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0203  protein of unknown function DUF21  40.35 
 
 
429 aa  318  2e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.228231 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0187  hypothetical protein  41.02 
 
 
429 aa  315  9.999999999999999e-85  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.691069  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15930  hemolysin  47.74 
 
 
430 aa  311  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.467501  normal  0.32719 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  38.85 
 
 
433 aa  272  9e-72  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1532  hypothetical protein  36.55 
 
 
442 aa  260  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.788333 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0886  putative membrane protein, truncation  55.92 
 
 
242 aa  260  4e-68  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0622559  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1427  hypothetical protein  37.02 
 
 
437 aa  259  8e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.108419 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2814  hypothetical protein  35.51 
 
 
442 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1482  hypothetical protein  35.51 
 
 
442 aa  249  7e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.14439  normal  0.218713 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  36.69 
 
 
417 aa  246  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0718  hypothetical protein  37.26 
 
 
428 aa  240  2.9999999999999997e-62  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.229015  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2563  hypothetical protein  36.27 
 
 
434 aa  240  4e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.645388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2275  hypothetical protein  37.1 
 
 
429 aa  237  3e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.746126  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1716  hypothetical protein  37.14 
 
 
429 aa  237  3e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.230477  normal  0.276793 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>