More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2085 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  100 
 
 
500 aa  1031    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  67.94 
 
 
500 aa  717    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  59.96 
 
 
503 aa  644    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  56.4 
 
 
502 aa  590  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  54.4 
 
 
502 aa  586  1e-166  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  55.13 
 
 
502 aa  570  1e-161  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  53.63 
 
 
503 aa  566  1e-160  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  51.9 
 
 
502 aa  567  1e-160  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  52.16 
 
 
513 aa  541  1e-153  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  51.96 
 
 
513 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  51.37 
 
 
513 aa  535  1e-151  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  50.2 
 
 
513 aa  529  1e-149  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  50.29 
 
 
511 aa  526  1e-148  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  53.54 
 
 
412 aa  396  1e-109  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  51.45 
 
 
403 aa  390  1e-107  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  53.58 
 
 
407 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  50.52 
 
 
423 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  50.13 
 
 
406 aa  383  1e-105  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  51.05 
 
 
399 aa  384  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  51.43 
 
 
390 aa  385  1e-105  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  50.13 
 
 
390 aa  383  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  50.26 
 
 
455 aa  370  1e-101  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  49.87 
 
 
421 aa  365  1e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  50.13 
 
 
434 aa  365  1e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  47.79 
 
 
390 aa  363  4e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  46.65 
 
 
408 aa  359  6e-98  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  47.5 
 
 
408 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  45.22 
 
 
388 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  48.56 
 
 
408 aa  354  2e-96  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  49.21 
 
 
405 aa  351  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  46.13 
 
 
438 aa  350  3e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  45.67 
 
 
389 aa  342  1e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  44.5 
 
 
384 aa  339  5.9999999999999996e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  42.39 
 
 
403 aa  339  8e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  42.37 
 
 
390 aa  336  5e-91  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  42.71 
 
 
404 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  42.71 
 
 
404 aa  327  3e-88  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  44.03 
 
 
389 aa  327  3e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  29.94 
 
 
418 aa  134  3e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  31.58 
 
 
413 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  30.46 
 
 
414 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  28 
 
 
427 aa  123  6e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  29.14 
 
 
405 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  30.07 
 
 
438 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0798  homoserine O-acetyltransferase  44.07 
 
 
488 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2043  homoserine O-acetyltransferase  45.45 
 
 
491 aa  111  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  26.81 
 
 
408 aa  110  6e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  25.93 
 
 
410 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1161  homoserine O-acetyltransferase  43.33 
 
 
496 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.985258  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  28.57 
 
 
388 aa  103  7e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  28.26 
 
 
388 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  28.26 
 
 
388 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  27.47 
 
 
388 aa  100  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2201  homoserine O-acetyltransferase  40.34 
 
 
490 aa  100  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0429253  normal  0.79235 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1207  homoserine O-acetyltransferase  40.5 
 
 
490 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0144114  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0545  homoserine O-acetyltransferase  36.84 
 
 
487 aa  88.2  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.419548  normal  0.193935 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2428  homoserine O-acetyltransferase  33.88 
 
 
579 aa  87  8e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71707  normal  0.191879 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0172  homoserine O-acetyltransferase  32.5 
 
 
492 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00940  CBS domain containing protein  35.09 
 
 
262 aa  70.5  0.00000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000126291  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0113  CBS domain containing protein  35.71 
 
 
216 aa  67  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1605  CBS domain-containing protein  31.85 
 
 
215 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1671  CBS domain-containing protein  31.85 
 
 
215 aa  66.2  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0962  putative signal transduction protein with CBS domains  33.88 
 
 
208 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.55358  normal  0.0758366 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0640  CBS domain-containing protein  30.56 
 
 
150 aa  63.9  0.000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0497  signal-transduction protein  34.17 
 
 
186 aa  62.8  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.835525  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  33.06 
 
 
862 aa  62  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2520  putative signal transduction protein with CBS domains  30.08 
 
 
143 aa  62.4  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1812  CBS domain containing membrane protein  30.33 
 
 
132 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0535  CBS domain-containing protein  26.62 
 
 
256 aa  62.4  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.483194 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0340  signal-transduction protein  32.5 
 
 
186 aa  61.2  0.00000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.189053  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1386  CBS domain-containing protein  27.86 
 
 
211 aa  61.2  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1497  CBS domain containing protein  34.75 
 
 
845 aa  60.8  0.00000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1422  signal-transduction protein  33.33 
 
 
186 aa  60.5  0.00000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.216584  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1013  CBS domain-containing protein  29.92 
 
 
216 aa  59.7  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1231  CBS domain-containing protein  25.78 
 
 
137 aa  58.9  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.022182  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1962  CBS domain-containing protein  32.26 
 
 
136 aa  58.9  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.946  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3209  putative signal transduction protein with CBS domains  30.25 
 
 
136 aa  59.3  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24850  CBS domain pair-containing protein  32.48 
 
 
137 aa  58.2  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.310967  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  27.73 
 
 
300 aa  58.5  0.0000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.548765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2229  CBS domain-containing protein  29.75 
 
 
313 aa  58.5  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0309  CBS domain-containing protein  32.82 
 
 
230 aa  58.5  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.349467  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1138  inosine-5'-monophosphate dehydrogenase  31.2 
 
 
500 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0990  acetoin utilization protein AcuB, putative  28.69 
 
 
140 aa  58.5  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0765  CBS  30.53 
 
 
224 aa  58.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4941  CBS domain containing protein  31.75 
 
 
208 aa  57.8  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0382465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1387  CBS domain containing protein  33.04 
 
 
148 aa  57.4  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0805  CBS domain-containing protein  30.77 
 
 
172 aa  57  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02666  CBS domain containing membrane protein  24.81 
 
 
139 aa  57.4  0.0000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0576  putative signal transduction protein with CBS domains  25.34 
 
 
152 aa  57  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.134096  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  36.22 
 
 
877 aa  57  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  33.05 
 
 
867 aa  56.6  0.0000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1332  signal-transduction protein  26.87 
 
 
139 aa  56.6  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.660277  normal  0.443449 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  26.15 
 
 
295 aa  56.2  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1915  signal-transduction protein  32.52 
 
 
144 aa  56.2  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.414103  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0833  CBS domain-containing protein  31.5 
 
 
211 aa  56.2  0.000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2240  signal transduction protein  25.17 
 
 
153 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0264  CBS domain-containing protein  27.59 
 
 
153 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1987  CBS domain-containing protein  27.83 
 
 
262 aa  56.6  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2057  putative signal transduction protein with CBS domains  31.58 
 
 
134 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0503  signal transduction protein  25 
 
 
137 aa  55.8  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>