50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3007 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  75.84 
 
 		 390 aa  645    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  100 
 
 		 421 aa  875    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  77.38 
 
 		 390 aa  654    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  68.05 
 
 		 388 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  68.23 
 
 		 390 aa  558  1e-158  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  60.32 
 
 		 403 aa  453  1.0000000000000001e-126  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  56.81 
 
 		 407 aa  428  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  53.39 
 
 		 412 aa  425  1e-118  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  53.81 
 
 		 399 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  53.28 
 
 		 406 aa  406  1.0000000000000001e-112  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  51.18 
 
 		 423 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  53.12 
 
 		 408 aa  401  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  54.69 
 
 		 405 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  52.34 
 
 		 408 aa  397  1e-109  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  51.04 
 
 		 408 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  49.87 
 
 		 500 aa  365  1e-99  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  48.99 
 
 		 513 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  47.24 
 
 		 513 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  50.26 
 
 		 500 aa  356  5e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  47.49 
 
 		 513 aa  355  8.999999999999999e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  46.72 
 
 		 511 aa  353  4e-96  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  47.24 
 
 		 513 aa  349  6e-95  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  46.79 
 
 		 503 aa  342  1e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  48.31 
 
 		 502 aa  340  2.9999999999999998e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  46.07 
 
 		 455 aa  333  3e-90  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  46.61 
 
 		 438 aa  332  6e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  47.27 
 
 		 502 aa  330  2e-89  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  46.05 
 
 		 389 aa  325  8.000000000000001e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  44.9 
 
 		 403 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  45.09 
 
 		 384 aa  312  7.999999999999999e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  43.81 
 
 		 502 aa  311  1e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  44.65 
 
 		 389 aa  309  5e-83  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  45.6 
 
 		 502 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  44.44 
 
 		 503 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  43.5 
 
 		 434 aa  301  1e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  42.82 
 
 		 390 aa  300  2e-80  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  43.15 
 
 		 404 aa  301  2e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  43.15 
 
 		 404 aa  300  4e-80  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  33.54 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  32.62 
 
 		 418 aa  137  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  32.3 
 
 		 414 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  30.37 
 
 		 405 aa  127  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  32.93 
 
 		 408 aa  124  4e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  29.62 
 
 		 438 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  27.81 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  26.97 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  26.82 
 
 		 388 aa  80.5  0.00000000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  23.78 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  27.09 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  25.83 
 
 		 388 aa  73.9  0.000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>