More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_0768 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  100 
 
 		 138 aa  278  1e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1068  CBS domain-containing protein  47.1 
 
 		 139 aa  141  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  34.56 
 
 		 232 aa  89.4  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 210 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1760  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 		 279 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000000218135  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  36.15 
 
 		 215 aa  83.2  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  38.46 
 
 		 230 aa  82.8  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2675  CBS:HPP  36.84 
 
 		 379 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0490  signal transduction protein  31.13 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.630311  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3404  signal transduction protein  35.38 
 
 		 212 aa  81.3  0.000000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.843193  normal  0.543078 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1524  signal transduction protein  34.62 
 
 		 212 aa  79.7  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0592801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  36.36 
 
 		 214 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  33.86 
 
 		 225 aa  78.2  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1700  acetoin utilization protein AcuB, putative  33.09 
 
 		 133 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0154068 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  31.54 
 
 		 146 aa  77  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  31.54 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  31.54 
 
 		 146 aa  77.4  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1201  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 		 152 aa  76.6  0.00000000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000963836  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1915  CBS domain-containing protein  31.54 
 
 		 223 aa  77  0.00000000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.451224  unclonable  0.00000680839 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2349  CBS domain-containing protein  31.16 
 
 		 384 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.747363  hitchhiker  0.000220473 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 153 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.28 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1789  CBS domain-containing protein  29.71 
 
 		 385 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228479  normal  0.180957 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  32.58 
 
 		 219 aa  75.9  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  35.34 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2202  CBS domain-containing protein  30.61 
 
 		 152 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000112787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0680  hypothetical protein  31.91 
 
 		 249 aa  75.1  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.480825 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  32.81 
 
 		 153 aa  75.1  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0278  CBS domain containing membrane protein  31.47 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.10697 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  32.06 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51100  HPP domain and CBS domain pair-containing protein  34.78 
 
 		 374 aa  74.7  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.299574  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  31.39 
 
 		 256 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3347  CBS domain-containing protein  30.43 
 
 		 384 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.401544  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  31.15 
 
 		 145 aa  74.3  0.0000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1949  CBS domain-containing protein  31.16 
 
 		 384 aa  74.3  0.0000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.429977  normal  0.0328188 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  27.34 
 
 		 155 aa  73.9  0.0000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6220  signal-transduction protein  33.09 
 
 		 230 aa  73.9  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2668  CBS domain containing membrane protein  31.25 
 
 		 277 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.204246  normal  0.569108 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  29.23 
 
 		 166 aa  72.8  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  30.71 
 
 		 143 aa  73.2  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0381  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 688 aa  73.2  0.000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0243844 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  32.03 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1887  CBS domain containing membrane protein  29.03 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278261  normal  0.114824 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  34.11 
 
 		 214 aa  72  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  34.59 
 
 		 216 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0317  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 		 394 aa  72.4  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  30.94 
 
 		 215 aa  72.4  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1889  signal transduction protein  30.52 
 
 		 152 aa  71.6  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  32.28 
 
 		 262 aa  71.6  0.000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0583  CBS domain-containing protein  33.33 
 
 		 376 aa  72  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0461407  normal  0.660708 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  31.65 
 
 		 215 aa  72  0.000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 		 280 aa  71.6  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1703  CBS domain containing membrane protein  29.93 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.311156  normal  0.0624027 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1341  CBS domain-containing protein  29.33 
 
 		 154 aa  71.2  0.000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0631  CBS domain-containing protein  33.06 
 
 		 139 aa  71.2  0.000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.480891  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0937  putative signal transduction protein with CBS domains  28.57 
 
 		 214 aa  70.9  0.000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000079186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2076  signal-transduction protein  32.31 
 
 		 202 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.250965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1059  CBS domain-containing protein  30.53 
 
 		 143 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  32.28 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2208  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 221 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000650498  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 		 216 aa  70.5  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1863  putative signal transduction protein with CBS domains  29.03 
 
 		 141 aa  70.5  0.000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  30 
 
 		 281 aa  70.5  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  29.13 
 
 		 142 aa  70.5  0.000000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3522  CBS domain-containing protein  29.01 
 
 		 134 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  29.77 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0779  putative signal transduction protein with CBS domains  35.71 
 
 		 272 aa  70.1  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  hitchhiker  0.00720502 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1697  CBS domain-containing protein  29.37 
 
 		 615 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1916  CBS domain containing membrane protein  30.71 
 
 		 219 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.683041  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  32.81 
 
 		 142 aa  69.3  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1253  CBS domain-containing protein  31.91 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.515572 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0872  CBS domain protein  33.06 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000193325  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  30 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  29.23 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  30.61 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1055  CBS domain-containing protein  30.53 
 
 		 143 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.53863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1289  signal transduction protein  28.08 
 
 		 153 aa  69.7  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5583  CBS domain-containing protein  31.43 
 
 		 392 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.849861  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  29.77 
 
 		 368 aa  69.3  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2402  CBS domain-containing protein  35.51 
 
 		 449 aa  68.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1237  acetoin utilization protein AcuB, putative  30.95 
 
 		 143 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2002  hypothetical protein  27.52 
 
 		 154 aa  69.3  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.584772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3316  CBS domain-containing protein  30.08 
 
 		 144 aa  68.9  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  30.37 
 
 		 211 aa  69.3  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5888  CBS domain-containing protein  28.57 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.361711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0776  CBS domain protein  31.45 
 
 		 139 aa  69.3  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00143526  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3355  CBS domain-containing protein  26.52 
 
 		 134 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4559  CBS domain protein  31.45 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000024778  normal  0.1618 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0673  signal-transduction protein  30 
 
 		 165 aa  68.6  0.00000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0636  signal-transduction protein  31.45 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00478917  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1851  CBS domain-containing protein  28.68 
 
 		 120 aa  68.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0947  CBS domain-containing protein  31.58 
 
 		 689 aa  68.2  0.00000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  29.23 
 
 		 143 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0675  signal transduction protein  30.2 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.302021  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 		 873 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  30 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  30.71 
 
 		 382 aa  67.8  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0031  CBS domain containing membrane protein  31.43 
 
 		 382 aa  68.2  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.668358 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  30 
 
 		 143 aa  67.8  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>