More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1716 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1716  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  100 
 
 
489 aa  993    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.626692  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1382  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  70.84 
 
 
489 aa  701    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.614319 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2060  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  74.23 
 
 
490 aa  737    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2632  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  66.53 
 
 
486 aa  676    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1568  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  72.04 
 
 
488 aa  708    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2358  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.61 
 
 
494 aa  530  1e-149  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.890412  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1197  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  56.3 
 
 
491 aa  526  1e-148  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0819  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.49 
 
 
500 aa  521  1e-146  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.319462  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1132  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  55.49 
 
 
500 aa  518  1e-146  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.41509  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1545  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.25 
 
 
496 aa  516  1.0000000000000001e-145  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.308364  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1209  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.36 
 
 
499 aa  512  1e-144  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000206103  hitchhiker  0.00000852941 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1947  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.18 
 
 
500 aa  511  1e-144  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2784  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.09 
 
 
495 aa  511  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.757104  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0805  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.94 
 
 
488 aa  509  1e-143  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1138  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.94 
 
 
500 aa  503  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0486  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.65 
 
 
482 aa  501  1e-140  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0328  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.65 
 
 
482 aa  501  1e-140  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1578  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.05 
 
 
483 aa  500  1e-140  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0722651  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0653  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.54 
 
 
500 aa  499  1e-140  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1107  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.88 
 
 
503 aa  495  1e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.714847  normal  0.939326 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0612  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  53.12 
 
 
483 aa  498  1e-139  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.00142081  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1628  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.89 
 
 
497 aa  496  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1639  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.86 
 
 
488 aa  497  1e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0762082  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0116  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.38 
 
 
508 aa  494  9.999999999999999e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000189991  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1108  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.08 
 
 
485 aa  492  9.999999999999999e-139  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.927877  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1790  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  54.71 
 
 
499 aa  491  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00154566  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1482  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.18 
 
 
482 aa  488  1e-137  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0742  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.73 
 
 
510 aa  491  1e-137  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00516677  normal  0.265718 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0500  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.33 
 
 
490 aa  490  1e-137  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1433  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.04 
 
 
496 aa  488  1e-137  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.51558 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0189  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.67 
 
 
489 aa  487  1e-136  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000133225  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1436  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.18 
 
 
482 aa  488  1e-136  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1070  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.12 
 
 
485 aa  487  1e-136  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.462822  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1137  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.43 
 
 
489 aa  487  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0979  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  51.87 
 
 
482 aa  486  1e-136  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1320  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.98 
 
 
504 aa  485  1e-136  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0931634  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1168  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.67 
 
 
486 aa  484  1e-135  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.249665  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1520  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.75 
 
 
487 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0307442  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4447  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  50.82 
 
 
501 aa  484  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1615  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.75 
 
 
487 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.9 
 
 
491 aa  482  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100541 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0366  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.55 
 
 
516 aa  482  1e-135  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.213754 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1159  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  50.52 
 
 
483 aa  479  1e-134  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.839971  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2146  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  52.76 
 
 
498 aa  479  1e-134  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1091  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  50.1 
 
 
495 aa  480  1e-134  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2349  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.54 
 
 
487 aa  478  1e-134  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163967  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0514  response regulator receiver protein  51.25 
 
 
484 aa  481  1e-134  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.135977  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2546  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  52.76 
 
 
498 aa  479  1e-134  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.509974  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4214  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.33 
 
 
488 aa  480  1e-134  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0829  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.03 
 
 
504 aa  479  1e-134  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.363415  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3370  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.89 
 
 
489 aa  475  1e-133  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0489  IMP dehydrogenase  51.84 
 
 
497 aa  475  1e-133  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2293  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.77 
 
 
491 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.711267  normal  0.709548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0968  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.03 
 
 
497 aa  478  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.242284  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20480  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  50.73 
 
 
486 aa  475  1e-133  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000012591  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1459  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.14 
 
 
556 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.439962  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2264  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  52.16 
 
 
498 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.334086 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1524  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  50.41 
 
 
487 aa  478  1e-133  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1488  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  53.89 
 
 
497 aa  475  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0749  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  50.93 
 
 
493 aa  476  1e-133  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2195  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.34 
 
 
491 aa  472  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28670  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  48.47 
 
 
507 aa  473  1e-132  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0638  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.39 
 
 
504 aa  472  1e-132  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.726913  normal  0.734007 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1201  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  51.35 
 
 
485 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.795344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3837  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.16 
 
 
520 aa  474  1e-132  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0276  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  51.85 
 
 
482 aa  474  1e-132  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1314  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  51.66 
 
 
486 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0664  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  51.55 
 
 
485 aa  473  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.116725  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0623  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  50.41 
 
 
492 aa  473  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.637063 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4227  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.36 
 
 
520 aa  474  1e-132  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.147199 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1049  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.02 
 
 
496 aa  474  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0106058 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1078  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  51.55 
 
 
485 aa  474  1e-132  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.472537  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1726  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.36 
 
 
503 aa  474  1e-132  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4253  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.39 
 
 
500 aa  472  1e-132  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1923  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.03 
 
 
496 aa  473  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1906  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  50.4 
 
 
484 aa  472  1e-132  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0999  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.49 
 
 
491 aa  472  1e-132  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000499041  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3122  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.9 
 
 
496 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.698548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2587  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.9 
 
 
503 aa  469  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000196974 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3391  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  50.73 
 
 
493 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.207114  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2338  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  52.8 
 
 
487 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.879992  normal  0.100057 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16510  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  48.57 
 
 
514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00613898  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0788  IMP dehydrogenase  53.27 
 
 
497 aa  471  1.0000000000000001e-131  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08690  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.49 
 
 
499 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0432795  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3193  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  51.55 
 
 
498 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.291902  normal  0.962231 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04740  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  50.31 
 
 
514 aa  470  1.0000000000000001e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0916  IMP dehydrogenase  50.52 
 
 
484 aa  470  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.366746  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2879  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.49 
 
 
503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0154703  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2495  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  51.34 
 
 
498 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1082  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  47.97 
 
 
514 aa  469  1.0000000000000001e-131  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2596  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  48.78 
 
 
500 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0405  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  51.13 
 
 
485 aa  467  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0548973 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0770  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  49.79 
 
 
481 aa  468  9.999999999999999e-131  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0061566  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1141  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  50.83 
 
 
486 aa  468  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.144187 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1160  IMP dehydrogenase  49.28 
 
 
493 aa  466  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.827083  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3166  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.9 
 
 
496 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.224874  normal  0.708004 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1167  inosine 5'-monophosphate dehydrogenase  49.9 
 
 
517 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.446861  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3087  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  50.42 
 
 
485 aa  467  9.999999999999999e-131  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000190164  hitchhiker  0.00103544 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1904  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  50.94 
 
 
483 aa  467  9.999999999999999e-131  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00977743  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2939  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  49.9 
 
 
496 aa  467  9.999999999999999e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.27006 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>