More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_0805 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 172 aa  354  3.9999999999999996e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3313  CBS domain-containing protein  95.74 
 
 		 141 aa  280  9e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0640  CBS domain-containing protein  95.74 
 
 		 141 aa  280  9e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3483  CBS domain-containing protein  95.74 
 
 		 141 aa  280  9e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3185  CBS domain-containing protein  87.23 
 
 		 142 aa  256  1e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3778  CBS domain-containing protein  85.82 
 
 		 141 aa  254  3e-67  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0650  CBS domain-containing protein  85.82 
 
 		 141 aa  254  3e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3588  CBS domain containing membrane protein  85.82 
 
 		 141 aa  254  3e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3655  CBS domain-containing protein  85.82 
 
 		 141 aa  254  5e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3288  CBS domain-containing protein  75.91 
 
 		 142 aa  216  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0997819  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3135  CBS domain-containing protein  72.86 
 
 		 141 aa  212  1.9999999999999998e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0694667  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0831  CBS domain-containing protein  66.19 
 
 		 139 aa  203  9e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0958  CBS domain-containing protein  68.57 
 
 		 140 aa  202  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0909  CBS domain-containing protein  69.57 
 
 		 139 aa  201  4e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468924 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2925  CBS domain-containing protein  66.19 
 
 		 139 aa  200  8e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00660702  normal  0.275882 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4003  CBS domain-containing protein  36.5 
 
 		 140 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.360398 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1312  signal transduction protein  33.1 
 
 		 142 aa  89  3e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.000000202163  decreased coverage  0.000166712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2078  CBS  33.58 
 
 		 142 aa  88.2  5e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000000050024  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0268  hypothetical protein  34.19 
 
 		 169 aa  84.7  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00882605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2437  signal transduction protein  28.57 
 
 		 166 aa  80.9  0.000000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.188385 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0413  putative signal transduction protein with CBS domains  31.16 
 
 		 142 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0401079 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2437  hypothetical protein  34.78 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1126  putative signal transduction protein with CBS domains  31.39 
 
 		 143 aa  78.6  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1923  CBS domain containing protein  29.93 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  33.83 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2529  CBS domain containing protein  29.85 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.48063  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2625  CBS domain containing protein  29.85 
 
 		 146 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1330  signal transduction protein  29.85 
 
 		 146 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3778  CBS domain-containing protein  33.08 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.857066  normal  0.425445 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2958  putative signal transduction protein with CBS domains  30.3 
 
 		 217 aa  65.9  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.330392  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  32.09 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0917  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 		 162 aa  65.5  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848141 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2632  CBS domain containing protein  30.94 
 
 		 153 aa  65.1  0.0000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.231798  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2648  CBS domain containing membrane protein  31.58 
 
 		 154 aa  65.1  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  30.71 
 
 		 873 aa  64.7  0.0000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  31.54 
 
 		 500 aa  64.3  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  30.23 
 
 		 216 aa  63.5  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1450  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 		 144 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1323  XRE family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.805809  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3779  CBS domain-containing protein  29.85 
 
 		 162 aa  63.2  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.458118  normal  0.116222 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  22.86 
 
 		 139 aa  63.2  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2536  CBS domain containing protein  30.94 
 
 		 153 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.55636  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0692  CBS domain-containing protein  28.89 
 
 		 636 aa  62  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2623  CBS domain containing protein  29.29 
 
 		 215 aa  61.2  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  27.21 
 
 		 488 aa  61.2  0.000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6174  CBS domain containing membrane protein  27.15 
 
 		 246 aa  61.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  26.67 
 
 		 491 aa  60.8  0.000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  29.75 
 
 		 490 aa  60.8  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  26.8 
 
 		 503 aa  60.8  0.000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3995  CBS domain-containing protein  26.92 
 
 		 133 aa  61.2  0.000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3348  CBS domain-containing protein  29.29 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  28.46 
 
 		 211 aa  60.8  0.000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1614  CBS domain containing membrane protein  31.3 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.267585  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1158  CBS domain containing protein  29.29 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3209  CBS domain-containing protein  29.29 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.549448  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3209  CBS domain-containing protein  29.29 
 
 		 143 aa  60.8  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  27.54 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2811  CBS domain-containing protein  29.29 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  30.15 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6852  putative signal transduction protein with CBS domains  28.47 
 
 		 141 aa  60.8  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  31.21 
 
 		 138 aa  60.1  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1780  putative signal transduction protein with CBS domains  30.23 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2451  CBS domain containing membrane protein  29.55 
 
 		 141 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000150568  normal  0.0113314 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1695  signal transduction protein  24.29 
 
 		 281 aa  58.9  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000133254 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  31.78 
 
 		 877 aa  59.3  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  30.3 
 
 		 211 aa  58.9  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1654  CBS domain containing protein  26.06 
 
 		 890 aa  58.9  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.873652 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1434  CBS domain containing protein  26.52 
 
 		 147 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0566  CBS domain-containing protein  32.31 
 
 		 279 aa  58.9  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.565144  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  27.74 
 
 		 256 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1529  CBS domain containing protein  26.52 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0765916  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  26.32 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3698  CBS domain-containing protein  31.25 
 
 		 202 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.701418 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0937  CBS domain-containing protein  26.28 
 
 		 232 aa  58.2  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.447969  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3337  CBS domain-containing protein  27.56 
 
 		 214 aa  57.8  0.00000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.126622  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2429  signal transduction protein  26.52 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0027  CBS domain containing protein  29.1 
 
 		 210 aa  57.8  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.63793  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  28.76 
 
 		 605 aa  57.8  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4486  CBS domain-containing protein  23.49 
 
 		 373 aa  57.4  0.00000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.16132  normal  0.433507 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0552  putative signal transduction protein with CBS domains  30.37 
 
 		 250 aa  57.4  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.168262  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2342  CBS domain-containing protein  27.66 
 
 		 145 aa  57  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  30.77 
 
 		 500 aa  57  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1567  CBS domain-containing protein  24.29 
 
 		 280 aa  57  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  unclonable  0.0000000000000154873 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  27.61 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3652  CBS domain containing protein  29.23 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3706  CBS domain containing protein  29.23 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.312715  normal  0.158217 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2015  CBS domain containing membrane protein  24.84 
 
 		 368 aa  57  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00292892  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4803  acetoin utilization protein AcuB  26.77 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4562  acetoin utilization protein AcuB  26.77 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4396  acetoin utilization protein  26.77 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4413  acetoin utilization protein  26.77 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4782  acetoin utilization protein AcuB  26.77 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4495  CBS domain-containing protein  26.77 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4799  acetoin utilization protein AcuB  26.77 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2521  signal transduction protein  25.76 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2848  CBS domain containing membrane protein  25.53 
 
 		 223 aa  56.2  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01043  hypothetical protein  28.68 
 
 		 154 aa  56.6  0.0000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4777  acetoin utilization protein AcuB  26.77 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  24.43 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1447  Cl- channel voltage-gated family protein  28.03 
 
 		 598 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000054528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>