54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1625 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  847    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  54.35 
 
 
427 aa  473  1e-132  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  51.89 
 
 
438 aa  437  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  46.99 
 
 
414 aa  376  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  49.63 
 
 
413 aa  365  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  45.59 
 
 
405 aa  350  3e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  42.82 
 
 
408 aa  323  5e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  38.63 
 
 
410 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  39.6 
 
 
388 aa  282  7.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  38.65 
 
 
388 aa  281  1e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  39.45 
 
 
388 aa  280  5e-74  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  39.21 
 
 
388 aa  277  3e-73  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  33.44 
 
 
502 aa  150  4e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  33.85 
 
 
406 aa  149  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  33.94 
 
 
502 aa  146  8.000000000000001e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  32.91 
 
 
412 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  32.21 
 
 
503 aa  143  6e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  33.44 
 
 
503 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  31.73 
 
 
513 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  29.07 
 
 
511 aa  141  3e-32  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  32.17 
 
 
500 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  29.55 
 
 
513 aa  139  7e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  32.26 
 
 
403 aa  137  5e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  32.62 
 
 
421 aa  137  5e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  32.42 
 
 
502 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  30.38 
 
 
513 aa  136  8e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  29.75 
 
 
407 aa  135  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  29.94 
 
 
500 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  30.46 
 
 
388 aa  132  7.999999999999999e-30  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  30.56 
 
 
390 aa  132  9e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  30.96 
 
 
399 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  29.01 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  30.55 
 
 
513 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  33.64 
 
 
502 aa  129  6e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  29.78 
 
 
423 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  29.01 
 
 
390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  32.3 
 
 
405 aa  123  5e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  29.46 
 
 
389 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  28.01 
 
 
434 aa  121  3e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  29.91 
 
 
438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  26.93 
 
 
408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  27.55 
 
 
408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  27.93 
 
 
384 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  27.95 
 
 
404 aa  117  5e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  28 
 
 
404 aa  116  6e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  28.75 
 
 
455 aa  116  6.9999999999999995e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  27.92 
 
 
408 aa  114  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  29.49 
 
 
390 aa  113  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  27.76 
 
 
389 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  26.59 
 
 
403 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1389  indolepyruvate ferredoxin oxidoreductase, alpha subunit  52.38 
 
 
598 aa  54.3  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000343744  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27500  indolepyruvate ferredoxin oxidreductase, alpha/beta subunit  44.19 
 
 
637 aa  43.1  0.008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2080  respiratory-chain NADH dehydrogenase domain-containing protein  32.5 
 
 
635 aa  43.5  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310665  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  34.69 
 
 
642 aa  43.1  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>