More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2925 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 139 aa  283  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  68.35 
 
 		 141 aa  202  9e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  67.63 
 
 		 141 aa  202  9e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  67.63 
 
 		 141 aa  202  9e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  67.63 
 
 		 141 aa  202  9e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  68.35 
 
 		 141 aa  202  9e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  67.63 
 
 		 142 aa  202  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  68.35 
 
 		 141 aa  202  1e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  68.35 
 
 		 141 aa  202  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  68.61 
 
 		 141 aa  201  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  66.19 
 
 		 172 aa  200  5e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  67.63 
 
 		 142 aa  194  2.0000000000000003e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  67.15 
 
 		 140 aa  192  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  67.15 
 
 		 139 aa  191  3e-48  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0831  CBS domain-containing protein  65.47 
 
 		 139 aa  190  5e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  32.85 
 
 		 140 aa  91.3  4e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  31.39 
 
 		 154 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  34.31 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  35.56 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  33.58 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  32.85 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  32.33 
 
 		 166 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  34.31 
 
 		 153 aa  67.8  0.00000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2494  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 		 427 aa  67  0.00000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00627763  normal  0.157221 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  34.31 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  33.59 
 
 		 210 aa  65.5  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  33.09 
 
 		 169 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3300  CBS domain containing protein  30.43 
 
 		 216 aa  63.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.490249  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004370  putative acetoin utilization protein AcuB  30.71 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0947  CBS domain containing protein  29.71 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0017149 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  32.33 
 
 		 225 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  27.94 
 
 		 373 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  32.09 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  32.09 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  32.09 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0383  putative signal transduction protein with CBS domains  28.17 
 
 		 149 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0412615  normal  0.799719 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  29.63 
 
 		 147 aa  58.5  0.00000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01043  hypothetical protein  28.68 
 
 		 154 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 153 aa  58.2  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1435  CBS domain containing protein  29.23 
 
 		 427 aa  58.2  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  31.54 
 
 		 500 aa  57.8  0.00000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0714  signal transduction protein  29.01 
 
 		 211 aa  57.8  0.00000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.135984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 216 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  34.62 
 
 		 279 aa  57  0.00000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  25.74 
 
 		 133 aa  56.6  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  27.69 
 
 		 307 aa  56.2  0.0000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  31.16 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  29.71 
 
 		 154 aa  55.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1760  CBS domain containing membrane protein  28.47 
 
 		 376 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.621716  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0890  CBS domain-containing protein  27.97 
 
 		 383 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421594 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2097  CBS domain containing protein  31.88 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  31.85 
 
 		 286 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  29.2 
 
 		 256 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  30.83 
 
 		 225 aa  54.7  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0521  glycine betaine/carnitine/choline transport ATP-binding protein  25 
 
 		 378 aa  53.9  0.0000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.691197  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  29.29 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  27.27 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1136  signal transduction protein  32.17 
 
 		 214 aa  53.9  0.0000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0498  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 		 279 aa  53.5  0.0000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.235797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2057  putative signal transduction protein with CBS domains  27.48 
 
 		 134 aa  53.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1342  putative acetoin utilization protein AcuB  27.21 
 
 		 149 aa  53.5  0.0000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1395  HPP family protein  25.74 
 
 		 416 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.877198  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  27.07 
 
 		 215 aa  53.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  28.46 
 
 		 488 aa  53.1  0.000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0537  glycine betaine/L-proline transport, ATP-binding protein  25 
 
 		 378 aa  53.1  0.000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.418471  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1097  hypothetical protein  27.01 
 
 		 222 aa  53.1  0.000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  28.46 
 
 		 503 aa  53.5  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  27.41 
 
 		 281 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2667  CBS domain containing protein  28.87 
 
 		 313 aa  53.1  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.13324  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 		 279 aa  52.4  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4814  CBS domain containing membrane protein  27.97 
 
 		 226 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.107222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  29.77 
 
 		 867 aa  52.4  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  27.69 
 
 		 579 aa  52.8  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0339  CBS domain-containing protein  32.06 
 
 		 279 aa  52  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.436853  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4929  CBS domain containing protein  27.59 
 
 		 153 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.076883 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  27.78 
 
 		 487 aa  52.4  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0130  hypothetical protein  30.83 
 
 		 378 aa  52  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  28.24 
 
 		 502 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0935  CBS domain-containing protein  38.57 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.872585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  25.53 
 
 		 223 aa  50.8  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0026  CBS domain containing membrane protein  31.82 
 
 		 382 aa  51.2  0.000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  27.48 
 
 		 132 aa  51.2  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0991  CBS domain-containing protein  27.61 
 
 		 196 aa  50.8  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  26.15 
 
 		 513 aa  50.8  0.000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  27.15 
 
 		 152 aa  50.8  0.000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  30.88 
 
 		 208 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4395  CBS  26.15 
 
 		 164 aa  50.4  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0203487  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1004  CBS domain-containing protein  27.7 
 
 		 149 aa  50.4  0.000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00024412  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0462  acetoin utilization protein AcuB  27.56 
 
 		 214 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000917116 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  27.56 
 
 		 214 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  26.15 
 
 		 490 aa  50.4  0.000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  27.41 
 
 		 211 aa  50.4  0.000008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  20.74 
 
 		 139 aa  50.4  0.000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0615  protein of unknown function DUF190  25.55 
 
 		 426 aa  50.1  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  29.63 
 
 		 286 aa  50.4  0.000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  27.69 
 
 		 217 aa  49.7  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1922  CBS domain containing membrane protein  28.06 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0178  CBS domain-containing protein  27.08 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>