58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1067 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  91.75 
 
 
388 aa  751    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  77.98 
 
 
388 aa  644    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  100 
 
 
388 aa  794    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  93.3 
 
 
388 aa  753    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  67.59 
 
 
410 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  39.7 
 
 
405 aa  295  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  39.8 
 
 
414 aa  292  8e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  39.51 
 
 
427 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  39.24 
 
 
413 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  40.49 
 
 
438 aa  281  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  39.45 
 
 
418 aa  280  5e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  39.45 
 
 
408 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  32.11 
 
 
511 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  29.18 
 
 
503 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  31.54 
 
 
502 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  32.07 
 
 
513 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  31.85 
 
 
513 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  30.26 
 
 
503 aa  107  3e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  30.42 
 
 
502 aa  107  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  31.94 
 
 
502 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  30.42 
 
 
513 aa  104  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  28.57 
 
 
500 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  30.31 
 
 
513 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  28.62 
 
 
500 aa  98.2  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  27.87 
 
 
412 aa  90.9  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  25.53 
 
 
502 aa  89  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  27.39 
 
 
390 aa  88.2  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  26.4 
 
 
390 aa  87.4  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  27.24 
 
 
388 aa  85.1  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  29.28 
 
 
407 aa  81.3  0.00000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  26.82 
 
 
403 aa  80.5  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  24.75 
 
 
390 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  26.82 
 
 
421 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  23.55 
 
 
389 aa  75.1  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  24.16 
 
 
455 aa  75.5  0.000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  26.35 
 
 
434 aa  74.3  0.000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  24.5 
 
 
423 aa  73.2  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  23.69 
 
 
406 aa  73.2  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  24.57 
 
 
389 aa  72  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  25.08 
 
 
384 aa  70.1  0.00000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  25.41 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  26.69 
 
 
403 aa  68.6  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  23.67 
 
 
438 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  25.48 
 
 
408 aa  62.4  0.00000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  24.84 
 
 
404 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  24.28 
 
 
404 aa  62.4  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  24.11 
 
 
405 aa  62  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  25.49 
 
 
408 aa  62  0.00000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  24.86 
 
 
408 aa  59.7  0.00000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  22.18 
 
 
390 aa  54.3  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1546  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  23.97 
 
 
377 aa  46.6  0.0008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0841  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.17 
 
 
203 aa  46.2  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0586369  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0382  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.94 
 
 
162 aa  45.4  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.248119  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0301  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40 
 
 
858 aa  44.7  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1717  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  29.17 
 
 
369 aa  43.9  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.682287  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2148  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.38 
 
 
508 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0538  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.29 
 
 
284 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0224  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  34.21 
 
 
367 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.581044  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>