50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_1441 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  100 
 
 
412 aa  844    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  62.37 
 
 
399 aa  516  1.0000000000000001e-145  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  59.6 
 
 
423 aa  511  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  63.68 
 
 
407 aa  506  9.999999999999999e-143  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  62.41 
 
 
405 aa  501  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  59.55 
 
 
406 aa  500  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  61.2 
 
 
403 aa  498  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  58.29 
 
 
408 aa  486  1e-136  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  57.79 
 
 
408 aa  482  1e-135  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  56.72 
 
 
408 aa  476  1e-133  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  56.62 
 
 
390 aa  443  1e-123  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  56.88 
 
 
390 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  55.09 
 
 
390 aa  436  1e-121  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  53.85 
 
 
388 aa  427  1e-118  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  53.39 
 
 
421 aa  425  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  53.54 
 
 
500 aa  396  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  53.67 
 
 
513 aa  385  1e-106  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  51.19 
 
 
455 aa  383  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  52.91 
 
 
513 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  50.66 
 
 
389 aa  382  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  48.72 
 
 
438 aa  378  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  48.48 
 
 
403 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  50.52 
 
 
500 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  51.14 
 
 
513 aa  372  1e-102  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  48.12 
 
 
390 aa  374  1e-102  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  46.72 
 
 
404 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  46.72 
 
 
404 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  50.53 
 
 
502 aa  369  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  48.95 
 
 
384 aa  371  1e-101  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  50.66 
 
 
502 aa  366  1e-100  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  49.34 
 
 
502 aa  364  1e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  48.03 
 
 
389 aa  363  4e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  50.9 
 
 
513 aa  361  1e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  47.36 
 
 
503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  49.87 
 
 
511 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  49.08 
 
 
502 aa  355  7.999999999999999e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  47.3 
 
 
503 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  46.73 
 
 
434 aa  349  4e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  34.58 
 
 
414 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  32.91 
 
 
418 aa  144  3e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  28.93 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  31.23 
 
 
413 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  28.11 
 
 
408 aa  130  6e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  28.32 
 
 
405 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  29.18 
 
 
438 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  28.53 
 
 
410 aa  107  6e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  27.87 
 
 
388 aa  90.9  4e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  27.15 
 
 
388 aa  89.7  8e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  27.21 
 
 
388 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  26.33 
 
 
388 aa  87  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>