99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0733 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_0733  hypothetical protein  100 
 
 		 434 aa  880    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1281  hypothetical protein  58.71 
 
 		 455 aa  517  1.0000000000000001e-145  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0311  hypothetical protein  48.95 
 
 		 500 aa  377  1e-103  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2085  hypothetical protein  50.13 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1432  protein of unknown function DUF39  50.65 
 
 		 406 aa  367  1e-100  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00503858  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0812  protein of unknown function DUF39  45.9 
 
 		 438 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1441  hypothetical protein  46.73 
 
 		 412 aa  358  9e-98  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0664  hypothetical protein  45.26 
 
 		 389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.120949  normal  0.0723029 
 
 
-
 
NC_002936  DET0921  hypothetical protein  49.22 
 
 		 408 aa  354  2e-96  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3565  protein of unknown function DUF39  43.73 
 
 		 404 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0178473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2541  protein of unknown function DUF39  43.99 
 
 		 404 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0101  hypothetical protein  47.24 
 
 		 399 aa  351  1e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.235575  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0732  protein of unknown function DUF39  48.95 
 
 		 407 aa  350  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.855526  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1059  hypothetical protein  46.01 
 
 		 403 aa  350  3e-95  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.224866 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2393  hypothetical protein  45.5 
 
 		 384 aa  350  4e-95  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0805  hypothetical protein  49.22 
 
 		 408 aa  349  5e-95  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_792  hypothetical protein  47.15 
 
 		 408 aa  346  5e-94  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0414  hypothetical protein  42.75 
 
 		 390 aa  346  6e-94  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1272  hypothetical protein  47.9 
 
 		 502 aa  343  4e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573905  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3584  protein of unknown function DUF39  46.21 
 
 		 423 aa  342  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00707173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0451  hypothetical protein  47.23 
 
 		 502 aa  341  1e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2809  hypothetical protein  44.47 
 
 		 389 aa  342  1e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0777077  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1290  protein of unknown function DUF39  45.51 
 
 		 502 aa  339  5.9999999999999996e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0616948  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0019  hypothetical protein  46.17 
 
 		 503 aa  338  8e-92  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5211  protein of unknown function DUF39  42.28 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000734482 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0669  hypothetical protein  44.05 
 
 		 513 aa  331  1e-89  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0793  hypothetical protein  45.14 
 
 		 511 aa  328  9e-89  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.455242  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0911  hypothetical protein  46.11 
 
 		 405 aa  325  8.000000000000001e-88  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00849288  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0604  hypothetical protein  43.8 
 
 		 513 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.940155 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0219  hypothetical protein  43.54 
 
 		 513 aa  322  7e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.434471  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2469  protein of unknown function DUF39  45.48 
 
 		 388 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000655672  hitchhiker  0.000229248 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3098  protein of unknown function DUF39  46.32 
 
 		 390 aa  321  9.999999999999999e-87  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0613038  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0430  hypothetical protein  44.62 
 
 		 390 aa  321  1.9999999999999998e-86  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.943897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1517  hypothetical protein  42.67 
 
 		 502 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.743674  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1464  protein of unknown function DUF39  43.83 
 
 		 390 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.552169 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1314  hypothetical protein  43.54 
 
 		 513 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0138  hypothetical protein  40.9 
 
 		 503 aa  315  9e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3007  hypothetical protein  43.5 
 
 		 421 aa  310  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1625  hypothetical protein  28.01 
 
 		 418 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2735  methanogenesis marker 16 metalloprotein  27.78 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1460  hypothetical protein  26.32 
 
 		 427 aa  98.6  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.194077  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3546  hypothetical protein  23.84 
 
 		 438 aa  94.4  4e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0943235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0110  hypothetical protein  26.06 
 
 		 413 aa  93.6  7e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.31254  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2978  hypothetical protein  28.67 
 
 		 405 aa  92.8  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0914  hypothetical protein  27.84 
 
 		 388 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1067  methanogenesis marker 16 metalloprotein  26.35 
 
 		 388 aa  74.3  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0245608  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0502  pseudouridylate synthase subunit TruB  25.89 
 
 		 408 aa  73.6  0.000000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1805  hypothetical protein  25.63 
 
 		 388 aa  73.2  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0748579  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0850  hypothetical protein  26.35 
 
 		 388 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.711109  normal  0.0659427 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1368  hypothetical protein  23 
 
 		 410 aa  65.9  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0886  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.98 
 
 		 373 aa  51.2  0.00003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.38221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1505  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  44.68 
 
 		 134 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.47907 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0262  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.67 
 
 		 147 aa  48.1  0.0003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0832222 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0579  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40.82 
 
 		 62 aa  47.8  0.0003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1113  NIL domain protein  41.67 
 
 		 147 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.646686  normal  0.0231239 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2442  ferredoxin (fdxA)  43.18 
 
 		 69 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2757  putative ferredoxin  43.18 
 
 		 56 aa  47.8  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2389  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.79 
 
 		 777 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0483  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  30.65 
 
 		 144 aa  47  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0263  NADH:ubiquinone oxidoreductase, subunit RnfC  32.39 
 
 		 437 aa  45.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1874  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  31.88 
 
 		 362 aa  45.4  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0102  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  48.89 
 
 		 133 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.356069  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2146  iron-sulfur cluster-binding protein  40.43 
 
 		 146 aa  45.1  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.471732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2775  Electron transfer flavoprotein alpha/beta-subunit  48 
 
 		 428 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00380307  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0496  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  25.85 
 
 		 672 aa  45.1  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.747428 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1848  electron transport complex protein RnfC  35.59 
 
 		 793 aa  44.7  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00264282  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0391  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  43.48 
 
 		 296 aa  44.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0830344  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1936  Electron transfer flavoprotein alpha/beta- subunit  39.29 
 
 		 441 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.993938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3341  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site  42.55 
 
 		 134 aa  44.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1785  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  26.39 
 
 		 567 aa  44.7  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0885  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  34.62 
 
 		 267 aa  45.1  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0213138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4079  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  35.29 
 
 		 56 aa  44.3  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000112559  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1236  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40 
 
 		 147 aa  44.3  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.712445  normal  0.0546768 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14300  electron transport complex, RnfABCDGE type, B subunit  41.86 
 
 		 331 aa  43.9  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.06573e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2100  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  38.3 
 
 		 56 aa  43.9  0.005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421595  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1124  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  37.78 
 
 		 57 aa  43.9  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153602  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3017  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  40 
 
 		 57 aa  44.3  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0212727  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2105  ferredoxin  33.33 
 
 		 58 aa  43.9  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2708  ferredoxin family protein  32.65 
 
 		 56 aa  43.9  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0216856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0679  ferredoxin  34.69 
 
 		 57 aa  43.9  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2297  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  39.71 
 
 		 378 aa  43.9  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2170  electron transport complex protein RnfC  33.33 
 
 		 788 aa  43.9  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0332538  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2510  electron transport complex protein RnfC  33.9 
 
 		 790 aa  43.5  0.007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2229  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 56 aa  43.5  0.007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000195937  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1377  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.86 
 
 		 793 aa  43.5  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.118947  normal  0.859258 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1945  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 55 aa  43.5  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1429  dihydropyrimidine dehydrogenase  26.98 
 
 		 444 aa  43.5  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1865  electron transport complex protein RnfC  35.59 
 
 		 731 aa  43.5  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1300  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  34.78 
 
 		 53 aa  43.5  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2066  electron transport complex protein RnfC  33.9 
 
 		 809 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00275367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1909  electron transport complex protein RnfC  33.9 
 
 		 799 aa  43.5  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.567258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0781  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.62 
 
 		 623 aa  43.5  0.008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3208  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.96 
 
 		 55 aa  43.5  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000680801  hitchhiker  0.0000000456636 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1543  electron transport complex, RnfABCDGE type, C subunit  30.51 
 
 		 981 aa  43.5  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0195747 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0585  coenzyme F420 hydrogenase/dehydrogenase beta subunit  37.88 
 
 		 395 aa  43.5  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.00081136  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2278  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  33.33 
 
 		 55 aa  43.5  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124494  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0161  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  31.91 
 
 		 56 aa  43.1  0.009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00612444  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3612  NIL domain-containing protein  43.18 
 
 		 134 aa  43.1  0.009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0684282  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4151  dihydropyrimidine dehydrogenase  30.38 
 
 		 436 aa  43.1  0.01  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>