31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0260 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_0260  CBS domain-containing protein  100 
 
 
212 aa  439  9.999999999999999e-123  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000543985  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0268  CBS domain-containing protein  58.49 
 
 
226 aa  256  1e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.812709  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0397  CBS domain-containing protein  44.13 
 
 
214 aa  204  7e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3255  CBS domain protein  32.5 
 
 
215 aa  130  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.926669 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2052  CBS domain protein  32.5 
 
 
215 aa  129  3e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0896141  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2162  CBS domain protein  32 
 
 
215 aa  129  3e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.317884  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1550  CBS domain-containing protein  30.85 
 
 
215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.241797  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1868  hemolysin-like protein  31.5 
 
 
215 aa  128  6e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00862895  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2094  CBS domain protein  31.5 
 
 
215 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1915  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 
215 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2061  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 
215 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2131  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 
215 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.766649  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1877  hemolysin-like protein  31.5 
 
 
215 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1224  hypothetical protein  30.88 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1912  CBS domain-containing protein  31 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.043579  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1487  CBS domain protein  31.31 
 
 
207 aa  126  3e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1348  CBS domain-containing protein  30.39 
 
 
207 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1421  CBS domain protein  30.39 
 
 
207 aa  125  5e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0200653 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1222  hypothetical protein  30.39 
 
 
207 aa  125  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00319032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1249  CBS domain-containing protein  30.39 
 
 
207 aa  125  5e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1446  CBS domain-containing protein  30.81 
 
 
207 aa  124  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.187706  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3960  CBS domain protein  31.34 
 
 
207 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1384  CBS domain protein  30.85 
 
 
207 aa  124  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1247  CBS domain-containing protein  30.35 
 
 
207 aa  119  3e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1056  CBS domain-containing protein  28.28 
 
 
207 aa  116  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2421  CBS domain-containing protein  25.93 
 
 
206 aa  57.8  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2131  CBS domain-containing protein  25.46 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  26.63 
 
 
214 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1597  CBS domain-containing protein  26.32 
 
 
157 aa  43.9  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  24.54 
 
 
313 aa  43.9  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2685  signal transduction protein  26.96 
 
 
147 aa  42.7  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.209094  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>