50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0430 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  100 
 
 
390 aa  808    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  75.84 
 
 
421 aa  645    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  87.69 
 
 
390 aa  738    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  70.62 
 
 
390 aa  585  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  69.35 
 
 
388 aa  575  1.0000000000000001e-163  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  60.16 
 
 
403 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  58.9 
 
 
407 aa  449  1e-125  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  56.88 
 
 
412 aa  438  9.999999999999999e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  58.59 
 
 
408 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  56.99 
 
 
399 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  54.38 
 
 
423 aa  426  1e-118  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  56.25 
 
 
408 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  56.51 
 
 
408 aa  424  1e-117  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  57.18 
 
 
405 aa  418  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  54.45 
 
 
406 aa  414  1e-114  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  50.13 
 
 
500 aa  383  1e-105  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  50.91 
 
 
500 aa  381  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  51.13 
 
 
513 aa  375  1e-102  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  49.87 
 
 
513 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  48.32 
 
 
503 aa  366  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  47.62 
 
 
511 aa  363  2e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  49.12 
 
 
513 aa  362  6e-99  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  48.61 
 
 
513 aa  358  8e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  49.47 
 
 
502 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  47.91 
 
 
438 aa  351  1e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  49.22 
 
 
502 aa  348  8e-95  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  46.63 
 
 
389 aa  345  6e-94  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  47.63 
 
 
502 aa  344  2e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  47.01 
 
 
384 aa  340  2.9999999999999998e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  46.72 
 
 
455 aa  338  9.999999999999999e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  47.56 
 
 
502 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  45.8 
 
 
403 aa  334  2e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  45.03 
 
 
503 aa  328  7e-89  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  44.59 
 
 
389 aa  327  2.0000000000000001e-88  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  44.05 
 
 
404 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  44.3 
 
 
404 aa  322  5e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  44.56 
 
 
390 aa  320  1.9999999999999998e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  44.62 
 
 
434 aa  311  9e-84  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  33.02 
 
 
413 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  33.23 
 
 
414 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  29.28 
 
 
405 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  30.56 
 
 
418 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  31 
 
 
438 aa  130  6e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  26.56 
 
 
427 aa  124  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  31.5 
 
 
408 aa  120  6e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  27.18 
 
 
410 aa  97.1  5e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  28.48 
 
 
388 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  27.39 
 
 
388 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  27.69 
 
 
388 aa  86.7  7e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  25.84 
 
 
388 aa  79.3  0.00000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>